Varianta
SGCB R131X
NM_000232.5(SGCB):c.391C>T (p.Arg131Ter)
- p.Arg131Ter
- p.R131*
- rs1013015106
- Klasifikace ClinVar
- Patogenní
- Stav hodnocení
- 3 hvězdiček z 4Posouzeno odborným panelem
- Naposledy hodnoceno
- 8. ledna 2025
- Odborný panel
- ClinGen Limb Girdle Muscular Dystrophy Variant Curation Expert Panel, ClinGen
Data aktuální k verzi ClinVar 2026-10-12 · vydání dat Dante Labs 2026.10.16-c6eea6bfÚdaje naposledy změněny 16. října 2026
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Shrnutí
R131X je nonsense varianta v genu SGCB: vytváří předčasný signál zastavení, takže se předpokládá, že protein kódovaný genem bude zkrácen. ClinVar ji klasifikuje jako patogenní pro autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy (Posouzeno odborným panelem).
Klasifikace ClinVar
| Stav | Klasifikace | Stav hodnocení | Odeslání | Naposledy hodnoceno |
|---|---|---|---|---|
| autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophyClinVar VCV000523842 (otevře se na nové kartě) | Patogenní | 3 hvězdiček z 4Posouzeno odborným panelem | 1 odeslání | 8. ledna 2025 |
Klasifikace, jak je ClinVar zaznamenává ve verzi 2026-10-12. ClinVar je aktualizuje, jakmile se posoudí důkazy.
Umístění v SGCB
R131X se nachází v exonu 3 z 6 v transkriptu MANE Select genu SGCB, NM_000232.5.
Molekulární podrobnosti
| Gen | SGCB |
|---|---|
| Transkript | NM_000232.5MANE Select |
| Změna kódující DNA (HGVS c.) | c.391C>T |
| Změna proteinu (HGVS p.) | p.Arg131Terp.R131* |
| Předpokládaný důsledek | Nonsense (vznik stop kodonu)stop_gained (otevře se na nové kartě) |
| Předpokládaný dopad | Vysoký |
| Pozice (GRCh38) | chr4:52029716 G>A |
| Pozice (GRCh37) | chr4:52895882 G>A |
| ID dbSNP | rs1013015106 (otevře se na nové kartě) |
| ID variace ClinVar | VCV000523842 (otevře se na nové kartě) |
| ID alely v ClinVar | 514497 |
| ID v registru alel ClinGen | CA96782984 (otevře se na nové kartě) |
| Název v ClinVar | NM_000232.5(SGCB):c.391C>T (p.Arg131Ter) |
SGCB R131X v jiných databázích
Zprávy, které tuto variantu zkoumají (1)
Tyto zprávy o stavech z Genome Test zahrnují R131X mezi variantami, které zkoumají.
| Zpráva | Stavy | Dědičnost |
|---|---|---|
| Limb-Girdle Muscular Dystrophy | Limb-girdle Muscular Dystrophy |
Další varianty v SGCB
- F233Lfs*16Pravděpodobně patogenní3 hvězdiček z 4
- G129Qfs*2Patogenní3 hvězdiček z 4
- R29XPatogenní3 hvězdiček z 4
- R91CPatogenní3 hvězdiček z 4
- S114FPatogenní3 hvězdiček z 4
- T151RPatogenní3 hvězdiček z 4
- V89MPravděpodobně patogenní3 hvězdiček z 4
Omezení
Tato stránka popisuje veřejně dostupné informace o genetické variantě. Nejde o diagnózu a neříká nic o tom, zda vy nebo kdokoli jiný tuto variantu nese.
Klasifikace pocházejí z databáze ClinVar a mění se s tím, jak se posuzují nové důkazy. Klasifikace uvedená zde se proto může lišit od té, která je dnes v ClinVar, nebo od té, kterou uvádí laboratoř.
Celogenomové sekvenování krátkými čteními může některé varianty přehlédnout nebo chybně určit, zejména v opakujících se nebo vysoce podobných úsecích DNA a u velkých inzercí, delecí nebo přestaveb.
Máte-li otázky ohledně varianty ve svých výsledcích nebo v rodině, obraťte se na genetického poradce nebo na svého lékaře.
Zdroje a poděkování
- Klasifikace z ClinVar (verze 2026-10-12), National Center for Biotechnology Information.
- Názvy onemocnění z Mondo Disease Ontology (verze 2026-10-06), použito na základě licence CC BY 4.0.
- Symboly a názvy genů z HUGO Gene Nomenclature Committee (verze 2026-10-16).
- Identifikátory alel z ClinGen Allele Registry (verze 2026-10-16-c4908f54).
- Identifikátory referenčních SNP z dbSNP (verze b157), National Center for Biotechnology Information.
- Vztahy mezi geny a onemocněními z Gene Curation Coalition, GenCC (verze 2026-10-16).
- Obtížné oblasti z Genome in a Bottle Consortium (verze v3.6).
- Transkripty z MANE (verze v1.5), NCBI a EMBL-EBI.
- Předpokládané důsledky z nástroje mehari (verze 0.11.0), s modely transkriptů z cdot.
- Vytvořeno z dat Dante Labs, verze 2026.10.16-c6eea6bf, ze dne 16. října 2026.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (16. října 2026). SGCB R131X (c.391C>T, rs1013015106) (verze 2026.10.16-c6eea6bf). Staženo 16. října 2026 z https://dantelabs.com/genes/sgcb/variants/r131x
Dante Labs. SGCB R131X (c.391C>T, rs1013015106) [Internet]. Verze 2026.10.16-c6eea6bf. 16. října 2026 [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/genes/sgcb/variants/r131x
Přečtěte si celý svůj genom
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů