Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

SMG7

SMG7 nonsense mediated mRNA decay factor

Sammanfattning

Cytogenetisk position
1q25.3
Koordinater
Kromosom 1: 183 472 499–183 554 191 (GRCh38)
Exoner
23 exoner på 81,7 kb
Protein
1 187 aminosyror
Även känd som
KIAA0250, EST1C, SGA56M, SMG-7
Tidigare symboler
C1orf16
MANE Select-transkript
ENST00000688051.1NM_001375584.1
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser SMG7 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är SMG7 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 1, med en parentes där SMG7 finns. SMG7 och 8 gener i närheten på kromosom 1, från 183 013 345 till 184 013 344.Kromosom 11q25.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44183,2 Mb183,4 Mb183,6 Mb183,8 Mb184 MbLAMC1: 183 023 199–183 145 592, framåt-strängLAMC1LAMC2: 183 186 057–183 245 127, framåt-strängLAMC2NMNAT2: 183 244 571–183 418 421, bakåt-strängNMNAT2SMG7: 183 472 499–183 554 191, framåt-strängSMG7NCF2: 183 554 461–183 593 499, bakåt-strängNCF2ARPC5: 183 620 846–183 635 908, bakåt-strängARPC5RGL1: 183 636 066–183 928 532, framåt-strängRGL1APOBEC4: 183 646 275–183 653 316, bakåt-strängAPOBEC4COLGALT2: 183 929 854–184 037 777, bakåt-strängCOLGALT2Diagram över SMG7: 23 exoner på framåt-strängen av kromosom 1Exon 1: 183 472 499–183 472 649, 151 baserExon 2: 183 512 837–183 512 868, 32 baserExon 3: 183 515 874–183 515 991, 118 baserExon 4: 183 517 688–183 517 820, 133 baserExon 5: 183 526 596–183 526 767, 172 baserExon 6: 183 527 956–183 528 027, 72 baserExon 7: 183 528 892–183 529 042, 151 baserExon 8: 183 529 398–183 529 533, 136 baserExon 9: 183 533 164–183 533 326, 163 baserExon 10: 183 533 676–183 533 832, 157 baserExon 11: 183 537 145–183 537 215, 71 baserExon 12: 183 538 380–183 538 440, 61 baserExon 13: 183 540 984–183 541 103, 120 baserExon 14: 183 542 076–183 542 502, 427 baserExon 15: 183 544 353–183 544 497, 145 baserExon 16: 183 544 930–183 545 312, 383 baserExon 17: 183 545 966–183 546 337, 372 baserExon 18: 183 547 103–183 547 252, 150 baserExon 19: 183 549 208–183 549 288, 81 baserExon 20: 183 549 764–183 549 923, 160 baserExon 21: 183 550 751–183 550 921, 171 baserExon 22: 183 551 045–183 551 190, 146 baserExon 23: 183 551 818–183 554 191, 2 374 baser15101520235′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 5,9 kb av genens 81,7 kb, och 3 564 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av SMG7

1Lätt

Hur svår SMG7 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Nästan alla exoner i SMG7 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.

Det som adderar: andelen av SMG7:s exoner i varje typ av svårt område

  • Mappbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner3,1 %
  • GC-innehåll2,5 %

En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängen

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). SMG7-genen: SMG7 nonsense mediated mRNA decay factor. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/smg7

Vancouver

Dante Labs. SMG7-genen: SMG7 nonsense mediated mRNA decay factor [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/smg7

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test