Gen
RNU2-63P
RNA, U2 small nuclear 63, pseudogene
- HGNC 48556↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000222724↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 106480225↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 2p11.2
- Koordinater
- Kromosom 2: 88.016.358–88.016.547 (GRCh38)
- Exoner
- 1 exon fordelt over 0,2 kb
- MANE Select-transkript
- ENST00000410792.2NR_199865.1
- Lokustype
- Pseudogen
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu2-63p.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs RNU2-63P og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Ingen Genome Test-rapport læser RNU2-63P endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.
Sådan er RNU2-63P opbygget
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 0,2 kb af genets 0,2 kb.
Sekventering af RNU2-63P
0Let
Hvor svær RNU2-63P er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Let100 · Svær
Næsten alle eksonerne i RNU2-63P ligger, hvor korte reads kan kortlægges uden problemer.
Det der forstærker det: andelen af RNU2-63Ps eksoner i hver type svært område
- MappabilityStrækninger, hvor 100 eller 250 bp reads ikke kan placeres entydigt, så et kald der hører til her, kan mangle eller være forkert. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 100.0 %
- HomologiSegmentale duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 60.0 %
- Delt med chrYDe pseudoautosomale regioner og den X-transponerede region, hvor chrX og chrY har den samme eller næsten samme sekvens, så et read fra den ene kan blive placeret på den anden. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 60.0 %
- ReferencedækningHuller i referenceassemblyet i nærheden, hvor der ikke findes nogen sekvens, reads kan justeres til. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 50.0 %
- GentagelserTandemgentagelser og løb af én base, som reads glider på og måske ikke spænder over. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 30.0 %
- GC-indholdVinduer under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Alene ville et gen, der helt ligger i denne type region, få en score på 20.0 %
En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores detHver søjle er andelen af RNU2-63Ps eksonbaser i den type svære region. En enkelt type kan alene gøre et gen svært, og hver ekstra type tilføjer mindre: 0, når ingen base er i nogen, 100, når alle baser ligger, hvor reads ikke kan placeres entydigt.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Klinisk
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). RNU2-63P-genet: RNA, U2 small nuclear 63, pseudogene. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/rnu2-63p
Dante Labs. RNU2-63P-genet: RNA, U2 small nuclear 63, pseudogene [Internet]. [citeret 19. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/rnu2-63p
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger