Introducción
En el mundo de la genómica, en constante evolución, las tecnologías de secuenciación de lectura larga se han convertido en un elemento esencial para descifrar regiones genómicas complejas, variaciones estructurales y transcritos completos. Dos de las plataformas líderes en este ámbito son Oxford Nanopore Technologies (ONT) y Pacific Biosciences (PacBio). Ambas presentan ventajas únicas y están marcando la forma en que los investigadores abordan la secuenciación, pero ¿en qué se diferencian?
¿Qué es la secuenciación de lectura larga?
La secuenciación de lectura larga hace referencia a las tecnologías capaces de leer fragmentos de ADN o ARN de miles o incluso millones de bases de longitud en una sola lectura. Esto permite un mejor ensamblaje del genoma, menos lagunas y una mejor detección de variantes estructurales en comparación con los métodos de lectura corta.
Oxford Nanopore Technologies (ONT)
Cómo funciona
La tecnología ONT utiliza nanoporos integrados en una membrana. A medida que las cadenas de ADN o ARN atraviesan el nanoporo, se miden los cambios en la corriente eléctrica para identificar cada base en tiempo real.
Puntos fuertes clave
- Transmisión de datos en tiempo real
- Dispositivos portátiles (p. ej., MinION)
- Ampliable desde pequeños laboratorios hasta proyectos a escala poblacional
- Lecturas ultralargas (posibilidad de superar 1 Mb)
- Actualizaciones constantes en química y software
Casos de uso
Ideal para la secuenciación sobre el terreno, la detección rápida de patógenos, la metagenómica y proyectos que requieran portabilidad o análisis de datos in situ.
Pacific Biosciences (PacBio)
Cómo funciona
La secuenciación SMRT (Single Molecule Real-Time) de PacBio utiliza guías de onda de modo cero para monitorizar la ADN polimerasa mientras sintetiza nuevo ADN, captando las señales fluorescentes de los nucleótidos marcados.
Puntos fuertes clave
- Alta precisión con lecturas HiFi (Q20+)
- Excelente para la identificación de variantes estructurales
- Amplio apoyo a los ensamblajes de novo
- Mejoras constantes en el rendimiento y la velocidad
Casos de uso
Ideal para ensamblajes genómicos de referencia, transcriptómica, epigenética y aplicaciones que requieran lecturas de alta precisión.
Comparación lado a lado
¿Cuál deberías elegir?
La respuesta depende de los objetivos de tu proyecto:
- Elige Oxford Nanopore si necesitas portabilidad, resultados en tiempo real o lecturas ultralargas.
- Elige PacBio si tu prioridad es una precisión extremadamente alta y la detección de variantes estructurales.
Nuestro servicio de asistencia en Dante Omics AI
En Dante Omics AI, ofrecemos compatibilidad con ambas plataformas y asesoramos a los clientes para que elijan la mejor estrategia de secuenciación adaptada a sus necesidades específicas. Tanto si trabajas con genomas complejos, transcriptómica o estudios a escala poblacional, nuestro equipo de bioinformática garantiza una interpretación precisa y resultados fiables.
Conclusión
Oxford Nanopore y PacBio han revolucionado, cada una a su manera, la secuenciación de lectura larga. Conocer sus respectivas ventajas ayuda a los investigadores y a los médicos a tomar decisiones fundamentadas para sus flujos de trabajo genómicos.
Si necesitas ayuda para elegir la plataforma adecuada o quieres conocer nuestros servicios de secuenciación e interpretación de datos, ponte en contacto con nosotros hoy mismo.
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