Gén
PDS5B
PDS5 cohesin associated factor B
- HGNC 20418↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000083642↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 23047↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 13q13.1
- Koordináták
- 13. kromoszóma: 32 586 452–32 778 019 (GRCh38)
- Exonok
- 35 exon, összesen 191,6 kb
- Fehérje
- 1447 aminosav
- Más néven ismert
- AS3, KIAA0979, FLJ23236, CG008
- Korábbi jelölések
- APRIN
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000315596.15NM_015032.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pds5b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a PDS5B-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) PDS5B gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.
A PDS5B felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 191,6 kb-jából 7,5 kb-ot tesznek ki; ezek közül 4344 bázis kódolja a fehérjét.
PDS5B szekvenálása
3Alacsony
Mennyire nehéz a PDS5B szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-bólMinden oszlop azt mutatja, hogy PDS5B exonjainak bázisai közül mekkora rész esik az adott típusú nehezen vizsgálható régióba. A pontszám ezeket az egyes régiók rövid olvasatú vizsgálatra gyakorolt hatása szerint súlyozza: 0, ha egyetlen bázis sem esik egyikbe sem, 100, ha minden bázis mindegyikbe beletartozik.
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így ott a hívás hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 35%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 30%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket esetleg nem fednek le. Súly: 15%.5,8%
- GC-tartalom25%-nál kevesebb vagy 65%-nál több G és C bázist tartalmazó ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 10%.19%
- Referencia-lefedettségHiányosságok a közeli referenciaszekvenciában, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez a rövid olvasatokat illeszteni lehetne. Súly: 10%.0%
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). PDS5B gén: PDS5 cohesin associated factor B. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pds5b
Dante Labs. PDS5B gén: PDS5 cohesin associated factor B [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pds5b
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt