Gen
TMED6
transmembrane p24 trafficking protein 6
- HGNC 28331↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000157315↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 146456↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 16q22.1
- Koordinater
- Kromosom 16: 69 343 250–69 351 786 (GRCh38)
- Eksoner
- 4 eksoner over 8,5 kb
- Protein
- 240 aminosyrer
- Også kjent som
- MGC23911, p24gamma5, p24g5
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000288025.4NM_144676.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tmed6.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes TMED6 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Ingen Genome Test-rapport leser TMED6 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.
Slik er TMED6 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 0,9 kb av genets 8,5 kb, og 723 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av TMED6
0Lett
Hvor vanskelig TMED6 er å sekvensere med korte leser, av 100
0 · Lett100 · Vanskelig
Nesten alle eksonene i TMED6 ligger der korte leser kartlegges uten problemer.
Det som bidrar: andelen av eksonene i TMED6 i hver type vanskelig område
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, så et kall der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.0 %
- GC-innholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksprepareringen dekker tynt. Vekt 10 %.0 %
- ReferansedekningHull i referansesammenstillingen i nærheten, der det ikke finnes sekvens for leser å justeres mot. Vekt 10 %.0 %
En Dante Labs-poengsum basert på vår egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over områder som er vanskelige å sekvensere.Slik beregnes poengsummenHver søyle er andelen av eksonbasene til TMED6 i den typen vanskelig område. Poengsummen vekter dem etter hvor mye hver koster for et kall med korte leser: 0 når ingen base er i noen, 100 når hver base er i alle.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Klinisk
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). TMED6-genet: transmembrane p24 trafficking protein 6. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/tmed6
Dante Labs. TMED6-genet: transmembrane p24 trafficking protein 6 [Internett]. [sitert 18. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/tmed6
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker