Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

SPDYE1

speedy/RINGO cell cycle regulator family member E1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
7p13
Koordináták
7. kromoszóma: 43 997 897–44 010 124 (GRCh38)
Exonok
9 exon, összesen 12,2 kb
Fehérje
376 aminosav
Más néven ismert
Ringo1, SPDYE
Korábbi jelölések
WBSCR19
MANE Select transzkriptum
ENST00000693451.1NM_001378423.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) SPDYE1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A SPDYE1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
7. kromoszóma, a SPDYE1 helyét zárójel jelöli. A SPDYE1 és környékén 18 gén a 7. kromoszómán, 43 504 011–44 504 010 között.7. kromoszóma7p13p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.343,6 Mb43,8 Mb44 Mb44,2 Mb44,4 MbHECW1: 43 112 629–43 566 001, előre szálHECW1COA1: 43 552 389–43 729 857, fordított szálCOA1STK17A: 43 582 758–43 650 713, előre szálSTK17ABLVRA: 43 758 009–43 808 868, előre szálBLVRAMRPS24: 43 866 556–43 869 893, fordított szálMRPS24URGCP-MRPS24: 43 866 558–43 906 589, fordított szálURGCP-MRPS24URGCP: 43 873 645–43 926 411, fordított szálURGCPUBE2D4: 43 925 799–43 956 136, előre szálUBE2D4SPDYE1: 43 997 897–44 010 124, előre szálSPDYE1DBNL: 44 044 628–44 069 456, előre szálDBNLPGAM2: 44 062 724–44 065 736, fordított szálPGAM2POLM: 44 070 915–44 082 985, fordított szálPOLMAEBP1: 44 104 286–44 114 565, előre szálAEBP1POLD2: 44 114 631–44 124 407, fordított szálPOLD2MYL7: 44 138 857–44 143 179, fordított szálMYL7GCK: 44 143 213–44 198 170, fordított szálGCKYKT6: 44 200 959–44 214 294, előre szálYKT6CAMK2B: 44 209 993–44 334 577, fordított szálCAMK2BNUDCD3: 44 379 119–44 490 919, fordított szálNUDCD3A SPDYE1 ábrája: 9 exon a(z) 7. kromoszóma előre szálán1. exon: 43 997 897–43 997 959, 63 bázis2. exon: 43 999 528–44 000 109, 582 bázis3. exon: 44 001 066–44 001 284, 219 bázis4. exon: 44 002 590–44 002 817, 228 bázis5. exon: 44 003 853–44 003 911, 59 bázis6. exon: 44 005 142–44 005 227, 86 bázis7. exon: 44 007 268–44 007 586, 319 bázis8. exon: 44 007 709–44 007 813, 105 bázis9. exon: 44 008 667–44 010 124, 1458 bázis1234567895′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 12,2 kb-jából 3,1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1131 bázis kódolja a fehérjét.

SPDYE1 szekvenálása

68Nehéz

Mennyire nehéz a SPDYE1 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A SPDYE1 nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok kihagyhatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ami tovább nehezíti: a SPDYE1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség97%
  • Homológia100%
  • Ismétlődések9,9%
  • GC-tartalom22%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). SPDYE1 gén: speedy/RINGO cell cycle regulator family member E1. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/spdye1

Vancouver

Dante Labs. SPDYE1 gén: speedy/RINGO cell cycle regulator family member E1 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/spdye1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet