Кистозна фиброза — честотата на носителството на CFTR достига 1 на 25 души в някои популации. Цялостното откриване на варианти на CFTR преди планиране на семейството разкрива статуса на носителство, който стандартните скринингови тестове могат да пропуснат.
Секвенирането на целия геном позволява да се идентифицират всички известни варианти на CFTR — което дава възможност за скрининг за носителство, планиране на семейството и достъп до прецизни терапии с CFTR-модулатори.
Кистозна фиброза
Кистозната фиброза (КФ) е автозомно-рецесивно мултисистемно заболяване, засягащо белите дробове, панкреаса, черния дроб, репродуктивния тракт и потните жлези. Разпространението е приблизително 1 на 2500–3500 души в кавказките популации; честотата на носителството е приблизително 1 на 25 кавказци. Заболяването се причинява от биалелни патогенни варианти в CFTR, който кодира регулатора на трансмембранната проводимост при кистозна фиброза, хлорен канал, критичен за правилния баланс на течностите и електролитите в епителните тъкани. Идентифицирани са повече от 2000 варианта на CFTR. F508del (делеция на фенилаланин 508) е най-разпространеният, представляващ приблизително 70% от алелите на CF в световен мащаб и присъстващ при приблизително 90% от пациентите с CF (хетерозиготни или хомозиготни). Клинично CF се проявява с прогресиращо белодробно заболяване (повторящи се инфекции, бронхиектазия), панкреатична недостатъчност (малабсорбция, диабет) и загуба на сол. Средната продължителност на живота се е удължила от бебешка възраст през 80-те години до приблизително 50 години днес, главно благодарение на агресивното белодробно лечение и все повече благодарение на терапиите с CFTR модулатори, които превърнаха CF от фатално детско заболяване в управляемо хронично състояние.
CFTR кодира хлорен канал с дължина 1480 аминокиселини, регулиран от цАМФ, локализиран в апикалните мембрани на епителните клетки. Вариантите се класифицират според механизма: клас I (нонсенс, промяна на рамката на четене, канонично място на сплайсинг) не произвеждат протеин; клас II (дефекти в процеса на процесиране, включително F508del) причиняват неправилно сгъване и разграждане в ендоплазматичния ретикулум; клас III (дефектно отваряне на канала) нарушават отварянето; Клас IV (намалена проводимост) позволява частичен поток на хлориди; Клас V (намалено количество) произвеждат ниски нива на функционален протеин. F508del е вариант от Клас II, причиняващ неправилно сгъстяване и преждевременна деградация. Протеинът CFTR е абсолютно критичен за секрецията на хлориди; загубата на функция води до дехидратирани, вискозни секрети в дихателните пътища и каналите, причинявайки обструкция, инфекция и възпаление. В момента са одобрени три лекарства-модулатори на CFTR, които са променили изхода от заболяването: ивакафтор активира мутациите в отварянето; лумакафтор/ивакафтор коригира неправилното сгъване на F508del; елексакафтор/тезакафтор/ивакафтор обхващат приблизително 90% от пациентите с CF.
Генотипирането на CFTR е от решаващо значение за диагностицирането на кистозна фиброза и все по-често – за избора на терапия. Ивакафтор (Kalydeco) активира специфични мутации на гейт-механизма (G551D, G1244E и др.) и има благоприятен ефект при приблизително 4–6% от пациентите с кистозна фиброза. Лумакафтор/ивакафтор (Orkambi) е насочен към хомозиготни пациенти с F508del — приблизително 15% от пациентите с CF — и води до подобрение на FEV1 с около 6 пункта. Елексакафтор/тезакафтор/ивакафтор (Trikafta), одобрен за пациенти с CF с поне една копия на F508del, разширява обхвата на подходящите пациенти до приблизително 90% от пациентите с CF; Trikafta води до подобрение на FEV1 с около 10 пункта и драстично промени обстановката при CF – смъртността изглежда намалява след одобрението. Генотипът на CFTR определя директно до кои модулатори има достъп пациентът, което прави генетичното тестване съществено за насочване към терапия и позволява индивидуализиран избор на лечение.
Стандартните CF-панели тестват 23–32 често срещани варианта. Те не откриват редките мутации и имат ниска чувствителност при популации с неевропейски произход.
Стандартните панели пропускат редки варианти на CFTR и съдържат пропуски в родословната информация
Стандартните панели за скрининг на носители на муковисцидоза тестват 23–32 често срещани варианта (например разширеният панел ACMG-23). Тази стратегия открива приблизително 88% от носителите сред хората от кавказката раса, но само около 64% сред испано-американците, около 49% сред афроамериканците и около 30% сред азиатските популации – което представлява сериозен пропуск в равенството в здравеопазването. Разширените панели, включващи над 100 варианта, подобряват откриването, но все още пропускат редки варианти. Настоящите стандартни панели не оценяват модификаторните гени (като TGFB1, MBL2), които влияят върху тежестта на заболяването. Секвенирането на целия геном улавя всички варианти на CFTR, включително новите, като осигурява окончателна оценка на статуса на носител за всички популации и позволява цялостна оценка на генетичния риск.
Генотипът на CFTR определя достъпа до терапия с модулатори, която променя живота
Към момента са одобрени три лекарства – CFTR модулатори: ивакафтор за специфични мутации на гейт-механизма (G551D, G1244E и др.), лумакафтор/ивакафтор за хомозиготи с F508del и елексакафтор/тезакафтор/ивакафтор за пациенти с поне една копия на F508del. Trikafta е одобрен за приблизително 90% от пациентите с CF и от момента на одобрението му е намалил смъртността, като е довел до подобрение на FEV1 с приблизително 10 пункта. Генотипът на CFTR определя директно до кой модулатор има достъп пациентът. Документиран в медицинското досие и съобщен на пациента, генотипът позволява информирано обсъждане на терапевтичните опции, очакванията от лечението и прогнозата – като предотвратява забавената диагноза и позволява ранна интервенция, която може да запази белодробната функция и драстично да подобри резултатите.
Цялата ви ДНК (а не само част от нея)
При традиционните генетични тестове се изследват ограничени групи гени, като по този начин се пропускат голяма част от вашия геном. Ние секвенираме целия ви геном — всеки ген и всеки участък между гените.
Изчерпателна информация и специализирани доклади
Лесно за четене и с отговори, въз основа на които вие и вашият лекар можете да предприемете действия. Не е документ, който трябва да се тълкува — над 200 клинични доклада, подредени по категории.
Вашият тест става все по-ценен с всяка изминала година
Вашата ДНК не се променя, но науката за генома се развива с все по-бързи темпове. Всеки месец се откриват нови връзки между варианти и заболявания. Ние проверяваме тези открития и актуализираме вашите доклади автоматично. Вашият тест става все по-ценен с всяка изминала година.
Резултатите, които лекарите постигат при най-тежките си случаи.
Четиридесет години несигурност. Един тест.
Един пациент прекара десетилетия в британската здравна система без диагноза. Данните от Dante, приети от клиничните екипи на Националната здравна служба (NHS) в Университетската болница „Кралица Елизабет“ в Глазгоу, установиха синдрома на Нунан и вариант на гена RUNX1, свързан с левкемия, който дотогава не беше открит. След 40 години те най-накрая получиха отговор.
Цялостното прочитане дава цялостна представа.
Един пациент се обърна към Dante за изследване на периодична парализа. Анализът на пълния геном разкри съпътстващо наследствено сърдечно заболяване — синдром на Бругада — което лекарят му потвърди чрез ЕКГ. Резултатът обясни и неизяснената сърдечна анамнеза на един член от семейството. Един тест. Всички отговори в него.
Секвениран през 2019 г. Данните бяха обработени през 2021 г.
Дженифър направи секвениране на генома си с помощта на Dante две години преди да ѝ бъде поставена диагнозата рак на гърдата. Когато започна лечението, фармакогеномните данни на Dante показаха, че предписаната ѝ химиотерапия би довела до сериозни нежелани реакции. Лекарят ѝ избра алтернативно лечение — и тя започна ефективно лечение още от първия ден.
Всеки въпрос, свързан с генетиката, заслужава изчерпателен отговор.
Независимо дали днес търсите отговори или се грижите за здравето си за утре, пълното секвениране на целия ви геном е единствената отправна точка.
Това е наследствено във вашето семейство. Сега можете да разберете дали е заложено в гените ви.
Вашият геном съдържа наследствени варианти, свързани със заболявания като сърдечни, онкологични и неврологични. Ние ги анализираме всички — с необходимата клинична задълбоченост, за да придадем смисъл на резултатите.
Научете повече →Когато традиционните лабораторни изследвания показват, че сте добре. А вие знаете, че не е така.
Стандартните диагностични тестове търсят предварително определен набор от отговори. Ние секвенираме цялата ви ДНК — включително части, за които нито един тест не е създаден да проверява. Ако отговорът се крие във вашия геном, ние ще ви помогнем да го откриете.
Научете повече →Диагнозата Ви може да е правилна. Лечебният Ви план може да е непълен.
Вашите гени определят кои лечения имат най-голям шанс да дадат резултат — и кои не. Ние предоставяме на Вашия лекар инструментите и информацията, необходими за изготвянето на Вашия лечебен план.
Научете повече →Искаш да знаеш, преди нещо да те накара да зададеш този въпрос.
Някои хора не чакат диагноза или данни за семейната анамнеза, за да предприемат действия. Секвенирането на целия геном ви предоставя пълна генетична картина още сега — така че вие и вашият лекар можете да вземете информирани решения, преди ситуацията да стане спешна.
Научете повече →Вече сте направили ДНК-тест. Ето какво той не можа да ви разкрие.
Повечето ДНК тестове за потребители анализират по-малко от 0,1% от вашия геном. Ние анализираме целия.
Научете повече →Резултати от клинично ниво. Избирани от потребителите, на които лекарите се доверяват за най-сложните си случаи.
Тестът „Dante Genome“ помогна на специалистите в национална болница за спешна помощ във Великобритания да диагностицират синдрома на Нунан и рядък генетичен вариант, свързан с левкемия, който дотогава не беше открит. Този резултат промени медицинското лечение на пациента.
Акредитирано от и публикувано в
Често задавани въпроси относно секвенирането на целия геном.
Каква е разликата между секвениране на целия геном и целеви генетичен тест?
Целевите генетични тестове — включително стандартните панели за наследствен рак — проверяват предварително определен списък от известни варианти в конкретен набор от гени. Те са предназначени да откриват това, за което вече се знае, че трябва да се търси. Секвенирането на целия геном проучва целия ви геном: всички 6 милиарда базови двойки, всеки ген, всеки регион между гените. Проучване на Mayo Clinic, публикувано в JAMA Oncology, установи, че стандартните насоки за тестване пропускат повече от половината пациенти с наследствени ракови мутации. Genome Test няма фиксиран списък.
Какво ще получа, когато резултатите ми са готови?
Вашият Dante Genome предоставя над 200 готови за използване от лекари доклада, групирани по клинични категории — наследствен рак, сърдечни заболявания, редки болести, фармакогеномика, носителство и др. Докладите се предоставят във вашия защитен Genome Manager и са форматирани за директна клинична употреба. Вашите геномни данни се съхраняват трайно и се преанализират автоматично с напредъка на науката.
Какво се случва, ако бъде открит клинично значим вариант?
Ако бъде идентифициран патогенен или вероятно патогенен вариант, той ще бъде ясно отбелязан във вашия отчет за лекари, заедно с клиничния контекст, публикуваните научни данни и препоръчаните следващи стъпки. Ние препоръчваме да споделите всяка клинично значима находка с вашия лекар или генетичен консултант, който може да ви насочи при вземането на решения относно наблюдението, намаляването на риска или каскадното тестване на членовете на семейството.
В какво се различава това от потребителски ДНК-тест като 23andMe или AncestryDNA?
ДНК тестовете за потребители използват чипове за генотипиране, които отчитат по-малко от 0,1% от вашия геном — една малка предварително подбрана група от често срещани варианти. Те са оптимизирани за определяне на произхода и за характеристики на популационно ниво, а не за клинични генетични заключения. Тестът Dante Genome секвенира 100% от вашия геном с 30-кратно покритие, същият стандарт, използван в клиничната диагностика. Двата теста не са съпоставими по обхват, методология или клинична полезност.
Колко време отнема да се получат резултатите и как се предоставят те?
Вашият комплект за вземане на проба се изпраща в рамките на 48 часа след поръчката. След като пробата Ви пристигне в нашата лаборатория, сертифицирана по CLIA, секвенирането и анализа отнемат 6–8 седмици. Резултатите се изпращат по сигурен начин в Вашия Genome Manager, където можете да разглеждате докладите си, да ги споделяте с Вашия лекар и да получавате автоматични известия при потвърждаване на нови открития във връзка с Вашия геном.
Ние си сътрудничим с организации за защита на правата на пациентите по целия свят.
Dante Labs работи с групи за защита на правата на пациентите от всякакъв мащаб — за кистозна фиброза и други заболявания, както редки, така и често срещани. Подкрепяме групи във всяка страна, включително виртуални групи за защита на правата на пациентите.
Можем да ви предложим персонализирани отчети, групови отстъпки и пакети, съобразени с нуждите на вашите членове. Моля, свържете се с нас чрез формуляра и ще ви отговорим в рамките на два работни дни.
- Персонализирани геномни доклади за вашите членове
- Групови отстъпки и индивидуално съставени пакети
- Всяка държава — включително виртуални групи
- Обхванати редки и често срещани заболявания
Получих съобщението.
Ще се свържем с вас в рамките на 2 работни дни. Ако искате да се свържете директно с нас: hello@dantelabs.com
Един тест.
Отговори за цял живот.
Един комплект, изпратен до вашия дом. Секвениране на целия ви геном съгласно клиничния стандарт, използван за диагностични решения. Над 200 доклада, готови за използване от лекари, които се изпращат във вашия Genome Manager в рамките на 6–8 седмици — постоянни и актуализирани в съответствие с научния напредък.
Изпраща се до 48 часа · Резултати след 6–8 седмици