İçeriğe atla
HSA veya FSA fonlarınızı kullanın
Genomunuzu dizileyin (yeni sekmede açılır)

Gen

PGLYRP1

peptidoglycan recognition protein 1

Özet

Sitogenetik konum
19q13.32
Koordinatlar
Kromozom 19: 46.019.153–46.023.053 (GRCh38)
Eksonlar
3,9 kb boyunca 3 ekson
Protein
196 amino asit
Diğer adları
TAG7, PGRP, PGRP-S, PGRPS
Önceki semboller
TNFSF3L, PGLYRP
MANE Select transkripti
ENST00000008938.5NM_005091.3
Lokus türü
Protein kodlayan
  • Çok yüksek
  • Yüksek
  • Düşük
  • Çok düşük

Bu gen için derlenmiş ilgili raporlar

Hiçbir Genome Test raporu PGLYRP1 genini henüz okumuyor. Test tüm genomunuzu dizilediği için bu gen yine de verilerinize dahildir.

PGLYRP1 geninin yapısı

  • Kodlayan dizi
  • Çevrilmeyen bölge
  • İntron
  • Transkripsiyon yönü
Kromozom 19, PGLYRP1 genin yerini gösteren köşeli parantezle. PGLYRP1 ve yakınındaki 31 gen, kromozom 19 üzerinde, 45.521.103 ile 46.521.102 arasında.Kromozom 1919q13.32p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4345,6 Mb45,8 Mb46 Mb46,2 Mb46,4 MbVASP: 45.506.579–45.527.839, ileri iplikVASPOPA3: 45.527.767–45.602.212, geri iplikOPA3GPR4: 45.588.565–45.602.556, geri iplikGPR4EML2: 45.606.994–45.645.617, geri iplikEML2GIPR: 45.668.207–45.683.722, ileri iplikGIPRSNRPD2: 45.677.907–45.692.569, geri iplikSNRPD2QPCTL: 45.692.403–45.703.989, ileri iplikQPCTLFBXO46: 45.710.624–45.730.931, geri iplikFBXO46MEIOSIN: 45.733.439–45.764.541, ileri iplikSIX5: 45.764.767–45.769.252, geri iplikDMPK: 45.769.709–45.782.794, geri iplikDMPK: 45.779.437–45.785.973, geri iplikDMWD: 45.782.944–45.792.949, geri iplikDMWDRSPH6A: 45.795.713–45.815.308, geri iplikRSPH6ASYMPK: 45.815.410–45.866.862, geri iplikSYMPKFOXA3: 45.863.989–45.873.798, ileri iplikFOXA3IRF2BP1: 45.883.608–45.886.141, geri iplikIRF2BP1MYPOP: 45.890.020–45.902.808, geri iplikMYPOPNANOS2: 45.913.214–45.914.778, geri iplikNANOS2NOVA2: 45.933.734–45.974.044, geri iplikNOVA2CCDC61: 45.995.444–46.021.318, ileri iplikCCDC61PGLYRP1: 46.019.153–46.023.053, geri iplikPGLYRP1IGFL4: 46.039.182–46.077.118, geri iplikIGFL4IGFL2: 46.079.126–46.161.298, ileri iplikIGFL2IGFL3: 46.120.067–46.124.698, geri iplikIGFL3IGFL1: 46.229.732–46.231.243, ileri iplikIGFL1HIF3A: 46.297.026–46.343.433, ileri iplikHIF3APPP5C: 46.346.994–46.393.000, ileri iplikPPP5CCCDC8: 46.410.329–46.413.564, geri iplikCCDC8PNMA8C: 46.424.697–46.428.936, geri iplikPNMA8CPNMA8A: 46.466.491–46.471.572, geri iplikPNMA8APNMA8B: 46.486.906–46.495.879, geri iplikPNMA8BPGLYRP1 şeması: kromozom 19 üzerinde geri yönde 3 eksonEkson 3: 46.019.153–46.019.419, 267 bazEkson 2: 46.019.526–46.019.647, 122 bazEkson 1: 46.022.735–46.023.053, 319 baz3215′3′

Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.

Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).

Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.

Ekzonlar genin 3,9 kb uzunluğunun 0,7 kb'sini oluşturur; bu bazların 591 tanesi proteini kodlar.

PGLYRP1 dizilemesi

7Kolay

PGLYRP1 geninin kısa okumalarla dizilenmesinin ne kadar zor olduğu, 100 üzerinden

PGLYRP1 geninin eksonlarının neredeyse tamamı, kısa okumaların temiz biçimde eşlendiği yerlerde bulunuyor.

Buna ek olarak: PGLYRP1 geninin eksonlarının her zor bölge türündeki payı

  • Eşlenebilirlik%0
  • Homoloji%0
  • Tekrarlar%0
  • GC içeriği%65
  • Referans kapsamı%0

Dante Labs'in kendi araştırmasından elde edilen bir puan; NIST'in Genome in a Bottle haritaları, dizilemesi zor bölgeler üzerine kuruludur.Puanlama yöntemi

Dış bağlantılar

Bilgilerin kaynağı

  • HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
  • NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
  • NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.

Bu sayfayı alıntıla

APA

Dante Labs. (t.y.). PGLYRP1 geni: peptidoglycan recognition protein 1. Erişim tarihi: 18 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/pglyrp1

Vancouver

Dante Labs. PGLYRP1 geni: peptidoglycan recognition protein 1 [Internet]. [alıntı tarihi 18 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/pglyrp1

Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.

$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde

Genome Test'imi al