Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

SMIM11

small integral membrane protein 11

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
21q22.11-q22.12
Koordináták
21. kromoszóma: 34 375 507–34 389 151 (GRCh38)
Exonok
4 exon, összesen 13,6 kb
Fehérje
58 aminosav
Korábbi jelölések
C21orf51, FAM165B, SMIM11A
MANE Select transzkriptum
ENST00000399292.8NM_058182.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) SMIM11 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A SMIM11 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
21. kromoszóma, a SMIM11 helyét zárójel jelöli. A SMIM11 és környékén 14 gén a 21. kromoszómán, 33 882 329–34 882 328 között.21. kromoszóma21q22.11-q22.12p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q21.1q21.2q21.3q22.11q22.12q22.13q22.2q22.334 Mb34,2 Mb34,4 Mb34,6 Mb34,8 Mb: 33 584 687–33 931 607, fordított szálITSN1: 33 642 400–33 899 861, előre szálITSN1ATP5PO: 33 901 027–33 915 853, fordított szálATP5POMRPS6: 34 072 889–34 362 252, előre szálMRPS6: 34 073 509–34 143 037, előre szálSLC5A3: 34 073 509–34 106 260, előre szálSLC5A3KCNE2: 34 180 729–34 371 390, előre szálKCNE2SMIM11: 34 375 507–34 389 151, előre szálSMIM11C21orf140: 34 400 112–34 401 072, fordított szálC21orf140SMIM34: 34 414 494–34 423 951, fordított szálSMIM34KCNE1: 34 446 688–34 512 214, fordított szálKCNE1: 34 511 122–34 614 913, fordított szálRCAN1: 34 513 142–34 615 323, fordított szálRCAN1CLIC6: 34 668 966–34 718 227, előre szálCLIC6RUNX1: 34 787 801–36 004 667, fordított szálRUNX1A SMIM11 ábrája: 4 exon a(z) 21. kromoszóma előre szálán1. exon: 34 375 507–34 375 567, 61 bázis2. exon: 34 379 428–34 379 516, 89 bázis3. exon: 34 385 478–34 385 644, 167 bázis4. exon: 34 388 629–34 389 151, 523 bázis12345′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 13,6 kb-jából 0,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 177 bázis kódolja a fehérjét.

SMIM11 szekvenálása

100Nehéz

Mennyire nehéz a SMIM11 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A SMIM11 nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a SMIM11 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség100%
  • Homológia100%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések6,1%
  • GC-tartalom7,3%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). SMIM11 gén: small integral membrane protein 11. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/smim11

Vancouver

Dante Labs. SMIM11 gén: small integral membrane protein 11 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/smim11

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet