Familiaire adenomateuze polyposis — honderden tot duizenden colorectale poliepen als gevolg van een functieverlies van het APC-gen, waarbij de kans op ontwikkeling van kanker vrijwel zeker is zonder chirurgische ingreep.
Bij volledige genoomsequencing wordt de volledige sequentie van het APC-gen in kaart gebracht — inclusief diepe introngebieden, grote deleties en mozaïekvarianten die door standaardpanels voor erfelijke kanker systematisch over het hoofd worden gezien.
Familiaire adenomateuze polyposis
Familiaire adenomateuze polyposis (FAP) is een autosomaal dominant erfelijk syndroom dat leidt tot colorectale kanker, veroorzaakt door pathogene varianten in het APC-tumorsuppressorgen (adenomateuze polyposis coli) op chromosoom 5q22.2. Klassieke FAP wordt gekenmerkt door de ontwikkeling van honderden tot duizenden adenomateuze poliepen in het gehele colorectale stelsel, die doorgaans in de tweede levensdecennium verschijnen. Zonder chirurgische ingreep is colorectale kanker vrijwel onvermijdelijk tegen het vijfde levensdecennium — het levenslange risico op colorectale kanker benadert 100% bij onbehandelde klassieke FAP. FAP is verantwoordelijk voor ongeveer 0,5-1% van alle gevallen van colorectale kanker en treft naar schatting 1 op de 5.000 tot 1 op de 10.000 personen.
Attenuated FAP (AFAP) is een mildere fenotypische variant die wordt veroorzaakt door varianten in specifieke APC-regio’s (het 5’-uiteinde, exon 9 of het 3’-uiteinde) en wordt gekenmerkt door een kleiner aantal poliepen (10-100), een latere aanvang van polypose, een lager maar nog steeds aanzienlijk verhoogd risico op colorectale kanker en een meer variabele expressie. De genotype-fenotype-correlaties bij FAP zijn goed vastgesteld: varianten in de codons 1250-1464 (met name codon 1309) worden in verband gebracht met dichte polypose en vroeger optredende colorectale kanker; varianten in de codons 1310-1330 en 1445-1580 worden in verband gebracht met een hoger risico op desmoïde tumoren; en varianten aan het 5'-uiteinde worden in verband gebracht met AFAP. Extracolonale manifestaties — waaronder duodenale adenomen (100% levenslang risico), schildklierkanker, hepatoblastoom (bij kinderen), desmoïde tumoren, congenitale hypertrofie van het retinale pigmentepitheel (CHRPE) en osteomen — variëren naargelang de locatie van de APC-variant.
Ongeveer 20-30% van de klassieke FAP is het gevolg van de novo APC-varianten zonder familiegeschiedenis van polypose. Bij nog eens 7-10% van de patiënten die voldoen aan de klinische criteria voor FAP is er via standaardsequencing geen APC-variant aantoonbaar — deze groep kan drager zijn van diepe intronische splicingvarianten, grote genomische herschikkingen (deleties, duplicaties) of somatisch mozaïcisme die met standaard genpanelonderzoek niet kunnen worden opgespoord. MUTYH-geassocieerde polypose (MAP), veroorzaakt door biallelische MUTYH-varianten, kan een fenotype opleveren dat niet te onderscheiden is van verzwakte FAP en vereist gelijktijdige MUTYH-genotypering bij APC-negatieve polyposepatiënten.
Klassieke FAP, verzwakte FAP (AFAP) en MUTYH-geassocieerde polyposis (MAP) vertonen overlappende klinische beelden met verschillende genetische oorzaken en chirurgische implicaties. De locatie van de APC-variant bepaalt het risico op extracolonale manifestaties.
Standaardpanels voor erfelijke kanker onderzoeken de coderende exonen van het APC-gen. Ze laten diep in de introns gelegen varianten, grote herschikkingen en mozaïekmutaties buiten beschouwing — precies de varianten die verklaren waarom de uitslag van de panels negatief is bij families waarin de ziekte klinisch voorkomt.
Bij tot wel 30% van de patiënten met een klinische diagnose van FAP is de APC-test op standaardpanels negatief
Standaardpanels voor erfelijke kanker sequencen het coderende gebied en de splitsingsplaatsen van het APC-gen. Ze detecteren echter niet op betrouwbare wijze grote genomische deleties of duplicaties die meerdere exonen overspannen, diepe intronvarianten die afwijkende splitsingsplaatsen veroorzaken, of somatisch mozaïcisme – waarbij de APC-variant slechts in een fractie van de cellen aanwezig is. Studies hebben aangetoond dat 7-10% van de klassieke FAP-patiënten zonder geïdentificeerde APC-coderende variant diepe intronische of structurele herschikkingsvarianten draagt die alleen door uitgebreide genomische analyse kunnen worden gedetecteerd. Een bijkomende subgroep draagt somatische mozaïek-APC-mutaties, waarbij variant-allelfracties van 10-20% mogelijk over het hoofd worden gezien bij standaardpanel-sequencingdieptes. Volledige genoomsequencing met een dekking van 30X en analyse van kopieaantalvarianten lost al deze problemen op.
De locatie van de APC-variant bepaalt de chirurgische strategie en de intensiteit van de follow-up
De chirurgische behandeling van colorectale aandoeningen bij FAP is niet voor iedereen hetzelfde. Patiënten met varianten in de codons 1250-1464 en dichte polypose hebben doorgaans een reconstructieve proctocolectomie met ileale pouch-anale anastomose nodig. Patiënten met AFAP of schaarse polypose kunnen worden behandeld met een segmentale colectomie met ileorectale anastomose en endoscopisch toezicht. Risicostratificatie voor desmoïden — cruciaal voor de chirurgische planning bij patiënten met een risico op intra-abdominale desmoïde tumoren — hangt af van de locatie van de APC-variant op de codons 1310-1580. Geen van deze genotype-fenotype-stratificaties is mogelijk zonder een volledig APC-genotype, waarvoor sequentiebepaling van het volledige gen, inclusief regulerende en intronische regio's, vereist is.
Je volledige DNA (niet slechts een deel ervan)
Bij traditionele genetische tests wordt alleen naar beperkte sets genen gekeken, waardoor het grootste deel van je genoom buiten beschouwing blijft. Wij sequencen je volledige genoom — elk gen en elk gebied tussen de genen.
Uitgebreide inzichten en gespecialiseerde rapporten
Overzichtelijk en met antwoorden waarop u en uw arts direct kunnen reageren. Geen dossier dat u moet ontcijferen — meer dan 200 klinische rapporten, ingedeeld per categorie.
Uw test wordt elk jaar waardevoller
Uw DNA verandert niet, maar de genoomwetenschap maakt een snelle ontwikkeling door. Elke maand worden er nieuwe verbanden tussen varianten en ziekten ontdekt. Wij controleren deze bevindingen en werken uw rapporten automatisch bij. Uw test wordt elk jaar waardevoller.
De resultaten die artsen boeken bij hun moeilijkste gevallen.
Veertig jaar onzekerheid. Eén test.
Een patiënt had tientallen jaren in het Britse gezondheidszorgsysteem doorgebracht zonder dat er een diagnose was gesteld. Dante-gegevens, die door de klinische teams van de NHS in het Queen Elizabeth University Hospital in Glasgow werden geaccepteerd, brachten het Noonan-syndroom en een met leukemie geassocieerde RUNX1-variant aan het licht die tot dan toe onopgemerkt waren gebleven. Na 40 jaar hadden ze eindelijk een antwoord.
Als je het helemaal leest, krijg je een volledig beeld.
Een patiënt kwam naar Dante voor onderzoek naar periodieke verlamming. Uit de analyse van het volledige genoom bleek dat er sprake was van een gelijktijdige erfelijke hartaandoening — het Brugadasyndroom — die door de behandelend arts met een ECG werd bevestigd. Het resultaat gaf ook een verklaring voor de onopgehelderde hartproblemen bij een familielid. Eén test. Alle antwoorden in één.
Gesequenced in 2019. De gegevens zijn in 2021 verwerkt.
Jennifer liet haar genoom door Dante in kaart brengen, twee jaar voordat bij haar borstkanker werd vastgesteld. Toen de behandeling van start ging, bleek uit de farmacogenomische gegevens van Dante dat de voorgeschreven chemotherapie ernstige bijwerkingen zou veroorzaken. Haar arts koos voor een alternatief — en zo kon ze vanaf de eerste dag met een effectieve behandeling beginnen.
Elke vraag over genetica verdient een volledig antwoord.
Of je nu vandaag op zoek bent naar antwoorden of je gezondheid voor de toekomst wilt beschermen, een volledige analyse van je volledige genoom is het enige uitgangspunt.
Het zit in je familie. Nu kun je ontdekken of het in je genen zit.
Uw genoom bevat erfelijke varianten die in verband worden gebracht met aandoeningen zoals hartaandoeningen, kanker en neurologische aandoeningen. Wij analyseren ze allemaal — met de nodige klinische diepgang om de resultaten betekenis te geven.
Meer informatie →Als uit de gebruikelijke laboratoriumtests blijkt dat er niets aan de hand is. En je weet dat dat niet zo is.
Bij standaarddiagnostische tests wordt gezocht naar een vooraf vastgestelde reeks antwoorden. Wij brengen uw volledige DNA in kaart — inclusief delen waarvoor geen enkele test is ontwikkeld. Als het antwoord in uw genoom zit, helpen wij u het te vinden.
Meer informatie →Uw diagnose is wellicht juist. Uw behandelplan is wellicht onvolledig.
Uw genen bepalen welke behandelingen de meeste kans van slagen hebben — en welke niet. Wij bieden uw arts de middelen en inzichten om uw behandelplan op maat samen te stellen.
Meer informatie →Je wilt het weten voordat de situatie je daartoe dwingt.
Sommige mensen wachten niet op een diagnose of een familiegeschiedenis om actie te ondernemen. Met een volledige genoomsequencing krijg je nu al een volledig genetisch beeld — zodat jij en je arts weloverwogen beslissingen kunnen nemen voordat de situatie urgent wordt.
Meer informatie →Je hebt al een DNA-test gedaan. Dit is wat die test je niet kon vertellen.
De meeste DNA-tests voor consumenten analyseren minder dan 0,1% van je genoom. Wij analyseren het volledige genoom.
Meer informatie →Resultaten van klinische kwaliteit. Gekozen door particulieren, vertrouwd door artsen voor hun meest complexe gevallen.
De Dante Genome Test hielp specialisten in een nationaal ziekenhuis voor acute zorg in het Verenigd Koninkrijk bij het vaststellen van het syndroom van Noonan en een zeldzame genetische variant die verband houdt met leukemie en die tot dan toe onopgemerkt was gebleven. Dat resultaat heeft de medische behandeling van de patiënt veranderd.
Erkend door & gepubliceerd in
Veelgestelde vragen over volledige genoomsequencing.
Wat is het verschil tussen volledige genoomsequencing en een gerichte genetische test?
Gerichte genetische tests — waaronder standaardpanels voor erfelijke kanker — scannen een vooraf vastgestelde lijst van bekende varianten in een specifieke reeks genen. Ze zijn ontworpen om te vinden wat ze al weten te zoeken . Bij volledige genoomsequencing wordt uw volledige genoom gescand: alle 6 miljard basenparen, elk gen, elk gebied tussen genen. Een studie van de Mayo Clinic, gepubliceerd in JAMA Oncology, toonde aan dat standaardtestrichtlijnen meer dan de helft van de patiënten met erfelijke kankermutaties over het hoofd zagen. Genome Test heeft geen vaste lijst.
Wat krijg ik als mijn uitslag bekend is?
Uw Dante Genome biedt meer dan 200 rapporten die direct door artsen kunnen worden gebruikt, ingedeeld naar klinische categorie: erfelijke kanker, hartaandoeningen, zeldzame ziekten, farmacogenomica, dragerschap en meer. De rapporten worden geleverd in uw beveiligde Genome Manager en zijn opgemaakt voor direct klinisch gebruik. Uw genoomgegevens worden permanent bewaard en automatisch opnieuw geanalyseerd naarmate de wetenschap vordert.
Wat gebeurt er als er een klinisch relevante variant wordt gevonden?
Als er een pathogene of mogelijk pathogene variant wordt vastgesteld, wordt deze duidelijk aangegeven in uw voor artsen bestemd rapport, samen met de klinische context, gepubliceerde wetenschappelijke gegevens en aanbevolen vervolgstappen. Wij raden u aan om elke klinisch relevante bevinding te delen met uw arts of een genetisch consulent, die u kan begeleiden bij beslissingen over follow-up, risicobeperking of cascade-testen voor familieleden.
Waarin verschilt dit van een DNA-test voor consumenten, zoals 23andMe of AncestryDNA?
Bij DNA-tests voor consumenten wordt gebruikgemaakt van genotyperingschips die minder dan 0,1% van uw genoom aflezen — een zeer kleine, vooraf geselecteerde reeks veelvoorkomende varianten. Deze tests zijn geoptimaliseerd voor afkomst en populatiekenmerken, niet voor klinische genetische bevindingen. De Dante Genome Test sequentieert 100% van uw genoom met een 30-voudige dekking, de zelfde standaard die wordt gebruikt in klinische diagnostische omgevingen. De twee tests zijn niet vergelijkbaar wat betreft omvang, methodologie of klinisch nut.
Hoe lang duurt het voordat er resultaten zichtbaar zijn, en hoe worden die resultaten gepresenteerd?
Uw afnamekit wordt binnen 48 uur na bestelling verzonden. Zodra uw monster is aangekomen in ons CLIA-gecertificeerde laboratorium, duurt het 6 tot 8 weken voordat de sequentiebepaling en analyse zijn voltooid. De resultaten worden veilig naar uw Genome Manager geüpload, waar u uw rapporten kunt inzien, deze met uw arts kunt delen en automatische updates ontvangt zodra nieuwe bevindingen aan de hand van uw genoom zijn gevalideerd.
We werken samen met patiëntenbelangenorganisaties over de hele wereld.
Dante Labs werkt samen met patiëntenbelangenorganisaties van elke omvang — voor familiaire adenomateuze polyposis en andere aandoeningen, zowel zeldzame als veelvoorkomende. Wij ondersteunen organisaties in elk land, inclusief virtuele patiëntenbelangenorganisaties.
Wij bieden rapporten op maat, groepskortingen en pakketten die speciaal zijn afgestemd op uw leden. Neem contact met ons op via het formulier; wij nemen binnen twee werkdagen contact met u op.
- Genomische rapporten op maat voor uw leden
- Groepskortingen en pakketten op maat
- Elk land — inclusief virtuele groepen
- Zeldzame en veelvoorkomende aandoeningen die worden behandeld
Bericht ontvangen.
We nemen binnen twee werkdagen contact met u op. Wilt u direct contact opnemen? hello@dantelabs.com
Eén test.
Een leven lang antwoorden.
Eén kit, bij u thuis bezorgd. Uw volledige genoom gesequenced volgens de klinische standaard die wordt gehanteerd voor diagnostische beslissingen. Meer dan 200 rapporten die direct door artsen kunnen worden gebruikt, binnen 6 tot 8 weken geleverd in uw Genome Manager — permanent beschikbaar en bijgewerkt naarmate de wetenschap vordert.
Wordt binnen 48 uur verzonden · Resultaten binnen 6–8 weken
