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Gene

SPAG8

sperm associated antigen 8

Sintesi

Localizzazione citogenetica
9p13.3
Coordinate
Cromosoma 9: 35.809.795–35.812.262 (GRCh38)
Esoni
7 esoni su 2,5 kb
Proteina
485 amminoacidi
Noto anche come
hSMP-1, HSD-1, BS-84, SPAG3, CT142
Trascritto MANE Select
ENST00000396638.7NM_001039592.2
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SPAG8. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SPAG8

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
Cromosoma 9, con una parentesi dove si trova SPAG8. SPAG8 e 31 geni nelle vicinanze sul cromosoma 9, da 35.311.029 a 36.311.028.Cromosoma 99p13.3p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.335,4 Mb35,6 Mb35,8 Mb36 Mb36,2 MbUNC13B: 35.161.829–35.405.339, filamento direttoUNC13BRUSC2: 35.489.670–35.562.266, filamento direttoRUSC2CIMIP2B: 35.561.831–35.563.914, filamento inversoCIMIP2BTESK1: 35.605.235–35.610.328, filamento direttoTESK1CD72: 35.609.965–35.646.810, filamento inversoCD72SIT1: 35.649.288–35.650.970, filamento inversoRMRP: 35.657.750–35.658.019, filamento inversoCCDC107: 35.658.277–35.661.524, filamento direttoARHGEF39: 35.658.874–35.675.866, filamento inversoARHGEF39CA9: 35.673.898–35.681.159, filamento direttoCA9TPM2: 35.681.992–35.691.116, filamento inversoTPM2TLN1: 35.696.925–35.732.212, filamento inversoCREB3: 35.732.296–35.738.887, filamento direttoCREB3GBA2: 35.734.577–35.749.986, filamento inversoGBA2RGP1: 35.748.613–35.759.600, filamento direttoRGP1MSMP: 35.752.990–35.756.613, filamento inversoMSMPNPR2: 35.791.003–35.809.732, filamento direttoNPR2SPAG8: 35.809.795–35.812.262, filamento inversoSPAG8HINT2: 35.812.960–35.815.354, filamento inversoHINT2: 35.812.960–35.828.732, filamento inversoTMEM8B: 35.814.451–35.865.518, filamento direttoFAM221B: 35.816.391–35.828.747, filamento inversoOR13J1: 35.869.463–35.870.401, filamento inversoOR13J1HRCT1: 35.906.202–35.907.136, filamento direttoHRCT1SPAAR: 35.909.488–35.937.153, filamento direttoSPAAROR2S2: 35.957.108–35.958.154, filamento inversoOR2S2OR13C7: 36.002.909–36.003.867, filamento inversoOR13C7RECK: 36.036.896–36.124.457, filamento direttoRECKGLIPR2: 36.136.417–36.163.913, filamento direttoGLIPR2CCIN: 36.165.751–36.172.384, filamento direttoCCINCLTA: 36.190.856–36.304.781, filamento direttoCLTAGNE: 36.214.441–36.277.042, filamento inversoGNEDiagramma di SPAG8: 7 esoni sul filamento inverso del cromosoma 9Esone 7: 35.809.795–35.810.132, 338 basiEsone 6: 35.810.247–35.810.309, 63 basiEsone 5: 35.810.439–35.810.553, 115 basiEsone 4: 35.810.637–35.810.682, 46 basiEsone 3: 35.810.883–35.811.057, 175 basiEsone 2: 35.811.182–35.812.001, 820 basiEsone 1: 35.812.104–35.812.262, 159 basi76543215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 1,7 kb dei 2,5 kb del gene; 1458 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge SPAG8

1

posizione in SPAG8 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 2,5 kb di SPAG8, introni inclusi, non solo i 1,7 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SPAG8: sperm associated antigen 8. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/spag8

Vancouver

Dante Labs. Gene SPAG8: sperm associated antigen 8 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/spag8

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