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Gene

SBNO1

strawberry notch homolog 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
12q24.31
Coordinate
Cromosoma 12: 123.289.109–123.364.847 (GRCh38)
Esoni
32 esoni su 75,7 kb
Proteina
1393 amminoacidi
Noto anche come
MOP3, FLJ10701, FLJ10833, Sno
Trascritto MANE Select
ENST00000602398.3NM_001167856.3
Tipo di locus
Protein-coding
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SBNO1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SBNO1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 12, con una parentesi dove si trova SBNO1. SBNO1 e 21 geni nelle vicinanze sul cromosoma 12, da 122.826.978 a 123.826.977.Cromosoma 1212q24.31p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.33123 Mb123,2 Mb123,4 Mb123,6 Mb123,8 MbCCDC62: 122.774.517–122.827.528, filamento direttoCCDC62HIP1R: 122.834.453–122.862.961, filamento direttoHIP1RVPS37B: 122.865.328–122.896.140, filamento inversoVPS37BABCB9: 122.918.478–122.981.649, filamento inversoABCB9OGFOD2: 122.974.580–122.980.044, filamento direttoOGFOD2ARL6IP4: 122.980.045–122.983.480, filamento direttoARL6IP4PITPNM2: 122.983.480–123.151.666, filamento inversoPITPNM2MPHOSPH9: 123.152.320–123.244.014, filamento inversoMPHOSPH9MTRFR: 123.232.142–123.258.079, filamento direttoMTRFRCDK2AP1: 123.250.112–123.272.334, filamento inversoCDK2AP1SBNO1: 123.289.109–123.364.847, filamento inversoSBNO1KMT5A: 123.384.087–123.409.353, filamento direttoKMT5ARILPL2: 123.409.258–123.436.756, filamento inversoRILPL2SNRNP35: 123.458.078–123.473.154, filamento direttoSNRNP35RILPL1: 123.467.802–123.534.417, filamento inversoRILPL1TMED2: 123.584.514–123.598.582, filamento direttoTMED2DDX55: 123.602.073–123.620.943, filamento direttoDDX55EIF2B1: 123.620.406–123.633.766, filamento inversoEIF2B1GTF2H3: 123.633.739–123.662.604, filamento direttoGTF2H3TCTN2: 123.671.110–123.708.403, filamento direttoTCTN2ATP6V0A2: 123.712.334–123.761.760, filamento direttoATP6V0A2DNAH10: 123.761.878–123.935.720, filamento direttoDNAH10Diagramma di SBNO1: 32 esoni sul filamento inverso del cromosoma 12Esone 32: 123.289.109–123.296.050, 6942 basiEsone 31: 123.297.978–123.298.171, 194 basiEsone 30: 123.302.824–123.302.900, 77 basiEsone 29: 123.304.582–123.304.719, 138 basiEsone 28: 123.309.310–123.309.402, 93 basiEsone 27: 123.309.489–123.309.583, 95 basiEsone 26: 123.309.710–123.309.856, 147 basiEsone 25: 123.311.055–123.311.129, 75 basiEsone 24: 123.313.620–123.313.719, 100 basiEsone 23: 123.315.373–123.315.444, 72 basiEsone 22: 123.315.548–123.315.660, 113 basiEsone 21: 123.317.221–123.317.356, 136 basiEsone 20: 123.319.900–123.320.031, 132 basiEsone 19: 123.320.432–123.320.607, 176 basiEsone 18: 123.320.699–123.320.866, 168 basiEsone 17: 123.321.535–123.321.732, 198 basiEsone 16: 123.323.680–123.323.831, 152 basiEsone 15: 123.325.502–123.325.599, 98 basiEsone 14: 123.326.152–123.326.334, 183 basiEsone 13: 123.327.426–123.327.579, 154 basiEsone 12: 123.327.707–123.327.812, 106 basiEsone 11: 123.327.892–123.328.027, 136 basiEsone 10: 123.328.734–123.328.895, 162 basiEsone 9: 123.330.419–123.330.509, 91 basiEsone 8: 123.331.242–123.331.375, 134 basiEsone 7: 123.334.053–123.334.213, 161 basiEsone 6: 123.336.395–123.336.491, 97 basiEsone 5: 123.340.988–123.341.088, 101 basiEsone 4: 123.345.258–123.345.570, 313 basiEsone 3: 123.348.029–123.348.133, 105 basiEsone 2: 123.350.310–123.350.441, 132 basiEsone 1: 123.364.701–123.364.847, 147 basi323025201510515′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 11,1 kb dei 75,7 kb del gene; 4182 di queste basi codificano la proteina.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SBNO1: strawberry notch homolog 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/sbno1

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Dante Labs. Gene SBNO1: strawberry notch homolog 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/sbno1

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