Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

SH2D4B

SH2 domain containing 4B

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
10q23.1
Koordináták
10. kromoszóma: 80 537 902–80 646 560 (GRCh38)
Exonok
8 exon, összesen 108,7 kb
Fehérje
433 aminosav
MANE Select transzkriptum
ENST00000646907.2NM_001388272.1
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) SH2D4B gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A SH2D4B felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
10. kromoszóma, a SH2D4B helyét zárójel jelöli. A SH2D4B és környékén 8 gén a 10. kromoszómán, 80 092 231–81 092 230 között.10. kromoszóma10q23.1p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.380,2 Mb80,4 Mb80,6 Mb80,8 Mb81 MbTMEM254: 80 078 641–80 092 862, előre szálTMEM254PLAC9: 80 131 682–80 147 044, előre szálPLAC9ANXA11: 80 150 889–80 205 713, fordított szálANXA11MAT1A: 80 269 780–80 290 150, fordított szálMAT1ADYDC1: 80 336 105–80 356 760, fordított szálDYDC1DYDC2: 80 344 730–80 369 191, előre szálDYDC2PRXL2A: 80 406 443–80 437 115, előre szálPRXL2ATSPAN14: 80 453 875–80 533 178, előre szálTSPAN14SH2D4B: 80 537 902–80 646 560, előre szálSH2D4BA SH2D4B ábrája: 8 exon a(z) 10. kromoszóma előre szálán1. exon: 80 537 902–80 538 515, 614 bázis2. exon: 80 570 154–80 570 316, 163 bázis3. exon: 80 571 431–80 571 578, 148 bázis4. exon: 80 588 630–80 588 777, 148 bázis5. exon: 80 603 579–80 603 795, 217 bázis6. exon: 80 609 424–80 609 551, 128 bázis7. exon: 80 634 285–80 634 505, 221 bázis8. exon: 80 643 993–80 646 560, 2568 bázis124685′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 108,7 kb-jából 4,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1302 bázis kódolja a fehérjét.

SH2D4B szekvenálása

1Könnyű

Mennyire nehéz a SH2D4B szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A SH2D4B exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a SH2D4B exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések2,6%
  • GC-tartalom5,2%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). SH2D4B gén: SH2 domain containing 4B. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/sh2d4b

Vancouver

Dante Labs. SH2D4B gén: SH2 domain containing 4B [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/sh2d4b

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet