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Gene

SLC44A1

solute carrier family 44 member 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
9q31.1-q31.2
Coordinate
Cromosoma 9: 105.244.651–105.397.346 (GRCh38)
Esoni
16 esoni su 152,7 kb
Proteina
657 amminoacidi
Noto anche come
CTL1, CHTL1, CD92
Simboli precedenti
CDW92
Trascritto MANE Select
ENST00000374720.8NM_080546.5
Tipo di locus
Protein-coding
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SLC44A1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SLC44A1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 9, con una parentesi dove si trova SLC44A1. SLC44A1 e 5 geni nelle vicinanze sul cromosoma 9, da 104.820.999 a 105.820.998.Cromosoma 99q31.1-q31.2p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.3105 Mb105,2 Mb105,4 Mb105,6 Mb105,8 MbABCA1: 104.781.006–104.928.248, filamento inversoABCA1SLC44A1: 105.244.651–105.397.346, filamento direttoSLC44A1FSD1L: 105.447.796–105.552.433, filamento direttoFSD1LFKTN: 105.558.122–105.653.820, filamento direttoFKTNTAL2: 105.656.229–105.665.420, filamento direttoTAL2TMEM38B: 105.694.340–105.776.629, filamento direttoTMEM38BDiagramma di SLC44A1: 16 esoni sul filamento diretto del cromosoma 9Esone 6: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 1: 105.244.651–105.244.904, 254 basiEsone 2: 105.299.220–105.299.309, 90 basiEsone 3: 105.309.724–105.309.866, 143 basiEsone 4: 105.335.563–105.335.699, 137 basiEsone 5: 105.348.358–105.348.451, 94 basiEsone 6: 105.356.212–105.356.381, 170 basiEsone 7: 105.358.344–105.358.433, 90 basiEsone 8: 105.361.191–105.361.330, 140 basiEsone 9: 105.362.821–105.363.007, 187 basiEsone 10: 105.364.555–105.364.720, 166 basiEsone 11: 105.365.483–105.365.639, 157 basiEsone 12: 105.366.346–105.366.429, 84 basiEsone 13: 105.374.598–105.374.735, 138 basiEsone 14: 105.383.123–105.383.359, 237 basiEsone 15: 105.385.422–105.385.502, 81 basiEsone 16: 105.389.033–105.397.346, 8314 basi151015165′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 10,5 kb dei 152,7 kb del gene; 1974 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di SLC44A1

1

posizione in SLC44A1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di queste ricade in una regione che le letture corte faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 152,7 kb di SLC44A1, introni compresi, non solo i 10,5 kb di esoni.

Tratti collegati a SLC44A1

L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che SLC44A1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SLC44A1: solute carrier family 44 member 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/slc44a1

Vancouver

Dante Labs. Gene SLC44A1: solute carrier family 44 member 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/slc44a1

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