Gen
RPLP0
ribosomal protein lateral stalk subunit P0
- HGNC 10371↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000089157↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 6175↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 12q24.23
- Koordinater
- Kromosom 12: 120 196 699–120 201 111 (GRCh38)
- Exoner
- 8 exoner på 4,4 kb
- Protein
- 317 aminosyror
- Även känd som
- PRLP0, P0, L10E, RPP0, LP0, uL10
- MANE Select-transkript
- ENST00000392514.9NM_001002.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rplp0.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs RPLP0, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser RPLP0 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är RPLP0 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,1 kb av genens 4,4 kb, och 954 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av RPLP0
11Måttlig
Hur svår RPLP0 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Några exoner i RPLP0 ligger där korta läsningar kan missa eller felplacera en förändring.
Det som tillkommer: andelen av RPLP0s exoner i varje typ av svår region
- KartläggbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 35.27 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 30.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, där läsningar glider och som kanske inte spänns över. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 15.6,7 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker glest. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 10.3,4 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassemblyn, där det inte finns någon sekvens för läsningarna att anpassas mot. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 10.0 %
Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts detVarje stapel är andelen av RPLP0s exonbaser i den typen av svår region. Varje enskild typ kan göra en gen svår på egen hand, och varje ytterligare typ lägger till mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). RPLP0-genen: ribosomal protein lateral stalk subunit P0. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/rplp0
Dante Labs. RPLP0-genen: ribosomal protein lateral stalk subunit P0 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/rplp0
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor