Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

PKNOX1

PBX/knotted 1 homeobox 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
21q22.3
Koordináták
21. kromoszóma: 42 974 562–43 033 931 (GRCh38)
Exonok
11 exon, összesen 59,4 kb
Fehérje
436 aminosav
Más néven ismert
PREP1
MANE Select transzkriptum
ENST00000291547.10NM_004571.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) PKNOX1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A PKNOX1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
21. kromoszóma, a PKNOX1 helyét zárójel jelöli. A PKNOX1 és környékén 9 gén a 21. kromoszómán, 42 504 247–43 504 246 között.21. kromoszóma21q22.3p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q21.1q21.2q21.3q22.11q22.12q22.13q22.2q22.342,6 Mb42,8 Mb43 Mb43,2 Mb43,4 MbSLC37A1: 42 495 994–42 581 440, előre szálSLC37A1PDE9A: 42 653 584–42 776 512, előre szálPDE9AWDR4: 42 843 013–42 879 583, fordított szálWDR4NDUFV3: 42 879 644–42 913 304, előre szálNDUFV3ERVH48-1: 42 916 803–42 925 630, fordított szálERVH48-1PKNOX1: 42 974 562–43 033 931, előre szálPKNOX1CBS: 43 050 900–43 076 943, fordított szálCBSU2AF1: 43 092 956–43 107 605, fordított szálU2AF1CRYAA: 43 169 008–43 172 810, előre szálCRYAASIK1: 43 414 483–43 427 137, fordított szálSIK1A PKNOX1 ábrája: 11 exon a(z) 21. kromoszóma előre szálán1. exon: 42 974 562–42 974 664, 103 bázis2. exon: 43 004 326–43 004 432, 107 bázis3. exon: 43 007 491–43 007 618, 128 bázis4. exon: 43 010 053–43 010 224, 172 bázis5. exon: 43 013 068–43 013 238, 171 bázis6. exon: 43 016 908–43 017 007, 100 bázis7. exon: 43 018 133–43 018 230, 98 bázis8. exon: 43 021 303–43 021 431, 129 bázis9. exon: 43 024 871–43 024 947, 77 bázis10. exon: 43 028 702–43 028 874, 173 bázis11. exon: 43 029 890–43 033 931, 4042 bázis12345678910115′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 59,4 kb-jából 5,3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1311 bázis kódolja a fehérjét.

PKNOX1 szekvenálása

2Könnyű

Mennyire nehéz a PKNOX1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A PKNOX1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a PKNOX1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések3,9%
  • GC-tartalom6,2%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). PKNOX1 gén: PBX/knotted 1 homeobox 1. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pknox1

Vancouver

Dante Labs. PKNOX1 gén: PBX/knotted 1 homeobox 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pknox1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet