Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

SCUBE2

signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 2

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
11p15.4
Koordináták
11. kromoszóma: 9 019 476–9 091 599 (GRCh38)
Exonok
23 exon, összesen 72,1 kb
Fehérje
1028 aminosav
Más néven ismert
Cegf1, Cegb1, FLJ16792
MANE Select transzkriptum
ENST00000649792.2NM_001367977.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) SCUBE2 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A SCUBE2 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
11. kromoszóma, a SCUBE2 helyét zárójel jelöli. A SCUBE2 és környékén 13 gén a 11. kromoszómán, 8 555 538–9 555 537 között.11. kromoszóma11p15.4p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q258,6 Mb8,8 Mb9 Mb9,2 Mb9,4 MbSTK33: 8 391 864–8 594 292, fordított szálSTK33TRIM66: 8 612 037–8 682 694, fordított szálTRIM66RPL27A: 8 682 732–8 714 759, előre szálRPL27ADENND2B: 8 693 343–8 910 951, fordított szálDENND2BAKIP1: 8 911 108–8 922 406, előre szálAKIP1C11orf16: 8 920 076–8 933 006, fordított szálC11orf16ASCL3: 8 937 578–8 943 016, fordított szálASCL3TMEM9B: 8 946 992–8 965 011, fordított szálTMEM9BNRIP3: 8 965 682–9 005 288, fordított szálNRIP3SCUBE2: 9 019 476–9 091 599, fordított szálSCUBE2DENND5A: 9 138 825–9 265 959, fordított szálDENND5ATMEM41B: 9 280 654–9 314 687, fordított szálTMEM41BIPO7: 9 384 604–9 448 127, előre szálIPO7ZNF143: 9 460 319–9 529 155, előre szálZNF143A SCUBE2 ábrája: 23 exon a(z) 11. kromoszóma fordított szálán23. exon: 9 019 476–9 021 197, 1722 bázis22. exon: 9 021 876–9 021 955, 80 bázis21. exon: 9 025 702–9 025 854, 153 bázis20. exon: 9 027 364–9 027 561, 198 bázis19. exon: 9 029 884–9 030 045, 162 bázis18. exon: 9 030 758–9 030 925, 168 bázis17. exon: 9 033 626–9 033 796, 171 bázis16. exon: 9 047 356–9 047 562, 207 bázis15. exon: 9 047 943–9 048 098, 156 bázis14. exon: 9 050 606–9 050 710, 105 bázis13. exon: 9 052 746–9 052 832, 87 bázis12. exon: 9 053 099–9 053 215, 117 bázis11. exon: 9 053 637–9 053 759, 123 bázis10. exon: 9 055 793–9 055 909, 117 bázis9. exon: 9 059 303–9 059 425, 123 bázis8. exon: 9 060 408–9 060 524, 117 bázis7. exon: 9 065 891–9 065 980, 90 bázis6. exon: 9 066 697–9 066 813, 117 bázis5. exon: 9 069 370–9 069 495, 126 bázis4. exon: 9 074 481–9 074 615, 135 bázis3. exon: 9 079 384–9 079 509, 126 bázis2. exon: 9 089 707–9 089 829, 123 bázis1. exon: 9 091 396–9 091 599, 204 bázis23201510515′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 72,1 kb-jából 4,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3087 bázis kódolja a fehérjét.

SCUBE2 szekvenálása

1Könnyű

Mennyire nehéz a SCUBE2 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A SCUBE2 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a SCUBE2 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések4%
  • GC-tartalom4,3%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). SCUBE2 gén: signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 2. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/scube2

Vancouver

Dante Labs. SCUBE2 gén: signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 2 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/scube2

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet