Gen
ARSF
arylsulfatase F
- HGNC 721↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000062096↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 416↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- Xp22.33
- Souřadnice
- Chromozom X: 3 041 471–3 112 727 (GRCh38)
- Exony
- 11 exonů na 71,3 kb
- Protein
- 590 aminokyselin
- Další názvy
- ASF
- Transkript MANE Select
- ENST00000381127.6NM_001201539.2
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/arsf.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si ARSF i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen ARSF. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.
Jak je ARSF uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 2,2 kb z 71,3 kb genu; 1 773 těchto bází kódují protein.
Sekvenování ARSF
9Snadné
Jak obtížné je sekvenovat ARSF krátkými čteními, ze 100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of ARSF's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of ARSF's exons in each kind of hard region
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání tam může chybět nebo být chybné. Váha 35 %.0 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, s identitou 90 % nebo vyšší. Váha 30 %.26 %
- RepeticeTandemové repetice a úseky jedné báze, na kterých čtení sklouzávají a které nemusí přečíst celé. Váha 15 %.4,9 %
- Obsah GCOkna s méně než 25 % nebo více než 65 % G a C, které příprava knihovny pokrývá řídce. Váha 10 %.0 %
- Pokrytí referenční sekvenceMezery v referenční sestavě v okolí, kde není sekvence, na kterou by se čtení mohla navázat. Váha 10 %.0 %
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredKaždý pruh udává podíl exonových bazí ARSF v tomto typu obtížné oblasti. Skóre je váží podle toho, jak moc každá zvyšuje náklady na volání krátkými čteními: 0, pokud žádná báze není v žádné oblasti, 100, pokud je každá báze ve všech.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen ARSF: arylsulfatase F. Staženo 18. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/arsf
Dante Labs. Gen ARSF: arylsulfatase F [Internet]. [citováno 18. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/arsf
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů