Het BAP1-tumorpredispositiesyndroom — een recent beschreven erfelijk kankersyndroom met hoge penetrantie, waarbij één genvariant tegelijkertijd vatbaarheid veroorzaakt voor vier verschillende vormen van kanker, waarvan er vele uiterst zeldzaam zijn in de algemene bevolking.
Door middel van volledige genoomsequencing zijn pathogene varianten van het BAP1-gen geïdentificeerd — opgenomen in de ACMG SF v3.2-lijst — bij een syndroom waarbij één enkel genetisch resultaat aanleiding geeft tot bewaking op uveaal melanoom, mesothelioom, huidmelanoom en niercelcarcinoom.
BAP1-tumorpredispositiesyndroom
Het BAP1-tumorpredispositiesyndroom (BAP1-TPDS) is een autosomaal dominant erfelijk kankersyndroom dat wordt veroorzaakt door pathogene varianten in de kiembaan van het BAP1-gen (BRCA1-geassocieerd eiwit 1) op chromosoom 3p21.1. BAP1 is een deubiquitylase dat een rol speelt bij chromatinehermodellering, de reactie op DNA-schade en de regulering van de celcyclus. Pathogene varianten in de kiembaan van BAP1 werden pas vanaf 2011 systematisch gekarakteriseerd — het syndroom is relatief recent beschreven, wat betekent dat veel getroffen families generaties lang meerdere ongebruikelijke kankers hebben opgebouwd zonder er een erfelijke verklaring voor te hebben. BAP1-TPDS wordt nu erkend als een multi-tumorpredispositiesyndroom met hoge penetrantie.
Het spectrum aan tumoren bij BAP1-TPDS is opvallend — dragers lopen een aanzienlijk verhoogd risico op: uveaal melanoom (oogmelanoom, dat het vaatvlies, de iris en het ciliaire lichaam aantast; >50 keer het risico in de algemene bevolking), maligne pleuraal mesothelioom (een zeldzame vorm van kanker die sterk geassocieerd wordt met blootstelling aan asbest, maar waarvan nu bekend is dat deze ook voorkomt bij BAP1-dragers met een minimale of geen blootstellingsgeschiedenis aan asbest), cutaan melanoom (meervoudige primaire melanomen, vaak met kenmerkende melanocytische, door BAP1 gemuteerde atypische intradermale tumoren — 'BAPoma'-laesies) en niercelcarcinoom (met name de subtypes met heldere cellen en chromofobe cellen). Elk van deze kankers is afzonderlijk zeldzaam; het gelijktijdig voorkomen ervan in een familie is het epidemiologische signaal dat BAP1-TPDS aan het licht bracht.
De klinische implicaties van een moleculaire diagnose van BAP1 zijn direct merkbaar en hebben betrekking op meerdere specialismen. Bij de diagnose wordt gestart met een jaarlijks oogheelkundig onderzoek inclusief fundoscopische evaluatie (surveillance op uveaal melanoom), een jaarlijks dermatologisch onderzoek met dermatoscopie (surveillance op huidmelanoom en BAP-oma), beeldvorming van de nieren vanaf de leeftijd van 30 tot 40 jaar (surveillance op RCC), overweging van jaarlijkse beeldvorming van de borstkas (surveillance op mesothelioom bij blootgestelde dragers) en cascade-testen van alle eerstegraads familieleden. Cruciaal is dat BAP1-geassocieerd mesothelioom wordt erkend als een afzonderlijke klinische entiteit, los van door asbest geïnduceerd mesothelioom — BAP1-mesothelioompatiënten zijn doorgaans jonger, hebben een langere overleving na de diagnose en kunnen andere responsprofielen op chemotherapie vertonen.
BAP1 werd pas na 2011 erkend als een gen dat erfelijke kanker veroorzaakt en is niet opgenomen in veel oudere panels voor erfelijke kanker. Gezinnen met uveaal melanoom, mesothelioom of ongebruikelijke clusters van kanker kunnen BAP1-TPDS hebben en zijn mogelijk nooit op de juiste manier getest.
BAP1 ontbreekt in oudere panels voor erfelijke kanker — families met een ongebruikelijke kankergeschiedenis zijn nooit getest
De systematische karakterisering van BAP1-TPDS is pas in 2011 van start gegaan. Veel families met pathogene varianten van BAP1 ondergingen in het voorgaande decennium erfelijke kankerpanels waarin BAP1 niet was opgenomen. Personen met een familiegeschiedenis van onder meer uveamelanoom, mesothelioom of een ongebruikelijke clustering van melanoom en nierkanker — het belangrijkste BAP1-tumorspectrum — hebben mogelijk negatieve panelresultaten ontvangen van tests van vóór 2011 of van panels die BAP1 nooit aan hun genenlijst hebben toegevoegd. Bij volledige genoomsequencing wordt het gehele genoom geëvalueerd en worden pathogene BAP1-varianten geïdentificeerd, ongeacht wanneer de sequencing is uitgevoerd, zonder beperking door een vooraf gedefinieerde genenlijst.
Een bevestigde BAP1-uitslag leidt tot de gelijktijdige inwerkingtreding van vier protocollen voor kankercontrole
In tegenstelling tot erfelijke kankersyndromen, waarbij één enkel gen voornamelijk vatbaar maakt voor één bepaalde vorm van kanker, vereist BAP1-TPDS een gecoördineerde screening voor vier verschillende soorten kanker: uveamelanoom (oogheelkunde), huidmelanoom (dermatologie), niercelcarcinoom (urologie/radiologie) en mesothelioom (longgeneeskunde/oncologie). Deze coördinatie tussen verschillende specialismen begint bij de eerste moleculaire diagnose en wordt vervolgens jaarlijks gedurende het hele leven voortgezet. Elke vorm van surveillance richt zich op een vorm van kanker die niet onder de standaardbevolkingsscreening valt — er bestaat geen algemeen kankerscreeningsprogramma voor uveamelanoom en screening op mesothelioom is niet standaard bij niet-gediagnosticeerde BAP1-dragers. Een moleculaire diagnose is de voorwaarde voor het activeren van dit multi-orgaan surveillancenetwerk.
Je volledige DNA (niet slechts een deel ervan)
Bij traditionele genetische tests wordt alleen naar beperkte sets genen gekeken, waardoor het grootste deel van je genoom buiten beschouwing blijft. Wij sequencen je volledige genoom — elk gen en elk gebied tussen de genen.
Uitgebreide inzichten en gespecialiseerde rapporten
Overzichtelijk en met antwoorden waarop u en uw arts direct kunnen reageren. Geen dossier dat u moet ontcijferen — meer dan 200 klinische rapporten, ingedeeld per categorie.
Uw test wordt elk jaar waardevoller
Uw DNA verandert niet, maar de genoomwetenschap maakt een snelle ontwikkeling door. Elke maand worden er nieuwe verbanden tussen varianten en ziekten ontdekt. Wij controleren deze bevindingen en werken uw rapporten automatisch bij. Uw test wordt elk jaar waardevoller.
De resultaten die artsen boeken bij hun moeilijkste gevallen.
Veertig jaar onzekerheid. Eén test.
Een patiënt had tientallen jaren in het Britse gezondheidszorgsysteem doorgebracht zonder dat er een diagnose was gesteld. Dante-gegevens, die door de klinische teams van de NHS in het Queen Elizabeth University Hospital in Glasgow werden geaccepteerd, brachten het Noonan-syndroom en een met leukemie geassocieerde RUNX1-variant aan het licht die tot dan toe onopgemerkt waren gebleven. Na 40 jaar hadden ze eindelijk een antwoord.
Als je het helemaal leest, krijg je een volledig beeld.
Een patiënt kwam naar Dante voor onderzoek naar periodieke verlamming. Uit de analyse van het volledige genoom bleek dat er sprake was van een gelijktijdige erfelijke hartaandoening — het Brugadasyndroom — die door de behandelend arts met een ECG werd bevestigd. Het resultaat gaf ook een verklaring voor de onopgehelderde hartproblemen bij een familielid. Eén test. Alle antwoorden in één.
Gesequenced in 2019. De gegevens zijn in 2021 verwerkt.
Jennifer liet haar genoom door Dante in kaart brengen, twee jaar voordat bij haar borstkanker werd vastgesteld. Toen de behandeling van start ging, bleek uit de farmacogenomische gegevens van Dante dat de voorgeschreven chemotherapie ernstige bijwerkingen zou veroorzaken. Haar arts koos voor een alternatief — en zo kon ze vanaf de eerste dag met een effectieve behandeling beginnen.
Elke vraag over genetica verdient een volledig antwoord.
Of je nu vandaag op zoek bent naar antwoorden of je gezondheid voor de toekomst wilt beschermen, een volledige analyse van je volledige genoom is het enige uitgangspunt.
Het zit in je familie. Nu kun je ontdekken of het in je genen zit.
Uw genoom bevat erfelijke varianten die in verband worden gebracht met aandoeningen zoals hartaandoeningen, kanker en neurologische aandoeningen. Wij analyseren ze allemaal — met de nodige klinische diepgang om de resultaten betekenis te geven.
Meer informatie →Als uit de gebruikelijke laboratoriumtests blijkt dat er niets aan de hand is. En je weet dat dat niet zo is.
Bij standaarddiagnostische tests wordt gezocht naar een vooraf vastgestelde reeks antwoorden. Wij brengen uw volledige DNA in kaart — inclusief delen waarvoor geen enkele test is ontwikkeld. Als het antwoord in uw genoom zit, helpen wij u het te vinden.
Meer informatie →Uw diagnose is wellicht juist. Uw behandelplan is wellicht onvolledig.
Uw genen bepalen welke behandelingen de meeste kans van slagen hebben — en welke niet. Wij bieden uw arts de middelen en inzichten om uw behandelplan op maat samen te stellen.
Meer informatie →Je wilt het weten voordat de situatie je daartoe dwingt.
Sommige mensen wachten niet op een diagnose of een familiegeschiedenis om actie te ondernemen. Met een volledige genoomsequencing krijg je nu al een volledig genetisch beeld — zodat jij en je arts weloverwogen beslissingen kunnen nemen voordat de situatie urgent wordt.
Meer informatie →Je hebt al een DNA-test gedaan. Dit is wat die test je niet kon vertellen.
De meeste DNA-tests voor consumenten analyseren minder dan 0,1% van je genoom. Wij analyseren het volledige genoom.
Meer informatie →Resultaten van klinische kwaliteit. Gekozen door particulieren, vertrouwd door artsen voor hun meest complexe gevallen.
De Dante Genome Test hielp specialisten in een nationaal ziekenhuis voor acute zorg in het Verenigd Koninkrijk bij het vaststellen van het syndroom van Noonan en een zeldzame genetische variant die verband houdt met leukemie en die tot dan toe onopgemerkt was gebleven. Dat resultaat heeft de medische behandeling van de patiënt veranderd.
Erkend door & gepubliceerd in
Veelgestelde vragen over volledige genoomsequencing.
Wat is het verschil tussen volledige genoomsequencing en een gerichte genetische test?
Gerichte genetische tests — waaronder standaardpanels voor erfelijke kanker — scannen een vooraf vastgestelde lijst van bekende varianten in een specifieke reeks genen. Ze zijn ontworpen om te vinden wat ze al weten te zoeken . Bij volledige genoomsequencing wordt uw volledige genoom gescand: alle 6 miljard basenparen, elk gen, elk gebied tussen genen. Een studie van de Mayo Clinic, gepubliceerd in JAMA Oncology, toonde aan dat standaardtestrichtlijnen meer dan de helft van de patiënten met erfelijke kankermutaties over het hoofd zagen. Genome Test heeft geen vaste lijst.
Wat krijg ik als mijn uitslag bekend is?
Uw Dante Genome biedt meer dan 200 rapporten die direct door artsen kunnen worden gebruikt, ingedeeld naar klinische categorie: erfelijke kanker, hartaandoeningen, zeldzame ziekten, farmacogenomica, dragerschap en meer. De rapporten worden geleverd in uw beveiligde Genome Manager en zijn opgemaakt voor direct klinisch gebruik. Uw genoomgegevens worden permanent bewaard en automatisch opnieuw geanalyseerd naarmate de wetenschap vordert.
Wat gebeurt er als er een klinisch relevante variant wordt gevonden?
Als er een pathogene of mogelijk pathogene variant wordt vastgesteld, wordt deze duidelijk aangegeven in uw voor artsen bestemd rapport, samen met de klinische context, gepubliceerde wetenschappelijke gegevens en aanbevolen vervolgstappen. Wij raden u aan om elke klinisch relevante bevinding te delen met uw arts of een genetisch consulent, die u kan begeleiden bij beslissingen over follow-up, risicobeperking of cascade-testen voor familieleden.
Waarin verschilt dit van een DNA-test voor consumenten, zoals 23andMe of AncestryDNA?
Bij DNA-tests voor consumenten wordt gebruikgemaakt van genotyperingschips die minder dan 0,1% van uw genoom aflezen — een zeer kleine, vooraf geselecteerde reeks veelvoorkomende varianten. Deze tests zijn geoptimaliseerd voor afkomst en populatiekenmerken, niet voor klinische genetische bevindingen. De Dante Genome Test sequentieert 100% van uw genoom met een 30-voudige dekking, de zelfde standaard die wordt gebruikt in klinische diagnostische omgevingen. De twee tests zijn niet vergelijkbaar wat betreft omvang, methodologie of klinisch nut.
Hoe lang duurt het voordat er resultaten zichtbaar zijn, en hoe worden die resultaten gepresenteerd?
Uw afnamekit wordt binnen 48 uur na bestelling verzonden. Zodra uw monster is aangekomen in ons CLIA-gecertificeerde laboratorium, duurt het 6 tot 8 weken voordat de sequentiebepaling en analyse zijn voltooid. De resultaten worden veilig naar uw Genome Manager geüpload, waar u uw rapporten kunt inzien, deze met uw arts kunt delen en automatische updates ontvangt zodra nieuwe bevindingen aan de hand van uw genoom zijn gevalideerd.
We werken samen met patiëntenbelangenorganisaties over de hele wereld.
Dante Labs werkt samen met patiëntenbelangenorganisaties van elke omvang — voor het BAP1-tumorpredispositiesyndroom en andere aandoeningen, zowel zeldzame als veelvoorkomende. Wij ondersteunen organisaties in elk land, inclusief virtuele patiëntenbelangenorganisaties.
Wij bieden rapporten op maat, groepskortingen en pakketten die speciaal zijn afgestemd op uw leden. Neem contact met ons op via het formulier; wij nemen binnen twee werkdagen contact met u op.
- Genomische rapporten op maat voor uw leden
- Groepskortingen en pakketten op maat
- Elk land — inclusief virtuele groepen
- Zeldzame en veelvoorkomende aandoeningen die worden behandeld
Bericht ontvangen.
We nemen binnen twee werkdagen contact met u op. Wilt u direct contact opnemen? hello@dantelabs.com
Eén test.
Een leven lang antwoorden.
Eén kit, bij u thuis bezorgd. Uw volledige genoom gesequenced volgens de klinische standaard die wordt gehanteerd voor diagnostische beslissingen. Meer dan 200 rapporten die direct door artsen kunnen worden gebruikt, binnen 6 tot 8 weken geleverd in uw Genome Manager — permanent beschikbaar en bijgewerkt naarmate de wetenschap vordert.
Wordt binnen 48 uur verzonden · Resultaten binnen 6–8 weken
