Genă
ZCCHC3
zinc finger CCHC-type containing 3
- HGNC 16230↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000247315↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 85364↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 20p13
- Coordonate
- Cromozomul 20: 297.570–300.321 (GRCh38)
- Exoni
- 1 exon pe 2,8 kb
- Proteină
- 403 de aminoacizi
- Denumiri alternative
- dJ1103G7.7
- Simboluri anterioare
- C20orf99
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000500893.4NM_033089.7
- Tip de locus
- Care codifică proteine
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/zcchc3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți ZCCHC3 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Niciun raport Genome Test nu citește încă ZCCHC3. Testul secvențiază întregul dumneavoastră genom, deci datele dumneavoastră includ totuși și această genă.
Structura genei ZCCHC3
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 2,8 kb din cei 2,8 kb ai genei; 1.212 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențiere ZCCHC3
3Ușor
Cât de greu este de secvențiat ZCCHC3 cu citiri scurte, din 100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of ZCCHC3's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of ZCCHC3's exons in each kind of hard region
- MapabilitatePorțiuni în care citirile de 100 sau 250 pb nu pot fi plasate unic, astfel că un apel acolo poate lipsi sau fi greșit. Pondere 35 %.0 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în altă parte a genomului, cum ar fi paralogii și pseudogenele, la o identitate de 90% sau mai mare. Pondere 30 %.0 %
- RepetițiiRepetiții în tandem și secvențe de o singură bază, pe care citirile alunecă și pe care s-ar putea să nu le acopere. Pondere 15 %.4,1 %
- Conținut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G și C, pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Pondere 10 %.22 %
- Acoperire de referințăGoluri în asamblarea de referință din apropiere, unde nu există secvență la care citirile să se alinieze. Pondere 10 %.0 %
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredFiecare bară reprezintă proporția bazelor exonice ale ZCCHC3 din acel tip de regiune dificilă. Scorul le ponderează după cât costă fiecare un apel cu citiri scurte: 0 când nicio bază nu se află în vreuna, 100 când fiecare bază se află în toate.
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena ZCCHC3: zinc finger CCHC-type containing 3. Accesat 18 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/zcchc3
Dante Labs. Gena ZCCHC3: zinc finger CCHC-type containing 3 [Internet]. [citat 18 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/zcchc3
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni