Genetické testování metylace – cyklus metylace zahrnuje desítky genů kromě MTHFR a sekvenování celého genomu tyto geny všechny vyhodnocuje – MTRR, MTR, BHMT, CBS, COMT, MAT1A, AHCY – a poskytuje tak kompletní genetický profil metylace.
Sekvenování celého genomu umožňuje současně vyhodnotit všechny geny podílející se na metylačním cyklu – nejen dvě běžné varianty genu MTHFR (C677T, A1298C), které se testují v rámci standardních panelů, ale také všechny varianty ve všech genech v metabolických drahách folátu, methioninu a transsulfurace.
Genetické testy metylace
Metylační cyklus (metabolismus jednosložek uhlíku) je ústřední metabolická dráha, která dodává methylovou skupinu pro metylaci DNA, syntézu neurotransmiterů, detoxikaci, tvorbu fosfolipidů a metabolismus homocysteinu. Do této dráhy je zapojeno několik enzymů: MTHFR (methylentetrahydrofolát reduktáza — přeměňuje 5,10-methylen-THF na 5-methyl-THF, aktivní formu folátu), MTR (methionin syntáza — přeměňuje homocystein na methionin za pomoci vitamínu B12), MTRR (methionin syntáza reduktáza – regeneruje aktivní vitamín B12 pro MTR), BHMT (betain-homocystein methyltransferáza – alternativní cesta přeměny homocysteinu), CBS (cystathionin beta-syntáza – transsulfurační dráha) a COMT (katechol-O-methyltransferáza – methylace neurotransmiterů).
MTHFR C677T (rs1801133) je nejčastěji studovanou variantou ovlivňující metylaci: homozygotní genotyp TT (~10–12 % osob evropského původu) snižuje aktivitu enzymu MTHFR přibližně o 70 %, což může vést ke zvýšené hladině homocysteinu (kardiovaskulární rizikový faktor) a snížené dostupnosti methylfolátu. MTHFR A1298C (rs1801131) snižuje aktivitu u homozygotů o ~35 %. Metylační cyklus je však síť – jednotlivé varianty v jiných genech (MTRR A66G, MTR A2756G, CBS C699T, COMT Val158Met) mohou varianty MTHFR zesilovat nebo kompenzovat. Standardní testy zaměřené pouze na MTHFR tuto složitost sítě nezohledňují.
Mezi klinické důsledky variant metylace patří: zvýšená hladina homocysteinu (kardiovaskulární riziko – lze řešit doplňky stravy s obsahem methylfolátu a aktivního vitamínu B12), riziko defektů neurální trubice v těhotenství (ženám s genotypem MTHFR TT prospívá spíše methylfolát než kyselina listová), variabilní metabolismus léčiv (varianta COMT Val158Met ovlivňuje metabolismus katecholaminů, citlivost na bolest a reakci na určité léky) a varianty genu CBS, které mohou ovlivňovat metabolismus síry a detoxikační dráhy. Komplexní testování metylace, které hodnotí celou dráhu – nejen jednu nebo dvě varianty MTHFR – poskytuje ucelený obraz pro personalizovanou suplementaci.
Standardní testy MTHFR zjišťují pouze 2 varianty (C677T a A1298C). Do metylačního cyklu je zapojeno více než 20 genů se stovkami funkčních variant. WGS je vyhodnocuje všechny – a poskytuje tak komplexní profil, který neúplné testování nedokáže zajistit.
Metylace je metabolický proces, nikoli jediný gen. Testování pouze mutací MTHFR C677T a A1298C nezachytí většinu genetických variací, které ovlivňují metabolismus kyseliny listové, vitamínu B12 a homocysteinu. Celogenomové sekvenování (WGS) posuzuje celý metabolický proces.
Testování zaměřené pouze na gen MTHFR opomíjí souvislosti – varianty genů MTRR, MTR, BHMT a CBS mohou genotyp MTHFR zesílit nebo kompenzovat
Pacient s genotypem MTHFR 677 CT (heterozygotní, mírné snížení), který je zároveň nositelem genotypů MTRR 66 GG (snížená recyklace vitamínu B12) a MTR 2756 GG (snížená aktivita metioninsyntázy), může trpět výrazně narušenou metylací – v větší míře, než by se dalo odvodit pouze z výsledku testu MTHFR. Naopak pacient s MTHFR 677 TT, ale příznivými genotypy BHMT a CBS, může tuto poruchu kompenzovat prostřednictvím alternativních drah. Pouze komplexní testování celé dráhy odhalí čistou metylační kapacitu.
Varianta COMT Val158Met ovlivňuje citlivost na bolest, metabolismus katecholaminů a reakci na hormonální substituční terapii – farmakogenomická varianta s širokými klinickými důsledky
Varianta COMT Val158Met (rs4680) určuje aktivitu enzymu COMT: Val/Val (vysoká aktivita, rychlý rozklad katecholaminů – fenotyp „bojovníka“), Met/Met (nízká aktivita, vyšší hladiny katecholaminů – fenotyp „strachujícího se“), a Val/Met (střední). Tato varianta ovlivňuje citlivost na bolest, reakci na stres, kognitivní výkonnost pod tlakem, metabolismus estrogenu a reakci na určité léky. COMT je součástí metylačního cyklu — jako donor methylových skupin využívá SAM (S-adenosylmethionin). WGS poskytuje genotypizaci COMT společně se všemi ostatními metylačními geny.
Vaše kompletní DNA (nejen její část)
Tradiční genetické testy se zaměřují pouze na úzké skupiny genů, přičemž opomíjejí většinu vašeho genomu. My sekvencujeme váš kompletní genom – každý gen i všechny oblasti mezi geny.
Komplexní přehledy a odborné zprávy
Srozumitelné a s odpověďmi, na jejichž základě můžete vy i váš lékař podniknout příslušné kroky. Nejedná se o soubor, který je třeba interpretovat – více než 200 klinických zpráv, seřazených podle kategorií.
Vaše zkouška každým rokem nabývá na hodnotě
Vaše DNA se nemění, ale pokroky v genomice se zrychlují. Každý měsíc se objevují nové souvislosti mezi variantami a nemocemi. Tyto poznatky ověřujeme a vaše zprávy automaticky aktualizujeme. Vaše vyšetření tak každým rokem nabývá na hodnotě.
Výsledky, které lékaři dosahují i u těch nejtěžších případů.
Čtyřicet let nejistoty. Jeden test.
Pacient strávil desítky let v britském zdravotnickém systému, aniž by mu byla stanovena diagnóza. Data z platformy Dante, která přijaly klinické týmy britské národní zdravotní služby (NHS) v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgow, odhalila Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou variantu genu RUNX1 spojenou s leukémií. Po 40 letech konečně dostali odpověď.
Teprve po přečtení celého textu získáte ucelený obraz.
Pacient se obrátil na společnost Dante s žádostí o vyšetření periodické paralýzy. Analýza celého genomu odhalila souběžný dědičný srdeční nález – Brugadův syndrom –, který jeho lékař potvrdil pomocí EKG. Výsledek také objasnil dosud nevyřešenou srdeční anamnézu jednoho z členů rodiny. Jeden test. Všechny odpovědi v něm.
Sekvenováno v roce 2019. Data byla zpracována v roce 2021.
Jennifer si nechala pomocí systému Dante zmapovat svůj genom dva roky předtím, než jí byla diagnostikována rakovina prsu. Když léčba začala, farmakogenomická data systému Dante ukázala, že předepsaná chemoterapie by u ní mohla vyvolat závažné nežádoucí účinky. Její lékař zvolil alternativní léčbu – a ona tak mohla zahájit účinnou léčbu již od prvního dne.
Každá otázka týkající se genetiky si zaslouží vyčerpávající odpověď.
Ať už dnes hledáte odpovědi, nebo se snažíte chránit své zdraví do budoucna, jediným správným výchozím bodem je kompletní sekvenování celého vašeho genomu.
Máte to v rodině. Nyní můžete zjistit, zda to máte v genech.
Váš genom obsahuje zděděné varianty spojené s onemocněními, jako jsou srdeční choroby, rakovina a neurologická onemocnění. Všechny tyto varianty analyzujeme – a to s takovou klinickou hloubkou, aby výsledky měly skutečný význam.
Další informace →Když tradiční laboratorní testy ukazují, že jste v pořádku. A vy víte, že tomu tak není.
Standardní diagnostické testy hledají předem stanovené výsledky. My sekvenujeme vaši kompletní DNA – včetně částí, na jejichž vyšetření žádný test není navržen. Pokud se odpověď skrývá ve vašem genomu, pomůžeme vám ji najít.
Další informace →Vaše diagnóza může být správná. Váš léčebný plán však může být neúplný.
Vaše geny určují, které léčby budou s největší pravděpodobností účinné – a které nikoli. Poskytujeme vašemu lékaři nástroje a informace, na jejichž základě může sestavit váš léčebný plán.
Další informace →Chcete to vědět, než vás k tomu něco donutí.
Někteří lidé nečekají na diagnózu ani na zjištění rodinné anamnézy, než začnou jednat. Sekvenování celého genomu vám poskytne úplný genetický obraz již nyní – takže vy a váš lékař můžete činit informovaná rozhodnutí, než se situace stane naléhavou.
Další informace →DNA test už jste absolvovali. Tady je to, co vám neprozradil.
Většina DNA testů pro spotřebitele analyzuje méně než 0,1 % vašeho genomu. My analyzujeme celý genom.
Další informace →Výsledky na klinické úrovni. Volí je jednotlivci a lékaři jim důvěřují i při řešení těch nejsložitějších případů.
Test Dante Genome pomohl odborníkům v jedné z britských nemocnic specializovaných na akutní péči identifikovat Noonanův syndrom a dosud nezjištěnou genetickou variantu spojenou s leukémií. Tento výsledek změnil způsob léčby pacienta.
Akreditováno a publikováno v
Časté dotazy týkající se sekvenování celého genomu.
Jaký je rozdíl mezi sekvenováním celého genomu a cíleným genetickým testem?
Cílené genetické testy – včetně standardních panelů pro dědičné formy rakoviny – analyzují předem definovaný seznam známých variant v konkrétní skupině genů. Jsou navrženy tak, aby odhalily to, co již znají a co mají hledat. Sekvenování celého genomu analyzuje celý váš genom: všech 6 miliard párů bází, každý gen, každou oblast mezi geny. Studie Mayo Clinic publikovaná v časopise JAMA Oncology zjistila, že standardní testovací pokyny přehlédly více než polovinu pacientů s dědičnými mutacemi způsobujícími rakovinu. Genomový test nemá pevně daný seznam.
Co obdržím, až budou výsledky hotové?
Služba Dante Genome poskytuje více než 200 zpráv připravených pro lékaře, rozdělených podle klinických kategorií – dědičné rakoviny, srdeční onemocnění, vzácná onemocnění, farmakogenomika, status nosiče a další. Zprávy jsou dodávány do vašeho zabezpečeného účtu Genome Manager a jsou formátovány pro přímé klinické použití. Vaše genomová data jsou trvale uchovávána a s postupem vědeckého pokroku automaticky znovu analyzována.
Co se stane, pokud bude zjištěna klinicky významná varianta?
Pokud bude identifikována patogenní nebo pravděpodobně patogenní varianta, bude v zprávě určené pro lékaře jasně označena spolu s klinickým kontextem, publikovanými důkazy a doporučenými dalšími kroky. Doporučujeme, abyste jakýkoli klinicky významný nález sdělili svému lékaři nebo genetickému poradci, který vám pomůže s rozhodováním ohledně sledování, snižování rizika nebo kaskádového testování u členů rodiny.
V čem se to liší od spotřebitelských testů DNA, jako jsou 23andMe nebo AncestryDNA?
Spotřebitelské DNA testy využívají genotypizační čipy, které analyzují méně než 0,1 % vašeho genomu – jde o nepatrný předem vybraný soubor běžných variant. Jsou optimalizovány pro určení původu a populačních znaků, nikoli pro klinické genetické nálezy. Genomický test Dante sekvencuje 100 % vašeho genomu s 30násobným pokrytím, což je stejný standard používaný v klinické diagnostice. Tyto dva testy nejsou srovnatelné co do rozsahu, metodiky ani klinické užitečnosti.
Jak dlouho trvá, než se dostaví výsledky, a jakým způsobem jsou sdělovány?
Vaše odběrová sada bude odeslána do 48 hodin od objednání. Jakmile váš vzorek dorazí do naší laboratoře s certifikací CLIA, sekvenování a analýza trvají 6–8 týdnů. Výsledky jsou bezpečně doručeny do vašeho Genome Manageru, kde máte přístup ke svým zprávám, můžete je sdílet se svým lékařem a dostávat automatické aktualizace, jakmile budou na základě vašeho genomu ověřeny nové poznatky.
Spolupracujeme s organizacemi zastupujícími zájmy pacientů po celém světě.
Společnost Dante Labs spolupracuje s pacientskými organizacemi jakékoli velikosti – ať už se jedná o genetické testy metylace nebo jiné nemoci, ať už vzácné, nebo běžné. Podporujeme organizace v jakékoli zemi, včetně virtuálních pacientských organizací.
Nabízíme přizpůsobené přehledy, skupinové slevy a balíčky šité na míru vašim členům. Kontaktujte nás prosím prostřednictvím formuláře a my se vám ozveme do dvou pracovních dnů.
- Genomické zprávy na míru pro vaše členy
- Skupinové slevy a balíčky na míru
- Jakákoli země – včetně virtuálních skupin
- Zahrnuty jsou vzácné i běžné nemoci
Rozumím.
Ozveme se vám do 2 pracovních dnů. Chcete-li nás kontaktovat přímo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovědi na celý život.
Jedna sada, doručená přímo k vám domů. Sekvenování celého vašeho genomu podle klinických standardů používaných při diagnostických rozhodnutích. Více než 200 zpráv připravených pro lékaře doručených do vašeho Genome Manageru během 6–8 týdnů – trvalé a aktualizované v souladu s vědeckým pokrokem.
Odeslání do 48 hodin · Výsledky za 6–8 týdnů
