Wanneer je een bloedtest laat doen, is het resultaat een momentopname – op dat moment nauwkeurig, maar een jaar later niet meer relevant. Wanneer je je volledige genoom laat sequencen, is het resultaat blijvend. Je DNA-sequentie verandert niet. Maar de wetenschap die deze interpreteert, verandert wel – en dat is wat het sequencen van het volledige genoom fundamenteel anders maakt dan welke andere gezondheidstest dan ook.
Uw gegevens staan vast. De wetenschap niet.
Elke maand publiceren onderzoekers over de hele wereld nieuwe bevindingen die genetische varianten in verband brengen met ziekten, reacties op geneesmiddelen en gezondheidstoestanden. De ClinVar-database — het belangrijkste openbare archief van verbanden tussen varianten en ziekten — wordt elk jaar met duizenden nieuwe vermeldingen uitgebreid. Dit tempo neemt toe naarmate er grotere genomische datasets beschikbaar komen voor analyses op populatieniveau.
Dit betekent dat een variant in uw genoom die vandaag de dag wordt aangemerkt als een „variant van onzekere betekenis“ (VUS), volgend jaar wellicht als pathogeen wordt herclassificeerd — zodra er voldoende bewijs uit klinische studies is verzameld. Omgekeerd kan een variant die aanvankelijk zorgwekkend leek, als minder ernstig worden aangemerkt naarmate er meer populatiegegevens beschikbaar komen.
De hamvraag is: analyseert uw testaanbieder uw gegevens opnieuw wanneer deze updates worden doorgevoerd?
Waarom de meeste tests in de tijd zijn blijven stilstaan
Genotyperingstests voor consumenten — zoals die worden aangeboden door 23andMe, AncestryDNA en soortgelijke diensten — lezen een vooraf geselecteerde reeks genetische posities op een chip. Het rapport dat je ontvangt, geeft weer wat er op de dag dat de chip werd ontworpen bekend was over die specifieke posities. Als de wetenschap iets nieuws ontdekt over een variant die niet op de chip stond, of een variant die er wel op stond herclassificeert, worden uw resultaten niet bijgewerkt — omdat de onderliggende gegevens onvolledig zijn.
Zelfs sommige klinische tests hebben deze beperking. Bij gerichte genpanels worden alleen de genen onderzocht die in het panel zijn opgenomen. Als uit toekomstig onderzoek blijkt dat er een klinisch belangrijke variant zit in een gen dat niet in uw panel zat, heeft u een nieuwe test nodig om die op te sporen.
Hoe een heranalyse van het volledige genoom in zijn werk gaat
Bij volledige genoomsequencing wordt elke positie in uw genoom gesequenced — ongeveer 6,4 miljard basenparen. Dit betekent dat uw gegevensbestand vanaf dag één compleet is. Er is niets weggelaten. Er hoeft niets opnieuw te worden verzameld.
Wanneer er nieuwe verbanden tussen varianten en ziekten worden gepubliceerd en klinisch gevalideerd, kunnen de ruwe gegevens van uw oorspronkelijke sequencing opnieuw worden geanalyseerd aan de hand van bijgewerkte databases. Nieuwe klinisch relevante bevindingen die ten tijde van uw oorspronkelijke test nog niet bekend waren, kunnen aan het licht komen — zonder dat daarvoor een bloedafname, een nieuwe testkit of een nieuwe test nodig is.
Bij Dante Labs verloopt deze heranalyse automatisch via het Genome Manager-platform. Wanneer we via ons klinische beoordelingsproces nieuwe verbanden tussen varianten en ziekten valideren, worden uw rapporten bijgewerkt op basis van de nieuwste wetenschappelijke inzichten. U ontvangt een melding bij elke klinisch relevante wijziging.
Hoe dit er in de praktijk uitziet
Laten we eens kijken naar een praktijkvoorbeeld: sinds ClinVar is begonnen met het bijhouden van variantclassificaties, is ongeveer 7% van alle geclassificeerde varianten minstens één keer opnieuw geclassificeerd naarmate er nieuw bewijs naar voren kwam. Sommige VUS-varianten werden opgewaardeerd tot pathogeen. Sommige waarschijnlijk pathogene varianten werden gedegradeerd. Deze herclassificaties hebben directe klinische gevolgen — ze bepalen of screening wordt aanbevolen, welke medicijnen geschikt zijn en welke familieleden getest moeten worden.
Als er een volledige genoomdataset beschikbaar is, worden deze herclassificaties automatisch doorgevoerd in uw rapporten. Bij een onvolledige dataset — alles wat minder is dan volledige genoomsequencing — is dat mogelijk niet het geval, hetzij omdat de betreffende variant niet is getest, hetzij omdat de aanbieder geen heranalyse aanbiedt.
De kosten van eenmalige sequentiebepaling
Er is ook een praktisch argument. Het sequencen van het volledige genoom kost nog maar een fractie van wat het vijf jaar geleden kostte — en de kosten blijven dalen. Maar het gaat niet alleen om de huidige prijs. Het gaat om de totale kosten van genetische informatie gedurende de gehele levensduur.
Als u vandaag een gerichte panel-test laat uitvoeren en volgend jaar een andere panel-test — omdat uw klinische vraag is veranderd of omdat er nieuwe genen aan het panel zijn toegevoegd — betaalt u twee keer voor een onvolledig beeld van hetzelfde genoom. Bij volledige genoomsequencing wordt alles in één keer vastgelegd. Elke toekomstige vraag wordt beantwoord op basis van dezelfde dataset.
Waar het op neerkomt
Uw genoom is de enige gezondheidstest die na afloop alleen maar waardevoller wordt. Niet omdat uw DNA verandert – dat doet het namelijk niet. Maar omdat de wetenschap die het ontcijfert zich voortdurend verder ontwikkelt. Het enige wat nodig is, is dat bij uw oorspronkelijke test alles is vastgelegd. Dat is precies wat volledige genoomsequencing doet.
Meer informatie over de genoomtest van Dante Labs →
Ontvang nieuwe berichten van Dante Labs
Inzichten op het gebied van genomica, productupdates en klinische perspectieven — rechtstreeks in uw inbox.
