Синдром на предразположение към тумори BAP1 — наскоро описан наследствен раков синдром с висока пенетрантност, при който един генен вариант предразполага към четири различни вида рак едновременно, много от които са изключително редки сред общото население.
Секвенирането на целия геном установява патогенни варианти на гена BAP1 — включени в списъка ACMG SF v3.2 — при синдром, при който един-единствен генетичен резултат налага наблюдение за увеален меланом, мезотелиом, кожен меланом и карцином на бъбречните клетки.
Синдром на предразположение към тумори BAP1
Синдромът на предразположение към тумори BAP1 (BAP1-TPDS) е автозомно-доминантен наследствен раков синдром, причинен от патогенни варианти в гена BAP1 (BRCA1-асоцииран протеин 1) в зародишната линия, разположен на хромозома 3p21.1. BAP1 е деубиквитилаза, която участва в ремоделирането на хроматина, реакцията при увреждане на ДНК и контрола на клетъчния цикъл. Патогенните варианти на BAP1 в зародишната линия бяха систематично характеризирани едва от 2011 г. насам — синдромът е описан сравнително наскоро, което означава, че много засегнати семейства са натрупали множество необичайни ракови заболявания в продължение на поколения, без да има наследствено обяснение за това. BAP1-TPDS вече се признава като синдром на предразположение към множество тумори с висока пенетрантност.
Спектърът на туморите при BAP1-TPDS е характерен — носителите са изложени на значително повишен риск от: увеален меланом (очен меланом, засягащ хориоидеята/ириса/цилиарното тяло; >50 пъти по-висок риск в сравнение с общата популация), злокачествен плеврален мезотелиом (рядък рак, силно свързан с експозиция на азбест, за който вече е установено, че се среща и при носители на BAP1 с минимална или никаква експозиция на азбест), кожен меланом (множествени първични меланоми, често с характерни меланоцитни атипични интрадермални тумори с мутация в BAP1 — лезии „BAPoma“) и карцином на бъбречните клетки (особено подтиповете с ясни клетки и хромофобни). Всеки от тези ракови заболявания поотделно е рядък; тяхното едновременното появяване в едно семейство е епидемиологичният сигнал, който идентифицира BAP1-TPDS.
Клиничните последствия от молекулярната диагноза на BAP1 са непосредствени и засягат различни специалности. При поставянето на диагнозата се започват годишни офталмологични прегледи, включващи офталмоскопска оценка (наблюдение за увеален меланом), годишни дерматологични прегледи с дерматоскопия (наблюдение за кожен меланом и BAPoma), образна диагностика на бъбреците, започваща в третото до четвъртото десетилетие (наблюдение за RCC), обмисляне на годишна образна диагностика на гръдния кош (наблюдение за мезотелиом при изложени носители) и каскадно тестване на всички роднини от първа степен. От решаващо значение е, че мезотелиомът, свързан с BAP1, се признава като клинична единица, различна от мезотелиома, предизвикана от азбест — пациентите с BAP1 мезотелиом са по-млади, имат по-дълго преживяване след поставяне на диагнозата и могат да имат различни профили на отговор към химиотерапията.
BAP1 беше признат за ген, свързан с наследствен рак, едва след 2011 г. и не е включен в много от по-старите панели за наследствен рак. Семейства с увеален меланом, мезотелиом или необичайни случаи на рак в семейството може да имат мутация BAP1-TPDS, без някога да са били подложени на подходящи изследвания.
BAP1 липсва в по-старите панели за наследствен рак — семействата с необичайна история на ракови заболявания никога не са били тествани
Систематичното охарактеризиране на BAP1-TPDS започна едва през 2011 г. Много семейства с патогенни варианти на BAP1 са преминали през панели за наследствен рак през предходното десетилетие, които не са включвали BAP1. Лица с фамилна анамнеза, включваща увеален меланом, мезотелиом или необичайно струпване на меланом и рак на бъбреците — основният спектър на тумори, свързани с BAP1 — може да са получили отрицателни резултати от панели при тестове, проведени преди 2011 г., или от панели, които никога не са добавяли BAP1 към списъка си с гени. Секвенирането на целия геном оценява целия геном и идентифицира патогенните варианти на BAP1, независимо кога е било извършено секвенирането, без ограничение от предварително дефиниран списък с гени.
Потвърден резултат за BAP1 задейства четири едновременни протокола за наблюдение на рака
За разлика от наследствените ракови синдроми, при които един-единствен ген предразполага предимно към един вид рак, BAP1-TPDS изисква координирано наблюдение на четири различни вида рак — увеален меланом (офталмология), кожен меланом (дерматология), карцином на бъбречните клетки (урология/радиология) и мезотелиом (пулмонология/онкология). Тази мултиспециализирана координация започва при първата молекулярна диагноза и продължава ежегодно през целия живот. Всеки метод на наблюдение е насочен към рак, който не е включен в стандартния скрининг на населението — няма съществуваща обща програма за скрининг на рак, която да обхваща увеалния меланом, а скринингът за мезотелиом не е стандартен при недиагностицирани носители на BAP1. Молекулярната диагноза е предпоставка за активиране на тази мрежа за наблюдение на множество органи.
Цялата ви ДНК (а не само част от нея)
При традиционните генетични тестове се изследват ограничени групи гени, като по този начин се пропускат голяма част от вашия геном. Ние секвенираме целия ви геном — всеки ген и всеки участък между гените.
Изчерпателна информация и специализирани доклади
Лесно за четене и с отговори, въз основа на които вие и вашият лекар можете да предприемете действия. Не е документ, който трябва да се тълкува — над 200 клинични доклада, подредени по категории.
Вашият тест става все по-ценен с всяка изминала година
Вашата ДНК не се променя, но науката за генома се развива с все по-бързи темпове. Всеки месец се откриват нови връзки между варианти и заболявания. Ние проверяваме тези открития и актуализираме вашите доклади автоматично. Вашият тест става все по-ценен с всяка изминала година.
Резултатите, които лекарите постигат при най-тежките си случаи.
Четиридесет години несигурност. Един тест.
Един пациент прекара десетилетия в британската здравна система без диагноза. Данните от Dante, приети от клиничните екипи на Националната здравна служба (NHS) в Университетската болница „Кралица Елизабет“ в Глазгоу, установиха синдрома на Нунан и вариант на гена RUNX1, свързан с левкемия, който дотогава не беше открит. След 40 години те най-накрая получиха отговор.
Цялостното прочитане дава цялостна представа.
Един пациент се обърна към Dante за изследване на периодична парализа. Анализът на пълния геном разкри съпътстващо наследствено сърдечно заболяване — синдром на Бругада — което лекарят му потвърди чрез ЕКГ. Резултатът обясни и неизяснената сърдечна анамнеза на един член от семейството. Един тест. Всички отговори в него.
Секвениран през 2019 г. Данните бяха обработени през 2021 г.
Дженифър направи секвениране на генома си с помощта на Dante две години преди да ѝ бъде поставена диагнозата рак на гърдата. Когато започна лечението, фармакогеномните данни на Dante показаха, че предписаната ѝ химиотерапия би довела до сериозни нежелани реакции. Лекарят ѝ избра алтернативно лечение — и тя започна ефективно лечение още от първия ден.
Всеки въпрос, свързан с генетиката, заслужава изчерпателен отговор.
Независимо дали днес търсите отговори или се грижите за здравето си за утре, пълното секвениране на целия ви геном е единствената отправна точка.
Това е наследствено във вашето семейство. Сега можете да разберете дали е заложено в гените ви.
Вашият геном съдържа наследствени варианти, свързани със заболявания като сърдечни, онкологични и неврологични. Ние ги анализираме всички — с необходимата клинична задълбоченост, за да придадем смисъл на резултатите.
Научете повече →Когато традиционните лабораторни изследвания показват, че сте добре. А вие знаете, че не е така.
Стандартните диагностични тестове търсят предварително определен набор от отговори. Ние секвенираме цялата ви ДНК — включително части, за които нито един тест не е създаден да проверява. Ако отговорът се крие във вашия геном, ние ще ви помогнем да го откриете.
Научете повече →Диагнозата Ви може да е правилна. Лечебният Ви план може да е непълен.
Вашите гени определят кои лечения имат най-голям шанс да дадат резултат — и кои не. Ние предоставяме на Вашия лекар инструментите и информацията, необходими за изготвянето на Вашия лечебен план.
Научете повече →Искаш да знаеш, преди нещо да те накара да зададеш този въпрос.
Някои хора не чакат диагноза или данни за семейната анамнеза, за да предприемат действия. Секвенирането на целия геном ви предоставя пълна генетична картина още сега — така че вие и вашият лекар можете да вземете информирани решения, преди ситуацията да стане спешна.
Научете повече →Вече сте направили ДНК-тест. Ето какво той не можа да ви разкрие.
Повечето ДНК тестове за потребители анализират по-малко от 0,1% от вашия геном. Ние анализираме целия.
Научете повече →Резултати от клинично ниво. Избирани от потребителите, на които лекарите се доверяват за най-сложните си случаи.
Тестът „Dante Genome“ помогна на специалистите в национална болница за спешна помощ във Великобритания да диагностицират синдрома на Нунан и рядък генетичен вариант, свързан с левкемия, който дотогава не беше открит. Този резултат промени медицинското лечение на пациента.
Акредитирано от и публикувано в
Често задавани въпроси относно секвенирането на целия геном.
Каква е разликата между секвениране на целия геном и целеви генетичен тест?
Целевите генетични тестове — включително стандартните панели за наследствен рак — проверяват предварително определен списък от известни варианти в конкретен набор от гени. Те са предназначени да откриват това, за което вече се знае, че трябва да се търси. Секвенирането на целия геном проучва целия ви геном: всички 6 милиарда базови двойки, всеки ген, всеки регион между гените. Проучване на Mayo Clinic, публикувано в JAMA Oncology, установи, че стандартните насоки за тестване пропускат повече от половината пациенти с наследствени ракови мутации. Genome Test няма фиксиран списък.
Какво ще получа, когато резултатите ми са готови?
Вашият Dante Genome предоставя над 200 готови за използване от лекари доклада, групирани по клинични категории — наследствен рак, сърдечни заболявания, редки болести, фармакогеномика, носителство и др. Докладите се предоставят във вашия защитен Genome Manager и са форматирани за директна клинична употреба. Вашите геномни данни се съхраняват трайно и се преанализират автоматично с напредъка на науката.
Какво се случва, ако бъде открит клинично значим вариант?
Ако бъде идентифициран патогенен или вероятно патогенен вариант, той ще бъде ясно отбелязан във вашия отчет за лекари, заедно с клиничния контекст, публикуваните научни данни и препоръчаните следващи стъпки. Ние препоръчваме да споделите всяка клинично значима находка с вашия лекар или генетичен консултант, който може да ви насочи при вземането на решения относно наблюдението, намаляването на риска или каскадното тестване на членовете на семейството.
В какво се различава това от потребителски ДНК-тест като 23andMe или AncestryDNA?
ДНК тестовете за потребители използват чипове за генотипиране, които отчитат по-малко от 0,1% от вашия геном — една малка предварително подбрана група от често срещани варианти. Те са оптимизирани за определяне на произхода и за характеристики на популационно ниво, а не за клинични генетични заключения. Тестът Dante Genome секвенира 100% от вашия геном с 30-кратно покритие, същият стандарт, използван в клиничната диагностика. Двата теста не са съпоставими по обхват, методология или клинична полезност.
Колко време отнема да се получат резултатите и как се предоставят те?
Вашият комплект за вземане на проба се изпраща в рамките на 48 часа след поръчката. След като пробата Ви пристигне в нашата лаборатория, сертифицирана по CLIA, секвенирането и анализа отнемат 6–8 седмици. Резултатите се изпращат по сигурен начин в Вашия Genome Manager, където можете да разглеждате докладите си, да ги споделяте с Вашия лекар и да получавате автоматични известия при потвърждаване на нови открития във връзка с Вашия геном.
Ние си сътрудничим с организации за защита на правата на пациентите по целия свят.
Dante Labs работи с групи за защита на правата на пациентите от всякакъв мащаб — за синдрома на предразположение към тумори BAP1 и други заболявания, както редки, така и често срещани. Ние подкрепяме групи във всяка страна, включително виртуални групи за защита на правата на пациентите.
Можем да ви предложим персонализирани отчети, групови отстъпки и пакети, съобразени с нуждите на вашите членове. Моля, свържете се с нас чрез формуляра и ще ви отговорим в рамките на два работни дни.
- Персонализирани геномни доклади за вашите членове
- Групови отстъпки и индивидуално съставени пакети
- Всяка държава — включително виртуални групи
- Обхванати редки и често срещани заболявания
Получих съобщението.
Ще се свържем с вас в рамките на 2 работни дни. За директна връзка: hello@dantelabs.com
Един тест.
Отговори за цял живот.
Един комплект, изпратен до вашия дом. Секвениране на целия ви геном съгласно клиничния стандарт, използван за диагностични решения. Над 200 доклада, готови за използване от лекари, които се изпращат във вашия Genome Manager в рамките на 6–8 седмици — постоянни и актуализирани в съответствие с научния напредък.
Изпраща се до 48 часа · Резултати след 6–8 седмици
