Мускулна дистрофия на Дюшен — най-често срещаната тежка форма на мускулна дистрофия при деца, при която конкретният вариант на DMD определя за коя от нововъзникващите терапии с пропускане на екзони детето отговаря на критериите.
При секвенирането на целия геном се анализира целият ген DMD — най-големият ген в човешкия геном с дължина 2,4 милиона базови двойки — като се установяват всички точки на делеция, дупликации и дълбоки интронни варианти, които определят както диагнозата, така и подходящото лечение.
Мускулна дистрофия на Дюшен
Мускулната дистрофия на Дюшен (DMD) е рецесивно невромускулно заболяване, свързано с Х-хромозомата, причинено от патогенни варианти в гена DMD на хромозома Xp21.2, който кодира дистрофина — структурен протеин, необходим за целостта на мембраната на мускулните влакна. Дефицитът на дистрофин води до прогресивна дегенерация на мускулните влакна, хронично възпаление и заместване на мускулната тъкан с фиброзна и мастна тъкан. DMD е най-често срещаната тежка мускулна дистрофия в детска възраст, засягаща приблизително 1 на 3500–5000 новородени момчета в световен мащаб. Началото обикновено настъпва между 2 и 5-годишна възраст с проксимална мускулна слабост, която се проявява като затруднения при тичане, изкачване на стълби и ставане от пода (симптом на Гоуърс). Без лечение загубата на способността за ходене настъпва на 12–13-годишна възраст, а смъртта от дихателна или сърдечна недостатъчност обикновено настъпва в края на тийнейджърските години до средата на двадесетте.
Приблизително 60–70 % от вариантите, причиняващи ДМД, са големи делеции, обхващащи един или повече екзони, концентрирани в две „горещи точки“ (екзони 2–20 и екзони 44–55). Големите дупликации съставляват 5–15 % от вариантите, а останалите 20–30 % са точкови мутации (нонсенс, промяна на рамката на четене, място на сплайсинг). Правилото за рамката на четене разграничава DMD от по-лекото алелно състояние – мускулна дистрофия на Бекер (BMD): варианти извън рамката, които елиминират функционалното производство на дистрофин, причиняват DMD, докато варианти в рамката, които произвеждат съкратен, но частично функционален дистрофин, причиняват BMD. Тази корелация между генотип и фенотип определя прогнозата и все повече влияе върху избора на лечение.
Областта на лечението на ДМД претърпя коренна промяна благодарение на прецизните терапии, специфични за всеки генотип. Антисенс олигонуклеотиди за пропускане на екзони — етеплирсен (екзон 51, ~13% от пациентите с ДМД), голодирсен/вилтоларсен (екзон 53, ~8%) и казимерсен (екзон 45, ~8%) — възстановяват рамката на четене, за да произведат съкратен, но функционален дистрофин, превръщайки фенотипа на ДМД в БМД. Аталурен е насочен към варианти с нонсенс (преждевременен стоп-кодон), които съставляват приблизително 10–15% от случаите. Терапията за генна замяна (деландистроген моксепарвовек, одобрена през 2023 г.) използва микродистрофин, доставян чрез AAV вектор. Всяка от тези терапии изисква окончателна характеристика на варианта на ДМД, за да се определи подходящ ли е пациентът — което прави генетичната диагноза не само диагностична, но и директно терапевтична.
Правилото за рамката на четене определя дали даден вариант на гена DMD води до мускулна дистрофия на Дюшен (тежка форма, извън рамката) или на Бекер (по-лека форма, в рамката). Точната характеристика на точката на разкъсване определя дали пациентът отговаря на критериите за терапия чрез пропускане на екзони — решение, което зависи от това кои екзони са засегнати.
Стандартните тестове за делеции/дупликации установяват засегнатите екзони, но не и точните точки на разкъсване в интроните. Вариантите в дълбоките интрони, които причиняват анормално сплайсинг, остават незабелязани от панелите, фокусирани върху екзоните. Секвенирането на целия геном предоставя пълна картина на вариантите.
Точните точки на делеция определят дали е възможно пропускане на екзони — самото тестване на ниво екзони не е достатъчно
MLPA (мултиплексна лигационно-зависима амплификация на сонди) — стандартният диагностичен тест от първи етап за DMD — установява кои екзони са делетирани или дублирани, но не може да определи местоположението на интронните точки на прекъсване с точност до ниво на нуклеотидна двойка. За определяне на подходящите кандидати за терапия с пропускане на екзони точното местоположение на точката на прекъсване е от решаващо значение за това дали терапевтичното пропускане на екзона може да възстанови рамката на четене. Освен това, сложните прегрупирания — инверсии, несвързани делеции и делеции с вмъкване — не се откриват надеждно от MLPA. Секвенирането на целия геном картира точките на прекъсване на делециите на ниво нуклеотид във всички 79 екзона на DMD и в междинните 2,2 милиона базови двойки интронна последователност.
20–30 % от вариантите на ДМД са точкови мутации, чието откриване изисква секвениране на целия ген
Една трета от пациентите с ДМД имат точкови мутации — нонсенс, фреймшифт или варианти на местата на сплайсинг — а не големи делеции или дупликации. MLPA не открива точкови мутации; при тези пациенти е необходимо пълно секвениране на гена DMD като втора диагностична стъпка. Сред пациентите с точкови мутации тези с варианти с преждевременен стоп-кодон (нонсенс) могат да бъдат подходящи за терапия с аталурен. Дълбоките интронни варианти, които създават криптични сайтове на сплайсинг, представляват допълнителна категория, която може да бъде открита само чрез секвениране извън кодиращите екзони. Секвенирането на целия геном улавя делеции, дупликации, точкови мутации и дълбоки интронни варианти в един-единствен тест — елиминирайки последователния диагностичен път с множество тестове.
Цялата ви ДНК (а не само част от нея)
При традиционните генетични тестове се изследват ограничени групи гени, като по този начин се пропускат голяма част от вашия геном. Ние секвенираме целия ви геном — всеки ген и всеки участък между гените.
Изчерпателна информация и специализирани доклади
Лесно за четене и с отговори, въз основа на които вие и вашият лекар можете да предприемете действия. Не е документ, който трябва да се тълкува — над 200 клинични доклада, подредени по категории.
Вашият тест става все по-ценен с всяка изминала година
Вашата ДНК не се променя, но науката за генома се развива с все по-бързи темпове. Всеки месец се откриват нови връзки между варианти и заболявания. Ние проверяваме тези открития и актуализираме вашите доклади автоматично. Вашият тест става все по-ценен с всяка изминала година.
Резултатите, които лекарите постигат при най-тежките си случаи.
Четиридесет години несигурност. Един тест.
Един пациент прекара десетилетия в британската здравна система без диагноза. Данните от Dante, приети от клиничните екипи на Националната здравна служба (NHS) в Университетската болница „Кралица Елизабет“ в Глазгоу, установиха синдрома на Нунан и вариант на гена RUNX1, свързан с левкемия, който дотогава не беше открит. След 40 години те най-накрая получиха отговор.
Цялостното прочитане дава цялостна представа.
Един пациент се обърна към Dante за изследване на периодична парализа. Анализът на пълния геном разкри съпътстващо наследствено сърдечно заболяване — синдром на Бругада — което лекарят му потвърди чрез ЕКГ. Резултатът обясни и неизяснената сърдечна анамнеза на един член от семейството. Един тест. Всички отговори в него.
Секвениран през 2019 г. Данните бяха обработени през 2021 г.
Дженифър направи секвениране на генома си с помощта на Dante две години преди да ѝ бъде поставена диагнозата рак на гърдата. Когато започна лечението, фармакогеномните данни на Dante показаха, че предписаната ѝ химиотерапия би довела до сериозни нежелани реакции. Лекарят ѝ избра алтернативно лечение — и тя започна ефективно лечение още от първия ден.
Всеки въпрос, свързан с генетиката, заслужава изчерпателен отговор.
Независимо дали днес търсите отговори или се грижите за здравето си за утре, пълното секвениране на целия ви геном е единствената отправна точка.
Това е наследствено във вашето семейство. Сега можете да разберете дали е заложено в гените ви.
Вашият геном съдържа наследствени варианти, свързани със заболявания като сърдечни, онкологични и неврологични. Ние ги анализираме всички — с необходимата клинична задълбоченост, за да придадем смисъл на резултатите.
Научете повече →Когато традиционните лабораторни изследвания показват, че сте добре. А вие знаете, че не е така.
Стандартните диагностични тестове търсят предварително определен набор от отговори. Ние секвенираме цялата ви ДНК — включително части, за които нито един тест не е създаден да проверява. Ако отговорът се крие във вашия геном, ние ще ви помогнем да го откриете.
Научете повече →Диагнозата Ви може да е правилна. Лечебният Ви план може да е непълен.
Вашите гени определят кои лечения имат най-голям шанс да дадат резултат — и кои не. Ние предоставяме на Вашия лекар инструментите и информацията, необходими за изготвянето на Вашия лечебен план.
Научете повече →Искаш да знаеш, преди нещо да те накара да зададеш този въпрос.
Някои хора не чакат диагноза или данни за семейната анамнеза, за да предприемат действия. Секвенирането на целия геном ви предоставя пълна генетична картина още сега — така че вие и вашият лекар можете да вземете информирани решения, преди ситуацията да стане спешна.
Научете повече →Вече сте направили ДНК-тест. Ето какво той не можа да ви разкрие.
Повечето ДНК тестове за потребители анализират по-малко от 0,1% от вашия геном. Ние анализираме целия.
Научете повече →Резултати от клинично ниво. Избирани от потребителите, на които лекарите се доверяват за най-сложните си случаи.
Тестът „Dante Genome“ помогна на специалистите в национална болница за спешна помощ във Великобритания да диагностицират синдрома на Нунан и рядък генетичен вариант, свързан с левкемия, който дотогава не беше открит. Този резултат промени медицинското лечение на пациента.
Акредитирано от и публикувано в
Често задавани въпроси относно секвенирането на целия геном.
Каква е разликата между секвениране на целия геном и целеви генетичен тест?
Целевите генетични тестове — включително стандартните панели за наследствен рак — проверяват предварително определен списък от известни варианти в конкретен набор от гени. Те са предназначени да откриват това, за което вече се знае, че трябва да се търси. Секвенирането на целия геном проучва целия ви геном: всички 6 милиарда базови двойки, всеки ген, всеки регион между гените. Проучване на Mayo Clinic, публикувано в JAMA Oncology, установи, че стандартните насоки за тестване пропускат повече от половината пациенти с наследствени ракови мутации. Genome Test няма фиксиран списък.
Какво ще получа, когато резултатите ми са готови?
Вашият Dante Genome предоставя над 200 готови за използване от лекари доклада, групирани по клинични категории — наследствен рак, сърдечни заболявания, редки болести, фармакогеномика, носителство и др. Докладите се предоставят във вашия защитен Genome Manager и са форматирани за директна клинична употреба. Вашите геномни данни се съхраняват трайно и се преанализират автоматично с напредъка на науката.
Какво се случва, ако бъде открит клинично значим вариант?
Ако бъде идентифициран патогенен или вероятно патогенен вариант, той ще бъде ясно отбелязан във вашия отчет за лекари, заедно с клиничния контекст, публикуваните научни данни и препоръчаните следващи стъпки. Ние препоръчваме да споделите всяка клинично значима находка с вашия лекар или генетичен консултант, който може да ви насочи при вземането на решения относно наблюдението, намаляването на риска или каскадното тестване на членовете на семейството.
В какво се различава това от потребителски ДНК-тест като 23andMe или AncestryDNA?
ДНК тестовете за потребители използват чипове за генотипиране, които отчитат по-малко от 0,1% от вашия геном — една малка предварително подбрана група от често срещани варианти. Те са оптимизирани за определяне на произхода и за характеристики на популационно ниво, а не за клинични генетични заключения. Тестът Dante Genome секвенира 100% от вашия геном с 30-кратно покритие, същият стандарт, използван в клиничната диагностика. Двата теста не са съпоставими по обхват, методология или клинична полезност.
Колко време отнема да се получат резултатите и как се предоставят те?
Вашият комплект за вземане на проба се изпраща в рамките на 48 часа след поръчката. След като пробата Ви пристигне в нашата лаборатория, сертифицирана по CLIA, секвенирането и анализа отнемат 6–8 седмици. Резултатите се изпращат по сигурен начин в Вашия Genome Manager, където можете да разглеждате докладите си, да ги споделяте с Вашия лекар и да получавате автоматични известия при потвърждаване на нови открития във връзка с Вашия геном.
Ние си сътрудничим с организации за защита на правата на пациентите по целия свят.
Dante Labs работи с групи за защита на правата на пациентите от всякакъв мащаб — за мускулна дистрофия на Дюшен и други заболявания, както редки, така и често срещани. Подкрепяме групи във всяка страна, включително виртуални групи за защита на правата на пациентите.
Можем да ви предложим персонализирани отчети, групови отстъпки и пакети, съобразени с нуждите на вашите членове. Моля, свържете се с нас чрез формуляра и ще ви отговорим в рамките на два работни дни.
- Персонализирани геномни доклади за вашите членове
- Групови отстъпки и индивидуално съставени пакети
- Всяка държава — включително виртуални групи
- Обхванати редки и често срещани заболявания
Получих съобщението.
Ще се свържем с вас в рамките на 2 работни дни. За директна връзка: hello@dantelabs.com
Един тест.
Отговори за цял живот.
Един комплект, изпратен до вашия дом. Секвениране на целия ви геном съгласно клиничния стандарт, използван за диагностични решения. Над 200 доклада, готови за използване от лекари, които се изпращат във вашия Genome Manager в рамките на 6–8 седмици — постоянни и актуализирани в съответствие с научния напредък.
Изпраща се до 48 часа · Резултати след 6–8 седмици
