Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

PRR20E

proline rich 20E

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
13q21.1
Współrzędne
Chromosom 13: 57 167 197–57 170 218 (GRCh38)
Eksony
3 eksonów na odcinku 3 kb
Białko
221 aminokwasów
Transkrypt MANE Select
ENST00000434815.1NM_001130407.1
Typ locus
Kodujące białko
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu PRR20E. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu PRR20E

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 13, z nawiasem wskazującym położenie PRR20E. PRR20E i 5 genów w pobliżu na chromosomie 13, od 56 668 708 do 57 668 707.Chromosom 1313q21.1p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3456,8 Mb57 Mb57,2 Mb57,4 Mb57,6 MbPRR20C: 57 140 918–57 157 082, nić dodatniejPRR20CPRR20A: 57 140 918–57 143 939, nić dodatniejPRR20B: 57 147 488–57 150 509, nić dodatniejPRR20BPRR20D: 57 160 632–57 163 653, nić dodatniejPRR20DPRR20E: 57 167 197–57 170 218, nić dodatniejPRR20EPCDH17: 57 631 429–57 729 311, nić dodatniejPCDH17Schemat PRR20E: 3 eksonów na nici dodatniej chromosomu 13Ekson 1: 57 167 197–57 167 410, 214 zasadEkson 2: 57 167 565–57 167 635, 71 zasadEkson 3: 57 168 657–57 170 218, 1562 zasad1235′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 1,8 kb z 3 kb genu; 666 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie PRR20E

100Trudno

Jak trudno zsekwencjonować PRR20E krótkimi odczytami, w skali do 100

Duża część PRR20E znajduje się w miejscach, gdzie krótkie odczyty mogą przeoczyć zmianę lub błędnie ją umiejscowić.

Co na to wpływa: udział eksonów PRR20E w każdym rodzaju trudnego regionu

  • Mapowalność100%
  • Homologia100%
  • Wspólne z chrY0%
  • Pokrycie sekwencji referencyjnej0%
  • Powtórzenia4,7%
  • Zawartość GC21%

Wynik Dante Labs z naszych własnych badań, oparty na mapach trudnych do zsekwencjonowania regionów Genome in a Bottle z NIST.Jak obliczany jest wynik

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen PRR20E: proline rich 20E. Pobrano 20 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/prr20e

Vancouver

Dante Labs. Gen PRR20E: proline rich 20E [Internet]. [cytowano 20 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/prr20e

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test