Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

PRR20E

proline rich 20E

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
13q21.1
Koordináták
13. kromoszóma: 57 167 197–57 170 218 (GRCh38)
Exonok
3 exon, összesen 3 kb
Fehérje
221 aminosav
MANE Select transzkriptum
ENST00000434815.1NM_001130407.1
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) PRR20E gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A PRR20E felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
13. kromoszóma, a PRR20E helyét zárójel jelöli. A PRR20E és környékén 5 gén a 13. kromoszómán, 56 668 708–57 668 707 között.13. kromoszóma13q21.1p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3456,8 Mb57 Mb57,2 Mb57,4 Mb57,6 MbPRR20C: 57 140 918–57 157 082, előre szálPRR20CPRR20A: 57 140 918–57 143 939, előre szálPRR20B: 57 147 488–57 150 509, előre szálPRR20BPRR20D: 57 160 632–57 163 653, előre szálPRR20DPRR20E: 57 167 197–57 170 218, előre szálPRR20EPCDH17: 57 631 429–57 729 311, előre szálPCDH17A PRR20E ábrája: 3 exon a(z) 13. kromoszóma előre szálán1. exon: 57 167 197–57 167 410, 214 bázis2. exon: 57 167 565–57 167 635, 71 bázis3. exon: 57 168 657–57 170 218, 1562 bázis1235′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 3 kb-jából 1,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 666 bázis kódolja a fehérjét.

PRR20E szekvenálása

100Nehéz

Mennyire nehéz a PRR20E rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A PRR20E nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a PRR20E exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség100%
  • Homológia100%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések4,7%
  • GC-tartalom21%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). PRR20E gén: proline rich 20E. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/prr20e

Vancouver

Dante Labs. PRR20E gén: proline rich 20E [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/prr20e

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet