Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

ZNF444

zinc finger protein 444

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
19q13.43
Koordináták
19. kromoszóma: 56 141 287–56 160 893 (GRCh38)
Exonok
5 exon, összesen 19,6 kb
Fehérje
327 aminosav
Más néven ismert
ZSCAN17, FLJ11137, EZF2
MANE Select transzkriptum
ENST00000337080.8NM_018337.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ZNF444 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A ZNF444 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
19. kromoszóma, a ZNF444 helyét zárójel jelöli. A ZNF444 és környékén 26 gén a 19. kromoszómán, 55 651 090–56 651 089 között.19. kromoszóma19q13.43p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4355,8 Mb56 Mb56,2 Mb56,4 Mb56,6 MbCCDC106: 55 640 967–55 653 161, előre szálCCDC106U2AF2: 55 654 115–55 674 717, előre szálU2AF2EPN1: 55 675 109–55 709 858, előre szálEPN1NLRP9: 55 708 438–55 738 402, fordított szálNLRP9RFPL4A: 55 759 043–55 763 424, előre szálRFPL4ARFPL4AL1: 55 769 118–55 773 420, előre szálRFPL4AL1NLRP11: 55 785 397–55 836 800, fordított szálNLRP11NLRP4: 55 836 540–55 881 855, előre szálNLRP4NLRP13: 55 891 699–55 932 336, fordított szálNLRP13NLRP8: 55 947 832–55 981 158, előre szálNLRP8NLRP5: 55 986 775–56 061 810, előre szálNLRP5ZNF787: 56 087 366–56 121 534, fordított szálZNF787ZNF444: 56 141 287–56 160 893, előre szálZNF444GALP: 56 176 001–56 185 775, előre szálGALPZSCAN5B: 56 189 686–56 197 815, fordított szálZSCAN5BZSCAN5C: 56 202 273–56 209 461, előre szálZSCAN5CZSCAN5A: 56 219 670–56 368 383, fordított szálZSCAN5AEDDM13: 56 272 735–56 310 454, előre szálEDDM13ZNF582: 56 375 840–56 393 606, fordított szálZNF582ZNF583: 56 397 966–56 436 035, előre szálZNF583ZNF667: 56 438 631–56 478 099, fordított szálZNF667ZNF471: 56 507 730–56 530 276, előre szálZNF471ZFP28: 56 538 875–56 557 597, előre szálZFP28ZNF470: 56 567 018–56 588 911, előre szálZNF470ZNF71: 56 595 257–56 626 833, előre szálZNF71: 56 595 302–56 657 247, előre szálSMIM17: 56 643 141–56 657 252, előre szálSMIM17A ZNF444 ábrája: 5 exon a(z) 19. kromoszóma előre szálán1. exon: 56 141 287–56 141 357, 71 bázis2. exon: 56 146 247–56 146 420, 174 bázis3. exon: 56 146 890–56 147 208, 319 bázis4. exon: 56 158 494–56 158 602, 109 bázis5. exon: 56 159 624–56 160 893, 1270 bázis123455′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 19,6 kb-jából 1,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 984 bázis kódolja a fehérjét.

ZNF444 szekvenálása

16Közepes

Mennyire nehéz a ZNF444 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A ZNF444 exonjainak egy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a ZNF444 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések9,3%
  • GC-tartalom66%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). ZNF444 gén: zinc finger protein 444. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/znf444

Vancouver

Dante Labs. ZNF444 gén: zinc finger protein 444 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/znf444

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet