Dante Omics AI har, sammen med Rockefeller University, Giunta Lab og et nettverk av globale partnere, satt sammen det mest komplette og nøyaktige diploide referansegenomet for RPE-1-cellelinjen – en av de mest brukte standardene for komplekse celletekniske eksperimenter.
Denne milepælen gir forskere over hele verden en ekte «kildekode», og låser opp dypere innsikt i strukturell kompleksitet, genomisk stabilitet og CRISPR-basert ingeniørkunst.
Hvorfor dette er viktig
RPE-1-linjen er en global referanse innen cellebiologi, kreftforskning og genomredigering. Likevel har genomet frem til nå vært ufullstendig, noe som har gjort viktige regioner uskarpe eller manglende.
Vår nye forsamling endrer dette:
► Diploid fullstendighet – både mors- og farshaplotyper oppløst på tvers av kromosomer. ► Ultrahøy nøyaktighet – > 99,9999 % på flere kromosomer. ► Full dekning av komplekse regioner – sentromerer, repetisjoner og strukturelt utfordrende DNA nå kartlagt. ► Integrasjon på flere plattformer – data fra Illumina short reads, PacBio HiFi, Oxford Nanopore long reads og komplementære ressurser. ► Åpen tilgang – montering RPE1v1.1 er nå tilgjengelig via NCBI og UCSC Genome Browser.
En samarbeidsbasert prestasjon
Dette prosjektet var kun mulig takket være den samlede ekspertisen til et globalt konsortium, inkludert:
Rockefeller UniversityGiunta LabSapienza University of RomeUniversity of TennesseeTrieste Area Science ParkUniversity of L'AquilaDante Omics AI
Som Andrea Riposati, administrerende direktør i Dante Omics AI, forklarte: «Se for deg feilsøkingsprogramvare uten deler av kildekoden. Med denne sammenstillingen har forskere endelig en komplett og nøyaktig 'kildekode' for RPE-1-celler – helt ned til de mest komplekse områdene som var usynlige før.»
Implikasjoner for vitenskap og medisin
En ny standard for celleutvikling: CRISPR og andre redigeringsteknikker kan nå stole på en mer pålitelig referanse. Dypere utforskning av DNA-kompleksitet: sentromerer og repetisjoner, som tidligere var utilgjengelige, er nå åpne for studier. Bredere innvirkning på tvers av forskningsfelt: fra onkologi til syntetisk biologi forbedrer dette genomet presisjonen i eksperimenter over hele verden. En modell for fremtidige sammenstillinger: tilnærmingen kan utvides til andre cellelinjer og arter.
Konklusjon
«Fra uskarpt til 4K DNA» er mer enn en overskrift – det markerer et vendepunkt for genomforskning. Ved å kombinere AI-akselerert multiomikk med banebrytende sekvenseringsteknologier har Dante Omics AI og partnerne levert den tydeligste genomiske blåkopien hittil for en av biologiens viktigste cellemodeller.
➡ Les pressemeldingen på BusinessWire
Få nye innlegg fra Dante Labs
Genomikkinnsikt, produktoppdateringer og kliniske perspektiver – levert til innboksen din.
