Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

L1TD1

LINE1 type transposase domain containing 1

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
1p31.3
Współrzędne
Chromosom 1: 62 194 849–62 212 328 (GRCh38)
Eksony
4 eksonów na odcinku 17,5 kb
Białko
865 aminokwasów
Znany również jako
FLJ10884, ECAT11
Transkrypt MANE Select
ENST00000498273.2NM_019079.5
Typ locus
Kodujące białko
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu L1TD1. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu L1TD1

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 1, z nawiasem wskazującym położenie L1TD1. L1TD1 i 6 genów w pobliżu na chromosomie 1, od 61 703 589 do 62 703 588.Chromosom 11p31.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4461,8 Mb62 Mb62,2 Mb62,4 Mb62,6 MbTM2D1: 61 673 636–61 725 423, nić ujemnejTM2D1PATJ: 61 742 291–62 180 553, nić dodatniejPATJL1TD1: 62 194 849–62 212 328, nić dodatniejL1TD1KANK4: 62 236 165–62 319 434, nić ujemnejKANK4USP1: 62 436 041–62 454 457, nić dodatniejUSP1DOCK7: 62 454 298–62 688 549, nić ujemnejDOCK7ANGPTL3: 62 597 464–62 607 699, nić dodatniejANGPTL3Schemat L1TD1: 4 eksonów na nici dodatniej chromosomu 1Ekson 1: 62 194 849–62 194 921, 73 zasadEkson 2: 62 196 435–62 196 528, 94 zasadEkson 3: 62 206 519–62 207 636, 1118 zasadEkson 4: 62 209 783–62 212 328, 2546 zasad12345′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 3,8 kb z 17,5 kb genu; 2598 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie L1TD1

22Umiarkowany

Stopień trudności sekwencjonowania genu L1TD1 krótkimi odczytami w skali 0–100

Niektóre eksony genu L1TD1 znajdują się w miejscach, gdzie krótkie odczyty mogą przeoczyć zmianę lub przypisać ją błędnie.

Co dokłada się do wyniku: udział eksonów genu L1TD1 w każdym rodzaju trudnego regionu

  • Mapowalność4,1%
  • Homologia64%
  • Powtórzenia7,4%
  • Zawartość GC1,2%
  • Pokrycie referencji0%

Wynik Dante Labs z własnych badań, oparty na mapach trudno sekwencjonowalnych regionów NIST Genome in a Bottle.Jak liczymy wynik

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen L1TD1: LINE1 type transposase domain containing 1. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/l1td1

Vancouver

Dante Labs. Gen L1TD1: LINE1 type transposase domain containing 1 [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/l1td1

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test