Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

CTHRC1

collagen triple helix repeat containing 1

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
8q22.3
Koordinater
Kromosom 8: 103 371 538–103 382 989 (GRCh38)
Eksoner
4 eksoner over 11,5 kb
Protein
243 aminosyrer
MANE Select-transkripsjon
ENST00000330295.10NM_138455.4
Lokustype
Proteinkodende
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser CTHRC1 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er CTHRC1 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
Kromosom 8, med en parentes der CTHRC1 står. CTHRC1 og 8 gener i nærheten på kromosom 8, fra 102 877 264 til 103 877 263.Kromosom 88q22.3p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.3103 Mb103,2 Mb103,4 Mb103,6 Mb103,8 MbAZIN1: 102 823 965–102 893 864, bakover-strengAZIN1ATP6V1C1: 103 021 050–103 073 683, fremover-strengATP6V1C1BAALC: 103 140 370–103 248 401, fremover-strengBAALCFZD6: 103 298 433–103 332 866, fremover-strengFZD6CTHRC1: 103 371 538–103 382 989, fremover-strengCTHRC1SLC25A32: 103 398 635–103 415 189, bakover-strengSLC25A32: 103 398 658–103 501 895, bakover-strengDCAF13: 103 414 651–103 443 845, fremover-strengDCAF13RIMS2: 103 499 638–104 254 698, fremover-strengRIMS2Diagram av CTHRC1: 4 eksoner på fremover-strengen til kromosom 8Ekson 1: 103 371 538–103 371 806, 269 baserEkson 2: 103 375 738–103 375 959, 222 baserEkson 3: 103 378 027–103 378 243, 217 baserEkson 4: 103 382 458–103 382 989, 532 baser12345′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 1,2 kb av genets 11,5 kb, og 732 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av CTHRC1

10Lett

Hvor vanskelig CTHRC1 er å sekvensere med korte leser, av 100

Nesten alle eksonene til CTHRC1 ligger der korte leser kan kartlegges uten problemer.

Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til CTHRC1 i hver type vanskelig område

  • Kartleggbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Delt med chrY0 %
  • Referansedekning0 %
  • Repetisjoner10 %
  • GC-innhold37 %

En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummen

Egenskaper knyttet til CTHRC1

The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene CTHRC1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
  • The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). CTHRC1-genet: collagen triple helix repeat containing 1. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/cthrc1

Vancouver

Dante Labs. CTHRC1-genet: collagen triple helix repeat containing 1 [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/cthrc1

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test