Ga naar de inhoud
Gebruik uw HSA- of FSA-tegoed
Laat uw genoom in kaart brengen (opent in een nieuw tabblad)

Gen

PLEKHG4B

pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G4B

Samenvatting

Cytogenetische locatie
5p15.33
Coördinaten
Chromosoom 5: 92.168–189.966 (GRCh38)
Exons
20 exons over 97,8 kb
Eiwit
1.627 aminozuren
Ook bekend als
KIAA1909, ARHGEF48
MANE Select-transcript
ENST00000637938.2NM_052909.5
Type locus
Eiwitcoderend
  • Zeer hoog
  • Betrouwbaar
  • Laag
  • Zeer laag

Gecureerde rapporten over dit gen

Geen enkel Genome Test-rapport leest PLEKHG4B nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.

Opbouw van PLEKHG4B

  • Coderende sequentie
  • Niet-vertaald gebied
  • Intron
  • Richting van transcriptie
  • Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Chromosoom 5, met een haakje waar PLEKHG4B zich bevindt. PLEKHG4B en 10 genen in de buurt op chromosoom 5, van 1 tot 641.066.Chromosoom 55p15.33p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.30,1 Mb0,2 Mb0,3 Mb0,4 Mb0,5 Mb0,6 MbPLEKHG4B: 92.168–189.966, voorwaartse-strengPLEKHG4BLRRC14B: 191.451–196.334, voorwaartse-strengLRRC14BCCDC127: 196.868–218.162, omgekeerde-strengCCDC127SDHA: 218.206–257.084, voorwaartse-strengSDHA: 218.298–314.955, voorwaartse-strengPDCD6: 271.452–314.978, voorwaartse-strengPDCD6PDCD6-AHRR: 271.670–438.291, voorwaartse-strengPDCD6-AHRRAHRR: 320.682–438.307, voorwaartse-strengAHRREXOC3: 442.522–471.939, voorwaartse-strengEXOC3SLC9A3: 470.456–524.450, omgekeerde-strengSLC9A3CEP72: 612.305–667.703, voorwaartse-strengCEP72Diagram van PLEKHG4B: 20 exons op de voorwaartse streng van chromosoom 5Exon 1: 92.168–92.276, 109 basenExon 2: 113.251–113.448, 198 basenExon 3: 139.483–140.716, 1.234 basenExon 4: 143.047–143.256, 210 basenExon 5: 143.380–143.503, 124 basenExon 6: 144.827–144.920, 94 basenExon 7: 151.513–151.599, 87 basenExon 8: 154.875–154.991, 117 basenExon 9: 155.345–155.443, 99 basenExon 10: 156.071–156.210, 140 basenExon 11: 156.773–156.911, 139 basenExon 12: 161.783–161.944, 162 basenExon 13: 162.722–163.548, 827 basenExon 14: 169.340–169.592, 253 basenExon 15: 171.043–171.132, 90 basenExon 16: 171.214–171.444, 231 basenExon 17: 172.897–173.067, 171 basenExon 18: 173.918–174.098, 181 basenExon 19: 181.514–181.675, 162 basenExon 20: 182.004–189.966, 7.963 basen151015205′3′

Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.

Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).

Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.

Exonen vormen 12,6 kb van de 97,8 kb van het gen; 4.884 van die basen coderen voor het eiwit.

Sequencing PLEKHG4B

5Makkelijk

Hoe moeilijk PLEKHG4B is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100

Bijna alle exonen van PLEKHG4B liggen op plaatsen waar korte reads schoon in kaart worden gebracht.

Wat er nog bij komt: het aandeel van de exonen van PLEKHG4B in elk soort moeilijke regio

  • Mappability0,2%
  • Homologie0%
  • Herhalingen4,2%
  • GC-gehalte39%
  • Referentiedekking0%

Een score van Dante Labs op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Hoe de score wordt berekend

Externe links

Waar dit vandaan komt

  • HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
  • MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
  • De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.

Deze pagina citeren

APA

Dante Labs. (z.d.). PLEKHG4B-gen: pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G4B. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/plekhg4b

Vancouver

Dante Labs. PLEKHG4B-gen: pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G4B [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/plekhg4b

Eén test. Een leven lang antwoorden.

Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken

Mijn Genome Test bestellen