Gen
HOXB9
homeobox B9
- HGNC 5120↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000170689↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 3219↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 17q21.32
- Współrzędne
- Chromosom 17: 48 621 156–48 626 358 (GRCh38)
- Eksony
- 2 eksonów na odcinku 5,2 kb
- Białko
- 250 aminokwasów
- Poprzednie symbole
- HOX2E, HOX2
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000311177.7NM_024017.5
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hoxb9.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj HOXB9 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu HOXB9. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.
Budowa genu HOXB9
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 2,6 kb z 5,2 kb genu; 753 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie HOXB9
4Łatwe
Stopień trudności sekwencjonowania HOXB9 krótkimi odczytami, w skali do 100
0 · Łatwe100 · Trudne
Niemal wszystkie eksony HOXB9 leżą w miejscach, gdzie krótkie odczyty dopasowują się jednoznacznie.
Co na to wpływa: udział eksonów HOXB9 w każdym rodzaju trudnego regionu
- MapowalnośćOdcinki, w których odczytów 100 lub 250 pz nie da się jednoznacznie umieścić, więc wykryta tam zmiana może być niepełna lub błędna. Waga: 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentowe: kopie w innych częściach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub większej. Waga: 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Waga: 15%.3,6%
- Zawartość GCOkna z poniżej 25% lub powyżej 65% G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Waga: 10%.31%
- Pokrycie referencjiLuki w pobliskim składzie sekwencji referencyjnej, w których brak sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Waga: 10%.0%
Wynik Dante Labs oparty na naszych własnych badaniach, zbudowany na mapach trudnych do sekwencjonowania regionów Genome in a Bottle instytutu NIST.Jak to jest ocenianeKażdy słupek to udział zasad eksonów HOXB9 w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je według tego, o ile każda z nich utrudnia wywołanie zmiany przez krótkie odczyty: 0, gdy żadna zasada nie leży w żadnym takim regionie, 100, gdy każda zasada leży we wszystkich.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen HOXB9: homeobox B9. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/hoxb9
Dante Labs. Gen HOXB9: homeobox B9 [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/hoxb9
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni