Gen
RNU2-63P
RNA, U2 small nuclear 63, pseudogene
- HGNC 48556↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000222724↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 106480225↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 2p11.2
- Koordinater
- Kromosom 2: 88 016 358–88 016 547 (GRCh38)
- Eksoner
- 1 ekson over 0,2 kb
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000410792.2NR_199865.1
- Lokustype
- Pseudogen
Share this page
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu2-63p.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes RNU2-63P og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Ingen Genome Test-rapport leser RNU2-63P ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.
Slik er RNU2-63P bygget opp
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 0,2 kb av genets 0,2 kb.
Sekvensering av RNU2-63P
0Lett
Hvor vanskelig RNU2-63P er å sekvensere med korte leser, av 100
0 · Lett100 · Vanskelig
Nesten alle eksonene til RNU2-63P ligger der korte leser kan kartlegges uten problemer.
Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til RNU2-63P i hver type vanskelig område
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, slik at en variant der kan mangle eller være feil. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 100.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 60.0 %
- Delt med chrYDe pseudoautosomale områdene og det X-transponerte området, der chrX og chrY har samme eller nesten samme sekvens, slik at en lesing fra den ene kan plasseres på den andre. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 60.0 %
- ReferansedekningHull i referanseassemblyen i nærheten, der det ikke finnes sekvens for leser å justere mot. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 50.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 30.0 %
- GC-innholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 20.0 %
En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummenHver søyle er andelen av eksonbasene til RNU2-63P i den typen vanskelig område. Hver enkelt type kan gjøre et gen vanskelig alene, og hver ekstra type legger til mindre: 0 når ingen base er i noen, 100 når alle baser er der leser ikke kan plasseres entydig.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Klinisk
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). RNU2-63P-genet: RNA, U2 small nuclear 63, pseudogene. Hentet 21. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/rnu2-63p
Dante Labs. RNU2-63P-genet: RNA, U2 small nuclear 63, pseudogene [Internett]. [sitert 21. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/rnu2-63p
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker