Gen
KRTAP5-7
keratin associated protein 5-7
- HGNC 23602↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000244411↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 440050↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 11q13.4
- Coördinaten
- Chromosoom 11: 71.527.267–71.528.669 (GRCh38)
- Exons
- 1 exon over 1,4 kb
- Eiwit
- 165 aminozuren
- Ook bekend als
- KRTAP5.7, KRTAP5-3
- MANE Select-transcript
- ENST00000398536.6NM_001012503.2
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/krtap5-7.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees KRTAP5-7 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Geen enkel Genome Test-rapport leest KRTAP5-7 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.
Opbouw van KRTAP5-7
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 1,4 kb van de 1,4 kb van het gen; 498 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing KRTAP5-7
70Moeilijk
Hoe moeilijk KRTAP5-7 is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100
0 · Makkelijk100 · Moeilijk
Een groot deel van KRTAP5-7 ligt op plaatsen waar korte reads een wijziging kunnen missen of verkeerd plaatsen.
Wat er nog bij komt: het aandeel van de exonen van KRTAP5-7 in elk soort moeilijke regio
- MappabilityStukken waar reads van 100 of 250 bp niet uniek kunnen worden geplaatst, zodat een call daar mogelijk ontbreekt of fout is. Gewicht 100%.12%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, bij 90% identiteit of meer. Gewicht 60%.100%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Gewicht 60%.0%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentie-assemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen uitlijnen. Gewicht 50%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen verschuiven en die mogelijk niet volledig worden overspannen. Gewicht 30%.36%
- GC-gehalteVensters met minder dan 25% of meer dan 65% G en C, die de bibliotheekbereiding dun dekt. Gewicht 20%.22%
Een score van Dante Labs op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Hoe de score wordt berekendElke balk is het aandeel van de exonbasen van KRTAP5-7 in dat soort moeilijke regio. Elk soort kan op zichzelf een gen moeilijk maken, en elk extra soort voegt steeds minder toe: 0 als geen enkele base in een regio ligt, 100 als elke base op een plek ligt waar reads niet uniek kunnen worden geplaatst.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). KRTAP5-7-gen: keratin associated protein 5-7. Geraadpleegd op 19 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/krtap5-7
Dante Labs. KRTAP5-7-gen: keratin associated protein 5-7 [Internet]. [geraadpleegd 19 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/krtap5-7
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken