Genă
PLA2G12B
phospholipase A2 group XIIB
- HGNC 18555↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000138308↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 84647↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 10q22.1
- Coordonate
- Cromozomul 10: 72.934.762–72.954.806 (GRCh38)
- Exoni
- 4 de exoni pe 20 kb
- Proteină
- 195 de aminoacizi
- Simboluri anterioare
- PLA2G13
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000373032.4NM_032562.5
- Tip de locus
- Care codifică proteine
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pla2g12b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți PLA2G12B și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Niciun raport Genome Test nu citește încă PLA2G12B. Testul secvențiază întregul dumneavoastră genom, deci datele dumneavoastră includ totuși și această genă.
Structura genei PLA2G12B
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 1,6 kb din cei 20 kb ai genei; 588 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențiere PLA2G12B
0Ușor
Cât de greu este de secvențiat PLA2G12B cu citiri scurte, din 100
0 · Ușor100 · Greu
Aproape toți exonii lui PLA2G12B se află în zone unde citirile scurte se aliniază curat.
Ce adaugă: ponderea exonilor lui PLA2G12B din fiecare tip de regiune dificilă
- MapabilitatePorțiuni în care citirile de 100 sau 250 pb nu pot fi plasate unic, deci un apel acolo poate lipsi sau poate fi greșit. Pondere 35 %.0 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte părți ale genomului, cum sunt paralogii și pseudogenele, cu o identitate de 90% sau mai mare. Pondere 30 %.0 %
- RepetițiiRepetiții în tandem și secvențe de o singură bază, pe care citirile alunecă și pe care s-ar putea să nu le acopere integral. Pondere 15 %.0 %
- Conținut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G și C, pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Pondere 10 %.0 %
- Acoperire de referințăGoluri în asamblarea de referință din apropiere, unde nu există secvență cu care citirile să se alinieze. Pondere 10 %.0 %
Un scor Dante Labs din cercetarea noastră proprie, construit pe hărțile regiunilor greu de secvențiat Genome in a Bottle ale NIST.Cum se calculează scorulFiecare bară reprezintă ponderea bazelor exonice ale lui PLA2G12B din acel tip de regiune dificilă. Scorul le ponderează după cât costă fiecare un apel cu citiri scurte: 0 când nicio bază nu se află în vreuna, 100 când fiecare bază se află în toate.
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena PLA2G12B: phospholipase A2 group XIIB. Accesat 18 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/pla2g12b
Dante Labs. Gena PLA2G12B: phospholipase A2 group XIIB [Internet]. [citat 18 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/pla2g12b
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni