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Gen

C16orf96

chromosome 16 open reading frame 96

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
16p13.3
Koordinaten
Chromosom 16: 4.556.340–4.600.758 (GRCh38)
Exons
16 Exons über 44,4 kb
Protein
1.141 Aminosäuren
MANE-Select-Transkript
ENST00000444310.5NM_001145011.2
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet C16orf96 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von C16orf96

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 16, mit einer Klammer, an der C16orf96 liegt. C16orf96 und 28 Gene in der Nähe auf Chromosom 16, von 4.078.549 bis 5.078.548.Chromosom 1616p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.34,2 Mb4,4 Mb4,6 Mb4,8 Mb5 MbADCY9: 3.953.387–4.116.493, Minus-StrangADCY9SRL: 4.189.369–4.242.283, Minus-StrangSRLTFAP4: 4.257.186–4.273.075, Minus-StrangTFAP4GLIS2: 4.314.761–4.339.597, Plus-StrangGLIS2PAM16: 4.330.378–4.355.607, Minus-StrangPAM16CORO7-PAM16: 4.340.251–4.420.494, Minus-StrangCORO7-PAM16CORO7: 4.354.542–4.425.705, Minus-StrangCORO7VASN: 4.371.841–4.383.538, Plus-StrangVASNDNAJA3: 4.425.805–4.460.593, Plus-StrangDNAJA3NMRAL1: 4.461.673–4.495.763, Minus-StrangNMRAL1HMOX2: 4.474.246–4.510.663, Plus-StrangHMOX2CDIP1: 4.510.619–4.538.833, Minus-StrangCDIP1C16orf96: 4.556.340–4.600.758, Plus-StrangC16orf96UBALD1: 4.608.879–4.615.046, Minus-StrangUBALD1MGRN1: 4.616.493–4.690.977, Plus-StrangMGRN1NUDT16L1: 4.693.562–4.695.861, Plus-StrangNUDT16L1ANKS3: 4.696.500–4.734.388, Minus-StrangANKS3DNAAF8: 4.734.315–4.749.396, Plus-StrangDNAAF8ZNF500: 4.748.239–4.767.624, Minus-StrangZNF500SEPTIN12: 4.777.606–4.788.398, Minus-StrangSEPTIN12SMIM22: 4.788.376–4.796.731, Plus-StrangSMIM22ROGDI: 4.796.962–4.802.926, Minus-StrangROGDIGLYR1: 4.803.202–4.847.343, Minus-StrangGLYR1UBN1: 4.846.665–4.882.401, Plus-StrangUBN1PPL: 4.879.449–4.960.741, Minus-StrangPPLSEC14L5: 4.958.290–5.019.157, Plus-StrangSEC14L5NAGPA: 5.024.756–5.034.141, Minus-StrangNAGPAALG1: 5.033.702–5.087.379, Plus-StrangALG1C16orf89: 5.042.772–5.066.167, Minus-StrangC16orf89Diagramm von C16orf96: 16 Exons auf dem Plus-Strang von Chromosom 16Exon 1: 4.556.340–4.556.909, 570 BasenExon 2: 4.571.561–4.571.665, 105 BasenExon 3: 4.574.709–4.574.789, 81 BasenExon 4: 4.574.972–4.575.058, 87 BasenExon 5: 4.575.174–4.576.635, 1.462 BasenExon 6: 4.578.940–4.579.025, 86 BasenExon 7: 4.580.015–4.580.125, 111 BasenExon 8: 4.587.039–4.587.113, 75 BasenExon 9: 4.588.167–4.588.331, 165 BasenExon 10: 4.591.666–4.591.784, 119 BasenExon 11: 4.592.305–4.592.367, 63 BasenExon 12: 4.593.224–4.593.316, 93 BasenExon 13: 4.594.351–4.594.510, 160 BasenExon 14: 4.594.704–4.594.803, 100 BasenExon 15: 4.599.284–4.599.364, 81 BasenExon 16: 4.600.100–4.600.758, 659 Basen12468101214165′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 4 kb der 44,4 kb des Gens aus; 3.426 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von C16orf96

11Leicht

Wie schwer sich C16orf96 mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Nahezu alle Exons von C16orf96 liegen in Bereichen, in denen Short Reads sauber zugeordnet werden können.

Was hinzukommt: der Anteil der Exons von C16orf96 in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability0 %
  • Homologie0 %
  • Gemeinsam mit chrY0 %
  • Abdeckung der Referenz0 %
  • Wiederholungen16 %
  • GC-Gehalt34 %

Ein Score von Dante Labs aus eigener Forschung, basierend auf den Karten schwer zu sequenzierender Regionen von NIST (Genome in a Bottle).So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). C16orf96-Gen: chromosome 16 open reading frame 96. Abgerufen am 21. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/c16orf96

Vancouver

Dante Labs. C16orf96-Gen: chromosome 16 open reading frame 96 [Internet]. [zitiert am 21. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/c16orf96

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