Ga naar de inhoud
Gebruik uw HSA- of FSA-tegoed
Laat uw genoom in kaart brengen (opent in een nieuw tabblad)

Gen

POU2F1

POU class 2 homeobox 1

Samenvatting

Cytogenetische locatie
1q24.2
Coördinaten
Chromosoom 1: 167.220.886–167.427.340 (GRCh38)
Exons
16 exons over 206,5 kb
Eiwit
766 aminozuren
Ook bekend als
OCT1
Eerdere symbolen
OTF1
MANE Select-transcript
ENST00000367866.7NM_002697.4
Type locus
Eiwitcoderend
  • Zeer hoog
  • Betrouwbaar
  • Laag
  • Zeer laag

Gecureerde rapporten over dit gen

Geen enkel Genome Test-rapport leest POU2F1 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.

Opbouw van POU2F1

  • Coderende sequentie
  • Niet-vertaald gebied
  • Intron
  • Richting van transcriptie
  • Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Chromosoom 1, met een haakje waar POU2F1 zich bevindt. POU2F1 en 11 genen in de buurt op chromosoom 1, van 166.824.113 tot 167.824.112.Chromosoom 11q24.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44167 Mb167,2 Mb167,4 Mb167,6 Mb167,8 MbPOGK: 166.839.314–166.863.955, voorwaartse-strengPOGKTADA1: 166.856.375–166.876.360, omgekeerde-strengTADA1ILDR2: 166.895.711–166.975.626, omgekeerde-strengILDR2MAEL: 166.975.582–167.022.214, voorwaartse-strengMAELGPA33: 167.048.289–167.166.479, omgekeerde-strengGPA33STYXL2: 167.094.069–167.129.209, voorwaartse-strengSTYXL2POU2F1: 167.220.886–167.427.340, voorwaartse-strengPOU2F1CD247: 167.425.027–167.518.640, omgekeerde-strengCD247CREG1: 167.527.807–167.553.822, omgekeerde-strengCREG1RCSD1: 167.629.660–167.708.706, voorwaartse-strengRCSD1MPZL1: 167.721.192–167.794.612, voorwaartse-strengMPZL1ADCY10: 167.809.098–167.914.215, omgekeerde-strengADCY10Diagram van POU2F1: 16 exons op de voorwaartse streng van chromosoom 1Exon 1: 167.220.886–167.220.958, 73 basenExon 2: 167.332.470–167.332.535, 66 basenExon 3: 167.365.467–167.365.567, 101 basenExon 4: 167.370.161–167.370.214, 54 basenExon 5: 167.371.917–167.372.036, 120 basenExon 6: 167.374.108–167.374.296, 189 basenExon 7: 167.376.029–167.376.155, 127 basenExon 8: 167.383.857–167.383.951, 95 basenExon 9: 167.389.588–167.389.761, 174 basenExon 10: 167.396.286–167.396.427, 142 basenExon 11: 167.397.994–167.398.133, 140 basenExon 12: 167.399.186–167.399.365, 180 basenExon 13: 167.401.451–167.401.556, 106 basenExon 14: 167.411.959–167.412.304, 346 basenExon 15: 167.413.026–167.413.114, 89 basenExon 16: 167.415.500–167.427.340, 11.841 basen151015165′3′

Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.

Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).

Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.

Exonen vormen 13,8 kb van de 206,5 kb van het gen; 2.301 van die basen coderen voor het eiwit.

Sequencing POU2F1

1Makkelijk

Hoe moeilijk POU2F1 is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100

Bijna alle exonen van POU2F1 liggen op plaatsen waar korte reads schoon in kaart worden gebracht.

Wat er nog bij komt: het aandeel van de exonen van POU2F1 in elk soort moeilijke regio

  • Mappability0%
  • Homologie0%
  • Herhalingen7,3%
  • GC-gehalte1,8%
  • Referentiedekking0%

Een score van Dante Labs op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Hoe de score wordt berekend

Externe links

Waar dit vandaan komt

  • HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
  • MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
  • De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.

Deze pagina citeren

APA

Dante Labs. (z.d.). POU2F1-gen: POU class 2 homeobox 1. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/pou2f1

Vancouver

Dante Labs. POU2F1-gen: POU class 2 homeobox 1 [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/pou2f1

Eén test. Een leven lang antwoorden.

Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken

Mijn Genome Test bestellen