Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

PTP4A2

protein tyrosine phosphatase 4A2

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
1p35.2
Koordinater
Kromosom 1: 31 906 421–31 938 368 (GRCh38)
Eksoner
6 eksoner over 31,9 kb
Protein
167 aminosyrer
Også kjent som
HU-PP-1, PTPCAAX2, OV-1, ptp-IV1a, PRL-2, PRL2
Tidligere symboler
PTP4A
MANE Select-transkripsjon
ENST00000647444.2NM_080391.4
Lokustype
Proteinkodende
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser PTP4A2 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er PTP4A2 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 1, med en parentes der PTP4A2 står. PTP4A2 og 24 gener i nærheten på kromosom 1, fra 31 422 395 til 32 422 394.Kromosom 11p35.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4431,6 Mb31,8 Mb32 Mb32,2 Mb32,4 MbSERINC2: 31 409 565–31 434 680, fremover-strengSERINC2TINAGL1: 31 576 357–31 587 691, fremover-strengTINAGL1HCRTR1: 31 617 660–31 632 518, fremover-strengHCRTR1PEF1: 31 629 862–31 644 910, bakover-strengPEF1COL16A1: 31 652 247–31 704 387, bakover-strengCOL16A1ADGRB2: 31 727 117–31 764 893, bakover-strengADGRB2SPOCD1: 31 790 421–31 816 022, bakover-strengSPOCD1PTP4A2: 31 906 421–31 938 368, bakover-strengPTP4A2: 31 919 563–31 938 010, bakover-strengKHDRBS1: 32 013 687–32 060 850, fremover-strengKHDRBS1TMEM39B: 32 072 031–32 102 866, fremover-strengTMEM39BKPNA6: 32 108 028–32 176 563, fremover-strengKPNA6TXLNA: 32 178 097–32 198 299, fremover-strengTXLNACCDC28B: 32 200 383–32 205 453, fremover-strengCCDC28BIQCC: 32 205 638–32 208 688, fremover-strengIQCCDCDC2B: 32 209 079–32 216 196, fremover-strengDCDC2BTMEM234: 32 214 432–32 222 361, bakover-strengEIF3I: 32 221 077–32 245 397, fremover-strengFAM167B: 32 247 215–32 248 856, fremover-strengLCK: 32 251 244–32 286 170, fremover-strengLCKHDAC1: 32 291 919–32 333 635, fremover-strengHDAC1MARCKSL1: 32 333 564–32 336 241, bakover-strengMARCKSL1TSSK3: 32 351 521–32 364 312, fremover-strengTSSK3FAM229A: 32 361 270–32 364 278, bakover-strengFAM229ABSDC1: 32 364 633–32 394 731, bakover-strengBSDC1Diagram av PTP4A2: 6 eksoner på bakover-strengen til kromosom 1Ekson 6: 31 906 421–31 908 960, 2 540 baserEkson 5: 31 910 038–31 910 112, 75 baserEkson 4: 31 911 696–31 911 826, 131 baserEkson 3: 31 915 895–31 915 987, 93 baserEkson 2: 31 918 970–31 919 658, 689 baserEkson 1: 31 937 987–31 938 368, 382 baser6543215′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 3,9 kb av genets 31,9 kb, og 504 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av PTP4A2

27Moderat

Hvor vanskelig PTP4A2 er å sekvensere med korte leser, av 100

Noen av eksonene i PTP4A2 ligger der korte leser kan overse eller feilplassere en endring.

Det som bidrar: andelen av eksonene i PTP4A2 i hver type vanskelig område

  • Kartleggbarhet10 %
  • Homologi65 %
  • Repetisjoner18 %
  • GC-innhold16 %
  • Referansedekning0 %

En Dante Labs-poengsum basert på vår egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over områder som er vanskelige å sekvensere.Slik beregnes poengsummen

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). PTP4A2-genet: protein tyrosine phosphatase 4A2. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/ptp4a2

Vancouver

Dante Labs. PTP4A2-genet: protein tyrosine phosphatase 4A2 [Internett]. [sitert 18. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/ptp4a2

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test