Дефицит на алфа-1-антитрипсин — често срещана генетична причина за ранна емфизема и чернодробно заболяване, която остава недиагностицирана средно 7 години след появата на симптомите.
Секвенирането на целия геном отчита пълния геном на SERPINA1, като идентифицира всички Pi-алели — включително редки комбинирани хетерозиготни комбинации — с цел установяване на пълния генотип и прогнозиране на риска от белодробни и чернодробни заболявания.
Дефицит на алфа-1-антитрипсин
Дефицитът на алфа-1 антитрипсин (AATD) е автозомно-кодоминантно заболяване, причинено от патогенни варианти в гена SERPINA1, който кодира алфа-1 антитрипсин (AAT) — инхибитор на серинпротеазите, произвеждан предимно в хепатоцитите, който предпазва белодробния паренхим от разрушаване, медиирано от неутрофилната еластаза. Смята се, че AATD засяга 1 на 2500 души от европейски произход и приблизително 3,4 милиона души в световен мащаб, което го прави едно от най-често срещаните сериозни моногенни заболявания — въпреки това то остава хронично и сериозно недодиагностицирано. Средният период от появата на първите респираторни симптоми до поставянето на диагнозата е 7–8 години, през които се натрупват необратими белодробни увреждания.
Алелите на SERPINA1 се обозначават съгласно номенклатурата Pi (инхибитор на протеазата). Нормалният алел е Pi*M. Най-клинично значимите варианти са Pi*Z (p.Glu342Lys; rs28929474) и Pi*S (p.Glu264Val; rs17580). Хомозиготите Pi*ZZ — най-тежко засегнатият генотип — имат серумни нива на AAT приблизително 15% от нормалните, поради както намалена секреция, така и интрахепатална полимеризация на неправилно сгънатия Z-протеин. Композитните хетерозиготи Pi*SZ имат нива на AAT приблизително 40% от нормалните и са изложени на повишен, но по-нисък риск от белодробни заболявания. Полимеризиращият Z-протеин се натрупва в хепатоцитите, причинявайки прогресиращо чернодробно заболяване (цироза, хепатоцелуларен карцином) при подгрупа от Pi*ZZ индивиди чрез отличителен токсичен механизъм на придобиване на функция, независим от пътя на белодробното заболяване.
Допълнителната терапия с интравенозен инхибитор на алфа-1 протеиназата (Prolastin, Zemaira, Aralast) забавя прогресирането на емфиземата при пациенти с Pi*ZZ и установена обструкция на дихателните пътища — единственото одобрено лечение, специфично за това състояние. Ползата за преживяемостта е най-изразена, когато терапията започне преди значително увреждане на белите дробове. Тютюнопушенето драстично ускорява развитието на белодробното заболяване при AATD; пушачите с Pi*ZZ губят белодробната си функция 3-4 пъти по-бързо от непушачите с AATD. Ранната диагноза позволява консултиране за отказване от тютюнопушенето преди настъпване на необратими увреждания, избягване на професионална експозиция на прах и дим и започване на подсилваща терапия в оптималния стадий на заболяването.
Описани са над 120 варианта на гена SERPINA1. Редките алели (Pi*I, Pi*F, Pi*P, Pi*Null) водят до спектър от фенотипи на дефицит на AAT – от умерена недостатъчност до пълна липса на секретиран протеин.
При стандартното тестване за AATD се проверяват алелите Z и S поотделно. За пълното генотипизиране на SERPINA1 е необходимо да се определи цялостната алелна структура — включително редките алели, които определят дали пациентът страда от AATD или просто е носител на един алел с дефицит.
Хетерозиготите за комбинацията Pi*SZ често не се откриват при бинарните Z/S тестове
Тестовете за скрининг на AATD, както в пунктовете за диагностика на място, така и в стандартните лаборатории, са оптимизирани за откриване на алел Z (Pi*Z) и отчитат генотипи Pi*MZ или Pi*ZZ. Комбинираната хетерозиготност Pi*SZ — която носи значителен риск от белодробно заболяване и се среща при приблизително 1 на 625 души от европейски произход — изисква едновременна характеристика както на алел Z, така и на алел S. Редки варианти на SERPINA1, които не са включени в ограничените панели, водят до нива на ААТ, еквивалентни на Pi*MZ или Pi*ZZ, при пациенти, които са с „нормални“ резултати при скрининг само за Z-алел. Пълното генотипизиране на SERPINA1 чрез секвениране на целия геном идентифицира едновременно всички алели, включително редки комбинирани хетерозиготни комбинации, които изглеждат нормални при бинарно тестване.
Разграничаването на Pi*MZ от Pi*ZZ определя дали пациентът отговаря на критериите за допълнително лечение
Насоките на NICE, ERS и ATS препоръчват подсилваща терапия с AAT за пациенти с Pi*ZZ и Pi*null с установена обструктивна белодробна болест — но не и за носители на Pi*MZ. Клиничните и финансовите последствия от това разграничение на генотиповете са значителни: подсилващата терапия струва приблизително 50 000–100 000 долара годишно. Точното генотипизиране разграничава пациентите, които отговарят на критериите за допълнителна терапия, от носителите, които се нуждаят само от наблюдение и консултации относно рисковите фактори. Без пълно генотипизиране на SERPINA1 пациент с Pi*SZ и много ниско измерено ниво на AAT може да бъде неправилно класифициран като Pi*MZ и да му бъде отказано подходящо лечение — или, обратно, на носител на Pi*MZ с съпътстваща ХОББ може да бъде предписана допълнителна терапия, която не се подкрепя от насоките за AATD.
Цялата ви ДНК (а не само част от нея)
При традиционните генетични тестове се изследват ограничени групи гени, като по този начин се пропускат голяма част от вашия геном. Ние секвенираме целия ви геном — всеки ген и всеки участък между гените.
Изчерпателна информация и специализирани доклади
Лесно за четене и с отговори, въз основа на които вие и вашият лекар можете да предприемете действия. Не е документ, който трябва да се тълкува — над 200 клинични доклада, подредени по категории.
Вашият тест става все по-ценен с всяка изминала година
Вашата ДНК не се променя, но науката за генома се развива с все по-бързи темпове. Всеки месец се откриват нови връзки между варианти и заболявания. Ние проверяваме тези открития и актуализираме вашите доклади автоматично. Вашият тест става все по-ценен с всяка изминала година.
Резултатите, които лекарите постигат при най-тежките си случаи.
Четиридесет години несигурност. Един тест.
Един пациент прекара десетилетия в британската здравна система без диагноза. Данните от Dante, приети от клиничните екипи на Националната здравна служба (NHS) в Университетската болница „Кралица Елизабет“ в Глазгоу, установиха синдрома на Нунан и вариант на гена RUNX1, свързан с левкемия, който дотогава не беше открит. След 40 години те най-накрая получиха отговор.
Цялостното прочитане дава цялостна представа.
Един пациент се обърна към Dante за изследване на периодична парализа. Анализът на пълния геном разкри съпътстващо наследствено сърдечно заболяване — синдром на Бругада — което лекарят му потвърди чрез ЕКГ. Резултатът обясни и неизяснената сърдечна анамнеза на един член от семейството. Един тест. Всички отговори в него.
Секвениран през 2019 г. Данните бяха обработени през 2021 г.
Дженифър направи секвениране на генома си с помощта на Dante две години преди да ѝ бъде поставена диагнозата рак на гърдата. Когато започна лечението, фармакогеномните данни на Dante показаха, че предписаната ѝ химиотерапия би довела до сериозни нежелани реакции. Лекарят ѝ избра алтернативно лечение — и тя започна ефективно лечение още от първия ден.
Всеки въпрос, свързан с генетиката, заслужава изчерпателен отговор.
Независимо дали днес търсите отговори или се грижите за здравето си за утре, пълното секвениране на целия ви геном е единствената отправна точка.
Това е наследствено във вашето семейство. Сега можете да разберете дали е заложено в гените ви.
Вашият геном съдържа наследствени варианти, свързани със заболявания като сърдечни, онкологични и неврологични. Ние ги анализираме всички — с необходимата клинична задълбоченост, за да придадем смисъл на резултатите.
Научете повече →Когато традиционните лабораторни изследвания показват, че сте добре. А вие знаете, че не е така.
Стандартните диагностични тестове търсят предварително определен набор от отговори. Ние секвенираме цялата ви ДНК — включително части, за които нито един тест не е създаден да проверява. Ако отговорът се крие във вашия геном, ние ще ви помогнем да го откриете.
Научете повече →Диагнозата Ви може да е правилна. Лечебният Ви план може да е непълен.
Вашите гени определят кои лечения имат най-голям шанс да дадат резултат — и кои не. Ние предоставяме на Вашия лекар инструментите и информацията, необходими за изготвянето на Вашия лечебен план.
Научете повече →Искаш да знаеш, преди нещо да те накара да зададеш този въпрос.
Някои хора не чакат диагноза или данни за семейната анамнеза, за да предприемат действия. Секвенирането на целия геном ви предоставя пълна генетична картина още сега — така че вие и вашият лекар можете да вземете информирани решения, преди ситуацията да стане спешна.
Научете повече →Вече сте направили ДНК-тест. Ето какво той не можа да ви разкрие.
Повечето ДНК тестове за потребители анализират по-малко от 0,1% от вашия геном. Ние анализираме целия.
Научете повече →Резултати от клинично ниво. Избирани от потребителите, на които лекарите се доверяват за най-сложните си случаи.
Тестът „Dante Genome“ помогна на специалистите в национална болница за спешна помощ във Великобритания да диагностицират синдрома на Нунан и рядък генетичен вариант, свързан с левкемия, който дотогава не беше открит. Този резултат промени медицинското лечение на пациента.
Акредитирано от и публикувано в
Често задавани въпроси относно секвенирането на целия геном.
Каква е разликата между секвениране на целия геном и целеви генетичен тест?
Целевите генетични тестове — включително стандартните панели за наследствен рак — проверяват предварително определен списък от известни варианти в конкретен набор от гени. Те са предназначени да откриват това, за което вече се знае, че трябва да се търси. Секвенирането на целия геном проучва целия ви геном: всички 6 милиарда базови двойки, всеки ген, всеки регион между гените. Проучване на Mayo Clinic, публикувано в JAMA Oncology, установи, че стандартните насоки за тестване пропускат повече от половината пациенти с наследствени ракови мутации. Genome Test няма фиксиран списък.
Какво ще получа, когато резултатите ми са готови?
Вашият Dante Genome предоставя над 200 готови за използване от лекари доклада, групирани по клинични категории — наследствен рак, сърдечни заболявания, редки болести, фармакогеномика, носителство и др. Докладите се предоставят във вашия защитен Genome Manager и са форматирани за директна клинична употреба. Вашите геномни данни се съхраняват трайно и се преанализират автоматично с напредъка на науката.
Какво се случва, ако бъде открит клинично значим вариант?
Ако бъде идентифициран патогенен или вероятно патогенен вариант, той ще бъде ясно отбелязан във вашия отчет за лекари, заедно с клиничния контекст, публикуваните научни данни и препоръчаните следващи стъпки. Ние препоръчваме да споделите всяка клинично значима находка с вашия лекар или генетичен консултант, който може да ви насочи при вземането на решения относно наблюдението, намаляването на риска или каскадното тестване на членовете на семейството.
В какво се различава това от потребителски ДНК-тест като 23andMe или AncestryDNA?
ДНК тестовете за потребители използват чипове за генотипиране, които отчитат по-малко от 0,1% от вашия геном — една малка предварително подбрана група от често срещани варианти. Те са оптимизирани за определяне на произхода и за характеристики на популационно ниво, а не за клинични генетични заключения. Тестът Dante Genome секвенира 100% от вашия геном с 30-кратно покритие, същият стандарт, използван в клиничната диагностика. Двата теста не са съпоставими по обхват, методология или клинична полезност.
Колко време отнема да се получат резултатите и как се предоставят те?
Вашият комплект за вземане на проба се изпраща в рамките на 48 часа след поръчката. След като пробата Ви пристигне в нашата лаборатория, сертифицирана по CLIA, секвенирането и анализа отнемат 6–8 седмици. Резултатите се изпращат по сигурен начин в Вашия Genome Manager, където можете да разглеждате докладите си, да ги споделяте с Вашия лекар и да получавате автоматични известия при потвърждаване на нови открития във връзка с Вашия геном.
Ние си сътрудничим с организации за защита на правата на пациентите по целия свят.
Dante Labs работи с групи за защита на правата на пациентите от всякакъв мащаб — за дефицит на алфа-1-антитрипсин и други заболявания, както редки, така и често срещани. Ние подкрепяме групи във всяка страна, включително виртуални групи за защита на правата на пациентите.
Можем да ви предложим персонализирани отчети, групови отстъпки и пакети, съобразени с нуждите на вашите членове. Моля, свържете се с нас чрез формуляра и ще ви отговорим в рамките на два работни дни.
- Персонализирани геномни доклади за вашите членове
- Групови отстъпки и индивидуално съставени пакети
- Всяка държава — включително виртуални групи
- Обхванати редки и често срещани заболявания
Получих съобщението.
Ще се свържем с вас в рамките на 2 работни дни. За директна връзка: hello@dantelabs.com
Един тест.
Отговори за цял живот.
Един комплект, изпратен до вашия дом. Секвениране на целия ви геном съгласно клиничния стандарт, използван за диагностични решения. Над 200 доклада, готови за използване от лекари, които се изпращат във вашия Genome Manager в рамките на 6–8 седмици — постоянни и актуализирани в съответствие с научния напредък.
Изпраща се до 48 часа · Резултати след 6–8 седмици
