Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

ARHGEF5

Rho guanine nucleotide exchange factor 5

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
7q35
Koordinater
Kromosom 7: 144 355 402–144 380 632 (GRCh38)
Eksoner
15 eksoner over 25,2 kb
Protein
1 597 aminosyrer
Også kjent som
TIM, TIM1, GEF5, P60
MANE Select-transkripsjon
ENST00000056217.10NM_005435.4
Lokustype
Proteinkodende
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser ARHGEF5 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er ARHGEF5 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 7, med en parentes der ARHGEF5 står. ARHGEF5 og 17 gener i nærheten på kromosom 7, fra 143 868 017 til 144 868 016.Kromosom 77q35p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.3144 Mb144,2 Mb144,4 Mb144,6 Mb144,8 MbTCAF1: 143 850 360–143 903 890, bakover-strengTCAF1OR2F2: 143 935 233–143 936 186, fremover-strengOR2F2OR2F1: 143 954 844–143 997 312, fremover-strengOR2F1OR6B1: 144 000 320–144 008 793, fremover-strengOR6B1OR2A5: 144 048 948–144 058 845, fremover-strengOR2A5OR2A25: 144 069 811–144 075 870, fremover-strengOR2A25OR2A12: 144 086 278–144 098 953, fremover-strengOR2A12OR2A2: 144 109 583–144 110 539, fremover-strengOR2A2OR2A14: 144 123 176–144 131 188, fremover-strengOR2A14ARHGEF35: 144 182 888–144 195 879, bakover-strengARHGEF35CTAGE4: 144 183 466–144 186 080, fremover-strengCTAGE4OR2A42: 144 228 244–144 239 605, bakover-strengOR2A42OR2A7: 144 254 975–144 264 792, bakover-strengOR2A7CTAGE8: 144 266 674–144 269 288, bakover-strengCTAGE8OR2A1: 144 312 419–144 322 737, fremover-strengOR2A1ARHGEF5: 144 355 402–144 380 632, fremover-strengARHGEF5NOBOX: 144 396 894–144 403 795, bakover-strengNOBOXTPK1: 144 451 941–144 836 419, bakover-strengTPK1Diagram av ARHGEF5: 15 eksoner på fremover-strengen til kromosom 7Ekson 1: 144 355 402–144 355 501, 100 baserEkson 2: 144 362 658–144 365 823, 3 166 baserEkson 3: 144 366 355–144 366 412, 58 baserEkson 4: 144 366 846–144 366 910, 65 baserEkson 5: 144 367 102–144 367 355, 254 baserEkson 6: 144 371 161–144 371 321, 161 baserEkson 7: 144 371 877–144 372 029, 153 baserEkson 8: 144 372 299–144 372 428, 130 baserEkson 9: 144 372 683–144 372 757, 75 baserEkson 10: 144 373 195–144 373 284, 90 baserEkson 11: 144 374 732–144 374 889, 158 baserEkson 12: 144 375 514–144 375 675, 162 baserEkson 13: 144 377 120–144 377 190, 71 baserEkson 14: 144 378 762–144 378 866, 105 baserEkson 15: 144 379 899–144 380 632, 734 baser12468101214155′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 5,5 kb av genets 25,2 kb, og 4 794 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av ARHGEF5

93Vanskelig

Hvor vanskelig ARHGEF5 er å sekvensere med korte leser, av 100

Mye av ARHGEF5 ligger der korte leser kan overse eller feilplassere en endring.

Det som bidrar: andelen av eksonene til ARHGEF5 i hver type vanskelig område

  • Kartleggbarhet85 %
  • Homologi85 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referansedekning0 %
  • Repetisjoner1,4 %
  • GC-innhold13 %

En Dante Labs-score basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummen

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). ARHGEF5-genet: Rho guanine nucleotide exchange factor 5. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/arhgef5

Vancouver

Dante Labs. ARHGEF5-genet: Rho guanine nucleotide exchange factor 5 [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/arhgef5

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test