Синдром на Коуден — загуба на функция на гена PTEN, която води до един от най-високите рискове от рак на гърдата през целия живот сред всички наследствени синдроми, както и до повишен риск от рак на ендометриума, щитовидната жлеза, дебелото черво и бъбреците.
PTEN фигурира в списъка на ACMG SF v3.2 с гени, за които се изисква докладване на вторични находки при клинично секвениране на генома. Секвенирането на целия геном позволява да се охарактеризира пълният локус на PTEN — включително варианти в промоторната област и големи делеции, които стандартните панели за рак обикновено пропускат.
Синдром на Коудън — синдром на PTEN-хамартома
Синдромът на Коуден (CS) — най-често срещаният от синдромите на PTEN-хамартома (PHTS) — е синдром на наследствена предразположеност към рак с автозомно-доминантно предаване, причинен от патогенни варианти в гена PTEN (хомолог на фосфатазата и тензина) в зародишната линия, разположен на хромозома 10q23.31. PTEN е туморен супресор, който регулира сигналния път PI3K/AKT/mTOR; загубата на функцията на PTEN води до неконтролирана клетъчна пролиферация и образуване на тумори. Синдромът на Коуден се характеризира с мукокутанни лезии (трихилемоми, папиломатозни папули и акрални кератози), макроцефалия, доброкачествени хамартоми в множество органи и значително повишен риск от множество злокачествени заболявания. Очакваната честота е 1 на 200 000, въпреки че молекулярните диагнози разкриват значително по-висока честота.
Доживотният риск от рак при носителите на патогенни варианти на гена PTEN е сред най-високите, документирани за всеки генетичен фактор, свързан с рак: рискът от рак на гърдата достига 67–85% (в сравнение със средната стойност за населението от ~12%); рискът от рак на ендометриума е около 28–44%; рискът от рак на щитовидната жлеза (предимно фоликуларен) достига 21–38%; рискът от колоректален рак е повишен (9–18%); а рискът от карцином на бъбречните клетки е приблизително 34%. Мъжете носители имат повишен риск от рак на гърдата, както и повишен риск от рак на щитовидната жлеза и колоректален рак. Синдромът на Баннаян-Райли-Рувалкаба (BRR) и синдромът на Протеус (PS) представляват алелни нарушения на PTEN с припокриващи се, но различни клинични характеристики, всички причинени от патогенни варианти на PTEN.
Приблизително 25 % от лицата, отговарящи на клиничните диагностични критерии за синдрома на Коуден, нямат идентифицируема вариация в кодиращата последователност на PTEN — тази група може да носи вариации в промоторната област на PTEN, дълбоки интронни вариации, големи геномни прегрупирания или патогенни вариации в други гени, свързани с PHTS (SDHB, SDHD, KLLN). Насоките на NCCN препоръчват цялостен анализ на PTEN, включващ тестване за делеции/дупликации, като част от пълната оценка на PHTS. Лечението на потвърдените носители на PTEN включва ежегодна МРТ на гърдите, започваща на 30-годишна възраст, ежегодни мамографии, започващи на 30–35-годишна възраст, обмисляне на мастектомия за намаляване на риска, ежегодно вземане на проби от ендометриума, започващо на 30–35-годишна възраст, и ежегоден ултразвук на щитовидната жлеза.
Синдромите, свързани с PTEN-хамартоми, включват синдрома на Коуден, синдрома на Банаян-Райли-Рувалкаба, синдрома на Протеус и протеусоподобния синдром — алелни състояния с припокриващи се, но клинично различими прояви, всички причинени от патогенни варианти на гена PTEN.
Вариантите в промотора на PTEN и големите геномни прегрупирания са причина за до 25 % от случаите на PHTS — варианти, които стандартните панели за наследствен рак, които секвенират само кодиращите екзони на PTEN, систематично пропускат.
Вариантите в промоторния регион на PTEN са изключени от повечето панели за рак
При пациенти със синдром на Коуден, чиито резултати от стандартните панели за секвениране на екзони на PTEN са отрицателни, са идентифицирани патогенни варианти в промоторната област на PTEN — по-специално повтарящ се вариант c.-1019_-1018dupTA. Тези варианти намаляват транскрипцията на PTEN, което води до функционална хаплонедостатъчност, без да променят кодиращата последователност. Стандартните панели за рак секвенират само 9-те кодиращи екзона на PTEN и каноничните места на сплайсинг; те не включват промоторната област или междугенните регулаторни елементи. Секвенирането на целия геном чете целия локус на PTEN, включително промотора, всички интрони и 3' UTR — областите, където се намират регулаторните патогенни варианти.
Управлението на риска от различни видове рак изисква установяване на статуса на PTEN във възможно най-ранна възраст
Рисковете от рак, свързани с PTEN, са сред най-високите при всички наследствени синдроми, а наблюдението трябва да започне още през третото десетилетие от живота — преди повечето случаи на рак на гърдата и ендометриума в тази популация да станат клинично откриваеми. NCCN препоръчва ежегодна магнитно-резонансна томография (МРТ) на гърдите и мамография от 30-годишна възраст, като наблюдението на ендометриума започва на възраст 30–35 години. Този агресивен график за наблюдение е оправдан от данните за риска през целия живот, но изисква потвърден патогенен вариант на PTEN, за да бъде приложен. Отрицателен резултат от непълна панелна проверка — такава, при която не са оценени промоторът на PTEN или структурните прегрупирания — може да даде фалшиво чувство за сигурност, което да забави необходимото наблюдение с години.
Цялата ви ДНК (а не само част от нея)
При традиционните генетични тестове се изследват ограничени групи гени, като по този начин се пропускат голяма част от вашия геном. Ние секвенираме целия ви геном — всеки ген и всеки участък между гените.
Изчерпателна информация и специализирани доклади
Лесно за четене и с отговори, въз основа на които вие и вашият лекар можете да предприемете действия. Не е документ, който трябва да се тълкува — над 200 клинични доклада, подредени по категории.
Вашият тест става все по-ценен с всяка изминала година
Вашата ДНК не се променя, но науката за генома се развива с все по-бързи темпове. Всеки месец се откриват нови връзки между варианти и заболявания. Ние проверяваме тези открития и актуализираме вашите доклади автоматично. Вашият тест става все по-ценен с всяка изминала година.
Резултатите, които лекарите постигат при най-тежките си случаи.
Четиридесет години несигурност. Един тест.
Един пациент прекара десетилетия в британската здравна система без диагноза. Данните от Dante, приети от клиничните екипи на Националната здравна служба (NHS) в Университетската болница „Кралица Елизабет“ в Глазгоу, установиха синдрома на Нунан и вариант на гена RUNX1, свързан с левкемия, който дотогава не беше открит. След 40 години те най-накрая получиха отговор.
Цялостното прочитане дава цялостна представа.
Един пациент се обърна към Dante за изследване на периодична парализа. Анализът на пълния геном разкри съпътстващо наследствено сърдечно заболяване — синдром на Бругада — което лекарят му потвърди чрез ЕКГ. Резултатът обясни и неизяснената сърдечна анамнеза на един член от семейството. Един тест. Всички отговори в него.
Секвениран през 2019 г. Данните бяха обработени през 2021 г.
Дженифър направи секвениране на генома си с помощта на Dante две години преди да ѝ бъде поставена диагнозата рак на гърдата. Когато започна лечението, фармакогеномните данни на Dante показаха, че предписаната ѝ химиотерапия би довела до сериозни нежелани реакции. Лекарят ѝ избра алтернативно лечение — и тя започна ефективно лечение още от първия ден.
Всеки въпрос, свързан с генетиката, заслужава изчерпателен отговор.
Независимо дали днес търсите отговори или се грижите за здравето си за утре, пълното секвениране на целия ви геном е единствената отправна точка.
Това е наследствено във вашето семейство. Сега можете да разберете дали е заложено в гените ви.
Вашият геном съдържа наследствени варианти, свързани със заболявания като сърдечни, онкологични и неврологични. Ние ги анализираме всички — с необходимата клинична задълбоченост, за да придадем смисъл на резултатите.
Научете повече →Когато традиционните лабораторни изследвания показват, че сте добре. А вие знаете, че не е така.
Стандартните диагностични тестове търсят предварително определен набор от отговори. Ние секвенираме цялата ви ДНК — включително части, за които нито един тест не е създаден да проверява. Ако отговорът се крие във вашия геном, ние ще ви помогнем да го откриете.
Научете повече →Диагнозата Ви може да е правилна. Лечебният Ви план може да е непълен.
Вашите гени определят кои лечения имат най-голям шанс да дадат резултат — и кои не. Ние предоставяме на Вашия лекар инструментите и информацията, необходими за изготвянето на Вашия лечебен план.
Learn more →Искаш да знаеш, преди нещо да те накара да зададеш този въпрос.
Някои хора не чакат диагноза или данни за семейната анамнеза, за да предприемат действия. Секвенирането на целия геном ви предоставя пълна генетична картина още сега — така че вие и вашият лекар можете да вземете информирани решения, преди ситуацията да стане спешна.
Научете повече →Вече сте направили ДНК-тест. Ето какво той не можа да ви разкрие.
Повечето ДНК тестове за потребители анализират по-малко от 0,1% от вашия геном. Ние анализираме целия.
Научете повече →Резултати от клинично ниво. Избирани от потребителите, на които лекарите се доверяват за най-сложните си случаи.
Тестът „Dante Genome“ помогна на специалистите в национална болница за спешна помощ във Великобритания да диагностицират синдрома на Нунан и рядък генетичен вариант, свързан с левкемия, който дотогава не беше открит. Този резултат промени медицинското лечение на пациента.
Акредитирано от и публикувано в
Често задавани въпроси относно секвенирането на целия геном.
Каква е разликата между секвениране на целия геном и целеви генетичен тест?
Целевите генетични тестове — включително стандартните панели за наследствен рак — проверяват предварително определен списък от известни варианти в конкретен набор от гени. Те са предназначени да откриват това, за което вече се знае, че трябва да се търси. Секвенирането на целия геном проучва целия ви геном: всички 6 милиарда базови двойки, всеки ген, всеки регион между гените. Проучване на Mayo Clinic, публикувано в JAMA Oncology, установи, че стандартните насоки за тестване пропускат повече от половината пациенти с наследствени ракови мутации. Genome Test няма фиксиран списък.
Какво ще получа, когато резултатите ми са готови?
Вашият Dante Genome предоставя над 200 готови за използване от лекари доклада, групирани по клинични категории — наследствен рак, сърдечни заболявания, редки болести, фармакогеномика, носителство и др. Докладите се предоставят във вашия защитен Genome Manager и са форматирани за директна клинична употреба. Вашите геномни данни се съхраняват трайно и се преанализират автоматично с напредъка на науката.
Какво се случва, ако бъде открит клинично значим вариант?
Ако бъде идентифициран патогенен или вероятно патогенен вариант, той ще бъде ясно отбелязан във вашия отчет за лекари, заедно с клиничния контекст, публикуваните научни данни и препоръчаните следващи стъпки. Ние препоръчваме да споделите всяка клинично значима находка с вашия лекар или генетичен консултант, който може да ви насочи при вземането на решения относно наблюдението, намаляването на риска или каскадното тестване на членовете на семейството.
В какво се различава това от потребителски ДНК-тест като 23andMe или AncestryDNA?
ДНК тестовете за потребители използват чипове за генотипиране, които отчитат по-малко от 0,1% от вашия геном — една малка предварително подбрана група от често срещани варианти. Те са оптимизирани за определяне на произхода и за характеристики на популационно ниво, а не за клинични генетични заключения. Тестът Dante Genome секвенира 100% от вашия геном с 30-кратно покритие, същият стандарт, използван в клиничната диагностика. Двата теста не са съпоставими по обхват, методология или клинична полезност.
Колко време отнема да се получат резултатите и как се предоставят те?
Вашият комплект за вземане на проба се изпраща в рамките на 48 часа след поръчката. След като пробата Ви пристигне в нашата лаборатория, сертифицирана по CLIA, секвенирането и анализа отнемат 6–8 седмици. Резултатите се изпращат по сигурен начин в Вашия Genome Manager, където можете да разглеждате докладите си, да ги споделяте с Вашия лекар и да получавате автоматични известия при потвърждаване на нови открития във връзка с Вашия геном.
Ние си сътрудничим с организации за защита на правата на пациентите по целия свят.
Dante Labs работи с групи за защита на правата на пациентите от всякакъв мащаб — за синдрома на Коуден — синдрома на PTEN хамартома и други заболявания, както редки, така и често срещани. Ние подкрепяме групи във всяка страна, включително виртуални групи за защита на правата на пациентите.
Можем да ви предложим персонализирани отчети, групови отстъпки и пакети, съобразени с нуждите на вашите членове. Моля, свържете се с нас чрез формуляра и ще ви отговорим в рамките на два работни дни.
- Персонализирани геномни доклади за вашите членове
- Групови отстъпки и индивидуално съставени пакети
- Всяка държава — включително виртуални групи
- Обхванати редки и често срещани заболявания
Получих съобщението.
Ще се свържем с вас в рамките на 2 работни дни. За директна връзка: hello@dantelabs.com
Един тест.
Отговори за цял живот.
Един комплект, изпратен до вашия дом. Секвениране на целия ви геном съгласно клиничния стандарт, използван за диагностични решения. Над 200 доклада, готови за използване от лекари, които се изпращат във вашия Genome Manager в рамките на 6–8 седмици — постоянни и актуализирани в съответствие с научния напредък.
Изпраща се до 48 часа · Резултати след 6–8 седмици
