Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

HLA-F

major histocompatibility complex, class I, F

Shrnutí

Cytogenetická poloha
6p22.1
Souřadnice
Chromozom 6: 29 723 434–29 727 296 (GRCh38)
Exony
7 exonů na 3,9 kb
Protein
442 aminokyselin
Transkript MANE Select
ENST00000259951.12NM_001098479.2
Typ lokusu
Kódující proteiny
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen HLA-F. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je HLA-F uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 6, se závorkou u HLA-F. HLA-F a 25 genů poblíž na chromozomu 6, od 29 225 365 do 30 225 364.Chromozom 66p22.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2729,4 Mb29,6 Mb29,8 Mb30 Mb30,2 MbOR14J1: 29 301 701–29 313 017, řetězec dopřednémOR14J1OR5V1: 29 353 749–29 431 967, řetězec zpětnémOR12D3: 29 373 423–29 375 291, řetězec zpětnémOR12D3OR12D2: 29 395 631–29 398 008, řetězec dopřednémOR12D2OR12D1: 29 414 928–29 418 905, řetězec dopřednémOR12D1OR11A1: 29 425 504–29 457 071, řetězec zpětnémOR11A1OR10C1: 29 439 306–29 440 977, řetězec dopřednémOR10C1OR2H1: 29 457 155–29 464 328, řetězec dopřednémOR2H1MAS1L: 29 486 697–29 487 956, řetězec zpětnémMAS1LOR2I1: 29 550 407–29 557 773, řetězec dopřednémOR2I1GABBR1: 29 552 554–29 633 976, řetězec zpětnémGABBR1UBD: 29 552 554–29 559 738, řetězec zpětnémUBDOR2H2: 29 585 121–29 590 500, řetězec dopřednémOR2H2MOG: 29 656 598–29 674 431, řetězec dopřednémMOGZFP57: 29 672 482–29 681 174, řetězec zpětnémZFP57HLA-F: 29 723 434–29 727 296, řetězec dopřednémHLA-FHLA-G: 29 826 967–29 831 130, řetězec dopřednémHLA-GHLA-A: 29 941 260–29 949 606, řetězec dopřednémHLA-APOLR1H: 30 058 899–30 064 909, řetězec dopřednémPOLR1HPPP1R11: 30 066 709–30 074 025, řetězec dopřednémPPP1R11RNF39: 30 070 266–30 075 849, řetězec zpětnémRNF39TRIM31: 30 102 886–30 113 126, řetězec zpětnémTRIM31TRIM40: 30 136 028–30 151 592, řetězec dopřednémTRIM40TRIM10: 30 151 943–30 161 288, řetězec zpětnémTRIM10TRIM15: 30 163 194–30 173 160, řetězec dopřednémTRIM15TRIM26: 30 184 446–30 214 158, řetězec zpětnémTRIM26Schéma HLA-F: 7 exonů na dopředném řetězci chromozomu 6Exon 1: 29 723 434–29 723 527, 94 bázíExon 2: 29 723 658–29 723 927, 270 bázíExon 3: 29 724 173–29 724 448, 276 bázíExon 4: 29 725 031–29 725 306, 276 bázíExon 5: 29 725 447–29 725 563, 117 bázíExon 6: 29 726 011–29 726 043, 33 bázíExon 7: 29 726 883–29 727 296, 414 bází12345675′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 1,5 kb z 3,9 kb genu; 1 329 těchto bází kódují protein.

Sekvenování HLA-F

7Snadné

Jak obtížně se HLA-F sekvenuje krátkými čteními, ze 100

Téměř všechny exony genu HLA-F leží tam, kde se krátká čtení mapují čistě.

Co k tomu přispívá: podíl exonů genu HLA-F v každém druhu obtížné oblasti

  • Mapovatelnost0,1 %
  • Homologie0 %
  • Sdíleno s chrY0 %
  • Pokrytí referenční sekvence0 %
  • Repetice2,1 %
  • Obsah GC32 %

Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, vycházející z map obtížně sekvenovatelných oblastí NIST Genome in a Bottle.Jak se skóre počítá

Externí odkazy

Odkud to pochází

  • HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen HLA-F: major histocompatibility complex, class I, F. Staženo 21. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/hla-f

Vancouver

Dante Labs. Gen HLA-F: major histocompatibility complex, class I, F [Internet]. [citováno 21. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/hla-f

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test