FAMILIAIR MELANOOM — CDKN2A

Familiaal melanoom — Een functieverlies van het CDKN2A-gen dat gepaard gaat met een levenslang risico op melanoom van 60-90% en een verhoogd risico op alvleesklierkanker; dit wordt vaak afgedaan als een cluster van kankergevallen in de familie, in plaats van erkend te worden als een erfelijk syndroom.

Bij volledige genoomsequencing wordt het volledige CDKN2A-gen gesequenced — dat via alternatieve leeskaders codeert voor twee verschillende tumorsuppressoren (p16/INK4a en p14/ARF) — waardoor alle varianten worden geïdentificeerd, inclusief de herschikkingen die bij standaardpanelsequencing over het hoofd worden gezien.

CLIA-gecertificeerd CAP-gecertificeerd ISO 15189 Medisch laboratorium ACMG-vacatures HIPAA en AVG Meer dan 100.000genoomsequenties
OVER FAMILIAIR MELANOOM — CDKN2A

Familiaal melanoom — CDKN2A

Het familiair atypisch multipel moedervlek- en melanoomsyndroom (FAMMM) is een autosomaal dominant erfelijk syndroom dat de vatbaarheid voor kanker verhoogt en meestal wordt veroorzaakt door pathogene varianten in de kiembaan van het CDKN2A-gen op chromosoom 9p21.3. CDKN2A codeert voor twee verschillende tumorsuppressoreiwitten via alternatieve leeskaders: p16/INK4a (gecodeerd door exonen 1α, 2 en 3), dat CDK4/6 remt en de voortgang van de celcyclus voorkomt, en p14/ARF (gecodeerd door exonen 1β, 2 en 3), dat p53 stabiliseert. Pathogene varianten in CDKN2A zijn verantwoordelijk voor ongeveer 20-40% van de families met 3 of meer gevallen van melanoom en komen voor bij een aanzienlijk deel van de personen met meerdere primaire melanomen. Pathogene varianten in CDK4 veroorzaken een vrijwel identiek klinisch syndroom bij een minderheid van de gevallen van familiair melanoom.

Het levenslange risico op melanoom bij dragers van pathogene varianten van het CDKN2A-gen varieert van ongeveer 28-67% in regio’s met een lage incidentie tot 58-92% in regio’s met een hoge blootstelling aan UV-straling (met name Australië). De mediane leeftijd bij de eerste diagnose van melanoom ligt bij CDKN2A-dragers aanzienlijk lager dan bij de algemene bevolking, en er is een hoog percentage van meerdere primaire melanomen gedurende het hele leven van de drager. Dragers van CDKN2A lopen ook een aanzienlijk verhoogd risico op alvleesklierkanker — geschat op 11-17% gedurende het hele leven — vooral wanneer er een familiegeschiedenis van alvleesklierkanker is. Dragers met p14/ARF-specifieke varianten (die alleen exon 1β beïnvloeden) kunnen een geïsoleerde aanleg voor alvleesklierkanker hebben zonder risico op melanoom.

Ondanks het aanzienlijke levenslange risico op melanoom wordt familiair melanoom in grote mate ondergediagnosticeerd. In de eerstelijnszorg en bij dermatologen komen vaak patiënten voor met meerdere eerstegraads familieleden met melanoom, die te horen krijgen dat het om ‘pech in de familie’ gaat of die louter algemeen advies over zonbescherming krijgen zonder dat ze worden doorverwezen voor kiembaanonderzoek. De NCCN-richtlijnen voor melanoom bevelen genetisch onderzoek aan voor personen met drie of meer invasieve melanomen in één familie, meerdere primaire melanomen bij één persoon, of een familie met één of meer gevallen van melanoom plus één geval van alvleesklierkanker. Bij bevestigde CDKN2A-dragers is een jaarlijks volledig huidonderzoek, halfjaarlijkse dermatoscopie en controle van de alvleesklier vereist — een gestructureerd protocol dat alleen kan worden geïmplementeerd na moleculaire bevestiging.

Het CDKN2A-gen codeert via alternatieve leeskaders voor twee eiwitten. Varianten in exon 1β hebben alleen invloed op p14/ARF en leiden tot een verhoogd risico op alvleesklierkanker, zonder dat er sprake is van een verhoogd risico op melanoom. Varianten in exon 1α en exon 2-3 hebben invloed op p16/INK4a en leiden doorgaans tot een verhoogd risico op zowel melanoom als alvleesklierkanker.

WAAROM VOLLEDIGE GENOOMSEQUENTIEBEPALING

Standaardpanels voor melanoom maken gebruik van beperkte CDKN2A-sequencingmethoden, waardoor grote herschikkingen en varianten in alternatieve leeskaders over het hoofd worden gezien. Met volledige genoomsequencing wordt de volledige structuur van CDKN2A in kaart gebracht, inclusief zowel de p16/INK4a- als de p14/ARF-leeskaders.

Twee eiwitten, twee leeskaders — bij standaard-exonsequencing worden mogelijk niet beide correct beoordeeld

CDKN2A is bijzonder omdat het via alternatieve eerste exonen twee tumorsuppressoreiwitten codeert vanaf één enkele genomische locus: exon 1α (voor p16/INK4a) en exon 1β (voor p14/ARF). Bij standaard panels voor erfelijke kanker worden de coderende exonen van CDKN2A doorgaans gesequenced in het p16/INK4a-leeskader. Varianten die specifiek het p14/ARF-leeskader beïnvloeden — met name in exon 1β — kunnen over het hoofd worden gezien als het panelontwerp dit alternatieve eerste exon niet expliciet omvat. Dergelijke varianten zorgen voor een aanleg voor alvleesklierkanker die mogelijk over het hoofd wordt gezien bij een panelontwerp dat gericht is op melanoom. Volledige genoomsequencing bestrijkt de volledige 9p21 CDKN2A-locus, inclusief beide alternatieve eerste exonen en het volledige regulerende gebied.

Het risico op alvleesklierkanker bij families met een CDKN2A-mutatie vereist specifieke controle, die niet onder de standaard follow-up voor melanoom valt

Dragers van het CDKN2A-gen die zijn geïdentificeerd via een familie met gevallen van melanoom, krijgen mogelijk geen voorlichting over hun bijkomende risico van 11-17% op alvleesklierkanker als men zich niet expliciet bewust is van dit dubbele fenotype. Huidige richtlijnen voor CDKN2A-dragers met een familiegeschiedenis die wijst op een risico op alvleesklierkanker, bevelen jaarlijkse controle van de alvleesklier aan vanaf de leeftijd van 40-45 jaar door middel van endoscopische echografie of MRI/MRCP — dezelfde controle die wordt aanbevolen voor BRCA2- en ATM-dragers met een risico op alvleesklierkanker. Dit protocol voor controle van de alvleesklier wordt alleen gestart wanneer de CDKN2A-diagnose is vastgesteld en het klinische team zich bewust is van het dubbele kankerrisico. Volledige genoomsequencing identificeert pathogene CDKN2A-varianten in het kader van een uitgebreide kankerrisicobeoordeling.

WAT HET SEQUENCEREN VAN JE HELE GENOOM EIGENLIJK INHOUDT
01

Je volledige DNA (niet slechts een deel ervan)

Bij traditionele genetische tests wordt alleen naar beperkte sets genen gekeken, waardoor het grootste deel van je genoom buiten beschouwing blijft. Wij sequencen je volledige genoom — elk gen en elk gebied tussen de genen.

02

Uitgebreide inzichten en gespecialiseerde rapporten

Overzichtelijk en met antwoorden waarop u en uw arts direct kunnen reageren. Geen dossier dat u moet ontcijferen — meer dan 200 klinische rapporten, ingedeeld per categorie.

03

Uw test wordt elk jaar waardevoller

Uw DNA verandert niet, maar de genoomwetenschap maakt een snelle ontwikkeling door. Elke maand worden er nieuwe verbanden tussen varianten en ziekten ontdekt. Wij controleren deze bevindingen en werken uw rapporten automatisch bij. Uw test wordt elk jaar waardevoller.

RESULTATEN

De resultaten die artsen boeken bij hun moeilijkste gevallen.

Veertig jaar onzekerheid. Eén test.

Een patiënt had tientallen jaren in het Britse gezondheidszorgsysteem doorgebracht zonder dat er een diagnose was gesteld. Dante-gegevens, die door de klinische teams van de NHS in het Queen Elizabeth University Hospital in Glasgow werden geaccepteerd, brachten het Noonan-syndroom en een met leukemie geassocieerde RUNX1-variant aan het licht die tot dan toe onopgemerkt waren gebleven. Na 40 jaar hadden ze eindelijk een antwoord.

Als je het helemaal leest, krijg je een volledig beeld.

Een patiënt kwam naar Dante voor onderzoek naar periodieke verlamming. Uit de analyse van het volledige genoom bleek dat er sprake was van een gelijktijdige erfelijke hartaandoening — het Brugadasyndroom — die door de behandelend arts met een ECG werd bevestigd. Het resultaat gaf ook een verklaring voor de onopgehelderde hartproblemen bij een familielid. Eén test. Alle antwoorden in één.

Gesequenced in 2019. De gegevens zijn in 2021 verwerkt.

Jennifer liet haar genoom door Dante in kaart brengen, twee jaar voordat bij haar borstkanker werd vastgesteld. Toen de behandeling van start ging, bleek uit de farmacogenomische gegevens van Dante dat de voorgeschreven chemotherapie ernstige bijwerkingen zou veroorzaken. Haar arts koos voor een alternatief — en zo kon ze vanaf de eerste dag met een effectieve behandeling beginnen.

Bekijk de resultaten →
WIE WE HELPEN

Elke vraag over genetica verdient een volledig antwoord.

Of je nu vandaag op zoek bent naar antwoorden of je gezondheid voor de toekomst wilt beschermen, een volledige analyse van je volledige genoom is het enige uitgangspunt.

REEDS GETEST

Je hebt al een DNA-test gedaan. Dit is wat die test je niet kon vertellen.

De meeste DNA-tests voor consumenten analyseren minder dan 0,1% van je genoom. Wij analyseren het volledige genoom.

Meer informatie

Resultaten van klinische kwaliteit. Gekozen door particulieren, vertrouwd door artsen voor hun meest complexe gevallen.

30X dekking van het volledige genoom
meer dan 5 miljoen varianten geïdentificeerd per test
meer dan 200 aangepaste klinische rapporten
99,98% sequencingnauwkeurigheid

De Dante Genome Test hielp specialisten in een nationaal ziekenhuis voor acute zorg in het Verenigd Koninkrijk bij het vaststellen van het syndroom van Noonan en een zeldzame genetische variant die verband houdt met leukemie en die tot dan toe onopgemerkt was gebleven. Dat resultaat heeft de medische behandeling van de patiënt veranderd.

Erkend door & gepubliceerd in

Wetswijzigingen inzake de verbetering van klinische laboratoria College van Amerikaanse pathologen Amerikaanse Vereniging voor Menselijke Genetica Nature Internationale Vereniging voor Cel- en Gentherapie Gene Journal
VEELGESTELDE VRAGEN

Veelgestelde vragen over volledige genoomsequencing.

Wat is het verschil tussen volledige genoomsequencing en een gerichte genetische test?

Gerichte genetische tests — waaronder standaardpanels voor erfelijke kanker — scannen een vooraf vastgestelde lijst van bekende varianten in een specifieke reeks genen. Ze zijn ontworpen om te vinden wat ze al weten te zoeken . Bij volledige genoomsequencing wordt uw volledige genoom gescand: alle 6 miljard basenparen, elk gen, elk gebied tussen genen. Een studie van de Mayo Clinic, gepubliceerd in JAMA Oncology, toonde aan dat standaardtestrichtlijnen meer dan de helft van de patiënten met erfelijke kankermutaties over het hoofd zagen. Genome Test heeft geen vaste lijst.

Wat krijg ik als mijn uitslag bekend is?

Uw Dante Genome biedt meer dan 200 rapporten die direct door artsen kunnen worden gebruikt, ingedeeld naar klinische categorie: erfelijke kanker, hartaandoeningen, zeldzame ziekten, farmacogenomica, dragerschap en meer. De rapporten worden geleverd in uw beveiligde Genome Manager en zijn opgemaakt voor direct klinisch gebruik. Uw genoomgegevens worden permanent bewaard en automatisch opnieuw geanalyseerd naarmate de wetenschap vordert.

Wat gebeurt er als er een klinisch relevante variant wordt gevonden?

Als er een pathogene of mogelijk pathogene variant wordt vastgesteld, wordt deze duidelijk aangegeven in uw voor artsen bestemd rapport, samen met de klinische context, gepubliceerde wetenschappelijke gegevens en aanbevolen vervolgstappen. Wij raden u aan om elke klinisch relevante bevinding te delen met uw arts of een genetisch consulent, die u kan begeleiden bij beslissingen over follow-up, risicobeperking of cascade-testen voor familieleden.

Waarin verschilt dit van een DNA-test voor consumenten, zoals 23andMe of AncestryDNA?

Bij DNA-tests voor consumenten wordt gebruikgemaakt van genotyperingschips die minder dan 0,1% van uw genoom aflezen — een zeer kleine, vooraf geselecteerde reeks veelvoorkomende varianten. Deze tests zijn geoptimaliseerd voor afkomst en populatiekenmerken, niet voor klinische genetische bevindingen. De Dante Genome Test sequentieert 100% van uw genoom met een 30-voudige dekking, de zelfde standaard die wordt gebruikt in klinische diagnostische omgevingen. De twee tests zijn niet vergelijkbaar wat betreft omvang, methodologie of klinisch nut.

Hoe lang duurt het voordat er resultaten zichtbaar zijn, en hoe worden die resultaten gepresenteerd?

Uw afnamekit wordt binnen 48 uur na bestelling verzonden. Zodra uw monster is aangekomen in ons CLIA-gecertificeerde laboratorium, duurt het 6 tot 8 weken voordat de sequentiebepaling en analyse zijn voltooid. De resultaten worden veilig naar uw Genome Manager geüpload, waar u uw rapporten kunt inzien, deze met uw arts kunt delen en automatische updates ontvangt zodra nieuwe bevindingen aan de hand van uw genoom zijn gevalideerd.

Patiëntenbelangenorganisaties

We werken samen met patiëntenbelangenorganisaties over de hele wereld.

Dante Labs werkt samen met patiëntenbelangenorganisaties van elke omvang — voor familiair melanoom — CDKN2A en andere aandoeningen, zowel zeldzame als veelvoorkomende. Wij ondersteunen organisaties in elk land, inclusief virtuele patiëntenbelangenorganisaties.

Wij bieden rapporten op maat, groepskortingen en pakketten die speciaal zijn afgestemd op uw leden. Neem contact met ons op via het formulier; wij nemen binnen twee werkdagen contact met u op.

  • Genomische rapporten op maat voor uw leden
  • Groepskortingen en pakketten op maat
  • Elk land — inclusief virtuele groepen
  • Zeldzame en veelvoorkomende aandoeningen die worden behandeld

Eén test.
Een leven lang antwoorden.

Eén kit, bij u thuis bezorgd. Uw volledige genoom gesequenced volgens de klinische standaard die wordt gehanteerd voor diagnostische beslissingen. Meer dan 200 rapporten die direct door artsen kunnen worden gebruikt, binnen 6 tot 8 weken geleverd in uw Genome Manager — permanent beschikbaar en bijgewerkt naarmate de wetenschap vordert.

Gratis wereldwijde verzending
Wordt binnen 48 uur verzonden
Resultaten binnen 6 tot 8 weken

Wordt binnen 48 uur verzonden · Resultaten binnen 6–8 weken

Dante Labs-genomische testkit