Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

NKX6-3

NK6 homeobox 3

Shrnutí

Cytogenetická poloha
8p11.21
Souřadnice
Chromozom 8: 41 645 177–41 650 817 (GRCh38)
Exony
3 exonů na 5,6 kb
Protein
265 aminokyselin
Další názvy
FLJ25169
Transkript MANE Select
ENST00000518699.4NM_001364841.2
Typ lokusu
Kódující proteiny
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen NKX6-3. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je NKX6-3 uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
Chromozom 8, se závorkou u NKX6-3. NKX6-3 a 6 genů poblíž na chromozomu 8, od 41 147 997 do 42 147 996.Chromozom 88p11.21p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.341,2 Mb41,4 Mb41,6 Mb41,8 Mb42 MbSFRP1: 41 261 956–41 309 511, řetězec zpětnémSFRP1GOLGA7: 41 488 200–41 511 095, řetězec dopřednémGOLGA7GINS4: 41 529 211–41 549 905, řetězec dopřednémGINS4GPAT4: 41 577 187–41 625 001, řetězec dopřednémGPAT4NKX6-3: 41 645 177–41 650 817, řetězec zpětnémNKX6-3ANK1: 41 653 220–41 896 812, řetězec zpětnémANK1KAT6A: 41 929 479–42 051 998, řetězec zpětnémKAT6ASchéma NKX6-3: 3 exonů na zpětném řetězci chromozomu 8Exon 3: 41 645 177–41 646 694, 1 518 bázíExon 2: 41 648 066–41 648 235, 170 bázíExon 1: 41 650 111–41 650 817, 707 bází3215′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 2,4 kb z 5,6 kb genu; 798 těchto bází kódují protein.

Sekvenování NKX6-3

12Snadné

Jak obtížně se NKX6-3 sekvenuje krátkými čteními, ze 100

Téměř všechny exony genu NKX6-3 leží tam, kde se krátká čtení mapují čistě.

Co k tomu přispívá: podíl exonů genu NKX6-3 v každém druhu obtížné oblasti

  • Mapovatelnost0 %
  • Homologie0 %
  • Sdíleno s chrY0 %
  • Pokrytí referenční sekvence0 %
  • Repetice6,6 %
  • Obsah GC49 %

Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, vycházející z map obtížně sekvenovatelných oblastí NIST Genome in a Bottle.Jak se skóre počítá

Externí odkazy

Odkud to pochází

  • HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen NKX6-3: NK6 homeobox 3. Staženo 20. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/nkx6-3

Vancouver

Dante Labs. Gen NKX6-3: NK6 homeobox 3 [Internet]. [citováno 20. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/nkx6-3

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test