Ga naar de inhoud
Gebruik uw HSA- of FSA-tegoed
Laat uw genoom in kaart brengen (opent in een nieuw tabblad)

Gen

PMAIP1

phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1

Samenvatting

Cytogenetische locatie
18q21.32
Coördinaten
Chromosoom 18: 59.899.996–59.904.305 (GRCh38)
Exons
2 exons over 4,3 kb
Eiwit
54 aminozuren
Ook bekend als
APR, NOXA
MANE Select-transcript
ENST00000316660.7NM_021127.3
Type locus
Eiwitcoderend
  • Zeer hoog
  • Betrouwbaar
  • Laag
  • Zeer laag

Gecureerde rapporten over dit gen

Geen enkel Genome Test-rapport leest PMAIP1 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.

Opbouw van PMAIP1

  • Coderende sequentie
  • Niet-vertaald gebied
  • Intron
  • Richting van transcriptie
Chromosoom 18, met een haakje waar PMAIP1 zich bevindt. PMAIP1 en 2 genen in de buurt op chromosoom 18, van 59.402.151 tot 60.402.150.Chromosoom 1818q21.32p11.32p11.31p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q2359,6 Mb59,8 Mb60 Mb60,2 Mb60,4 MbCCBE1: 59.430.939–59.698.154, omgekeerde-strengCCBE1PMAIP1: 59.899.996–59.904.305, voorwaartse-strengPMAIP1MC4R: 60.371.062–60.372.775, omgekeerde-strengMC4RDiagram van PMAIP1: 2 exons op de voorwaartse streng van chromosoom 18Exon 1: 59.899.996–59.900.235, 240 basenExon 2: 59.902.647–59.904.305, 1.659 basen125′3′

Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.

Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).

Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.

Exonen vormen 1,9 kb van de 4,3 kb van het gen; 165 van die basen coderen voor het eiwit.

Sequencing PMAIP1

4Makkelijk

Hoe moeilijk PMAIP1 is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100

Bijna alle exonen van PMAIP1 liggen op plaatsen waar korte reads schoon in kaart worden gebracht.

Wat er nog bij komt: het aandeel van de exonen van PMAIP1 in elk soort moeilijke regio

  • Mappability0%
  • Homologie0%
  • Herhalingen11%
  • GC-gehalte26%
  • Referentiedekking0%

Een score van Dante Labs op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Hoe de score wordt berekend

Externe links

Waar dit vandaan komt

  • HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
  • MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
  • De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.

Deze pagina citeren

APA

Dante Labs. (z.d.). PMAIP1-gen: phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/pmaip1

Vancouver

Dante Labs. PMAIP1-gen: phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/pmaip1

Eén test. Een leven lang antwoorden.

Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken

Mijn Genome Test bestellen