Polycystická choroba ledvin – ADPKD, která postihuje 1 z 1 000 lidí, je nejčastějším život ohrožujícím genetickým onemocněním ledvin, přičemž genotyp PKD1 nebo PKD2 určuje rychlost progrese onemocnění a to, kdy dojde k selhání ledvin.
Sekvenování celého genomu umožňuje vyhodnotit geny PKD1, PKD2 a další geny spojené s cystickou chorobou ledvin – poskytuje tak molekulární diagnózu, která předpovídá průběh onemocnění, pomáhá určit vhodnost léčby tolvaptanem a umožňuje screening rodinných příslušníků.
Polycystická choroba ledvin – genetické testování
Autosomálně dominantní polycystická choroba ledvin (ADPKD) postihuje přibližně 1 z 1 000 osob, což z ní činí nejčastější život ohrožující monogenní onemocnění ledvin. PKD1 (chromozom 16p13.3) představuje přibližně 85 % případů s těžším průběhem onemocnění (medián věku při nástupu terminálního selhání ledvin je 54 let). PKD2 (chromozom 4q22.1) představuje ~15 % případů s mírnějším průběhem onemocnění (medián ESRD ve věku 74 let). Tento 20letý rozdíl v časové ose selhání ledvin činí genotypizaci kritickou pro prognózu a plánování.
Tolvaptan (Jynarque, antagonista V2 receptorů) je schválen FDA k zpomalení růstu ledvin a poklesu eGFR u ADPKD. Podmínkou pro léčbu tolvaptanem je prokázání rychle progredujícího onemocnění – genotyp PKD1 s mutacemi způsobujícími zkrácení genu předpovídá rychlý průběh onemocnění a podporuje zahájení léčby tolvaptanem. Pacienti s PKD2 s pomalým průběhem onemocnění nemusí mít z léčby tolvaptanem prospěch vzhledem k jeho nežádoucím účinkům (masivní polyurie, nutnost sledování hepatotoxicity).
Sekvenování genu PKD1 je technicky náročné, protože existuje šest pseudogenů podobných PKD1 (PKD1P1–P6), které vykazují více než 97% homologii s exony 1–34 genu PKD1. U standardních panelů NGS může docházet k nesprávnému přiřazení sekvenčních čtení mezi gen PKD1 a pseudogeny. Přesnost detekce variant genu PKD1 lze zvýšit pomocí obohacování založeného na PCR s dlouhým dosahem nebo pomocí metod pokrývajících celý genom s využitím sofistikované bioinformatiky.
Zkrácené mutace v genu PKD1 = medián věku při nástupu terminálního selhání ledvin (ESRD) 54 let. PKD2 = medián věku při nástupu ESRD 74 let. Tento dvacetiletý rozdíl má zásadní vliv na naléhavost léčby, plánování transplantace a vhodnost léčby tolvaptanem. Genotyp předurčuje budoucnost vašich ledvin.
Gen PKD1 obsahuje pseudogeny, které zkreslují výsledky standardních testů. Genotyp PKD1 versus PKD2 předpovídá 20letý rozdíl v nástupu selhání ledvin. Celogenomové sekvenování (WGS) zvyšuje přesnost testování genu PKD1.
Pseudogeny genu PKD1 ztěžují standardní testování – sekvenování celého genomu (WGS) umožňuje v tomto technicky náročném genu lepší detekci variant
Šest pseudogenů PKD1 sdílí s genem PKD1 více než 97 % sekvence, což vede k nesprávnému přiřazení variant při standardním NGS. WGS zachycuje celý genomický kontext, čímž zvyšuje přesnost detekce variant genu PKD1. To je obzvláště důležité, protože varianty genu PKD1 způsobující zkrácení proteinu a varianty nezpůsobující zkrácení mají odlišný prognostický význam.
Vhodnost léčby tolvaptanem závisí na předpovědi rychlého progrese onemocnění – mutace způsobující zkrácení genu PKD1 umožňují předpovědět, u koho bude léčba nejúčinnější
Tolvaptan má závažné nežádoucí účinky (aquaréza, nutnost sledování jaterních funkcí). Trunkční mutace v genu PKD1 předurčují rychlý průběh onemocnění, což hovoří ve prospěch použití tolvaptanu. U pacientů s PKD2 s pomalým průběhem onemocnění může být přijatelná strategie vyčkávacího přístupu. Molekulární genotypizace umožňuje přijímat individuální rozhodnutí ohledně léčby.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o polycystické onemocnění ledvin, genetické testování nebo jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
