Dante Omics AI heeft, in samenwerking met Rockefeller University, het Giunta Lab en een netwerk van wereldwijde partners, het meest complete en nauwkeurige diploïde referentiegenoom voor de RPE-1-cellijn samengesteld – een van de meest gebruikte standaarden voor complexe experimenten op het gebied van celmanipulatie.
Deze mijlpaal biedt onderzoekers wereldwijd een echte ‘broncode’ en opent de deur naar diepgaander inzicht in structurele complexiteit, genomische stabiliteit en op CRISPR gebaseerde genetische manipulatie.
Waarom dit belangrijk is
De RPE-1-lijn geldt wereldwijd als referentie op het gebied van celbiologie, kankeronderzoek en genoombewerking. Tot nu toe was het genoom ervan echter onvolledig, waardoor belangrijke regio’s onduidelijk waren of ontbraken.
Onze nieuwe opstelling brengt hier verandering in:
► Diploïde volledigheid – zowel maternale als paternale haplotypes zijn over de chromosomen heen in kaart gebracht.► Ultrahoge nauwkeurigheid – > 99,9999% op meerdere chromosomen.► Volledige dekking van complexe regio’s – centromeren, herhalingen en structureel uitdagend DNA zijn nu in kaart gebracht.► Integratie van meerdere platforms – gegevens afkomstig van Illumina short reads, PacBio HiFi, Oxford Nanopore long reads en aanvullende bronnen.► Open toegang – assemblage RPE1v1.1 is nu beschikbaar via NCBI en de UCSC Genome Browser.
Een gezamenlijke prestatie
Dit project was alleen mogelijk dankzij de gezamenlijke expertise van een wereldwijd consortium, bestaande uit:
Rockefeller UniversityGiunta LabUniversiteit Sapienza van RomeUniversiteit van TennesseeTrieste Area Science ParkUniversiteit van L’AquilaDante Omics AI
Zoals Andrea Riposati, CEO van Dante Omics AI, uitlegde: „Stel je voor dat je software moet debuggen zonder dat je over delen van de broncode beschikt. Met deze assemblage beschikken onderzoekers eindelijk over een volledige, nauwkeurige ‘broncode’ voor RPE-1-cellen – tot in de meest complexe regio’s die voorheen onzichtbaar waren.”
Gevolgen voor de wetenschap en de geneeskunde
Een nieuwe norm voor celtechnologie: CRISPR en andere bewerkingstechnieken kunnen nu terugvallen op een betrouwbaardere referentie.Diepgaander onderzoek naar de complexiteit van DNA: centromeren en herhalingssequenties, die voorheen ontoegankelijk waren, kunnen nu worden bestudeerd.Een bredere impact op verschillende onderzoeksgebieden: van oncologie tot synthetische biologie – dit genoom verhoogt de nauwkeurigheid van experimenten wereldwijd.Een model voor toekomstige assemblages: de aanpak kan worden uitgebreid naar andere cellijnen en soorten.
Conclusie
Van wazig naar 4K: DNA is meer dan alleen een krantenkop – het markeert een keerpunt in het genoomonderzoek. Door AI-versnelde multiomics te combineren met geavanceerde sequentietechnologieën hebben Dante Omics AI en zijn partners de tot nu toe duidelijkste genomische blauwdruk opgeleverd voor een van de belangrijkste celmodellen in de biologie.
➡ Lees het persbericht op BusinessWire
Ontvang nieuwe berichten van Dante Labs
Inzichten op het gebied van genomica, productupdates en klinische perspectieven — rechtstreeks in uw inbox.
