Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

NHSL1

NHS like 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
6q24.1
Koordináták
6. kromoszóma: 138 422 043–138 499 494 (GRCh38)
Exonok
8 exon, összesen 77,5 kb
Fehérje
1606 aminosav
Más néven ismert
bA43P8.1, KIAA1357
Korábbi jelölések
C6orf63
MANE Select transzkriptum
ENST00000343505.10NM_001144060.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) NHSL1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A NHSL1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
6. kromoszóma, a NHSL1 helyét zárójel jelöli. A NHSL1 és környékén 8 gén a 6. kromoszómán, 137 960 769–138 960 768 között.6. kromoszóma6q24.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27138 Mb138,2 Mb138,4 Mb138,6 Mb138,8 MbPERP: 138 015 003–138 107 848, fordított szálPERPARFGEF3: 138 161 692–138 344 663, előre szálARFGEF3PBOV1: 138 215 986–138 218 491, fordított szálPBOV1SMIM28: 138 377 905–138 383 486, előre szálSMIM28HEBP2: 138 403 531–138 422 197, előre szálHEBP2NHSL1: 138 422 043–138 499 494, fordított szálNHSL1CCDC28A: 138 773 493–138 809 746, előre szálCCDC28AECT2L: 138 795 911–138 904 711, előre szálECT2LREPS1: 138 902 982–138 988 356, fordított szálREPS1A NHSL1 ábrája: 8 exon a(z) 6. kromoszóma fordított szálán8. exon: 138 422 043–138 424 816, 2774 bázis7. exon: 138 429 711–138 429 843, 133 bázis6. exon: 138 430 393–138 433 680, 3288 bázis5. exon: 138 441 983–138 442 114, 132 bázis4. exon: 138 447 001–138 447 193, 193 bázis3. exon: 138 473 306–138 473 433, 128 bázis2. exon: 138 496 219–138 496 371, 153 bázis1. exon: 138 499 233–138 499 494, 262 bázis876543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 77,5 kb-jából 7,1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 4821 bázis kódolja a fehérjét.

NHSL1 szekvenálása

3Könnyű

Mennyire nehéz a NHSL1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A NHSL1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a NHSL1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések2,9%
  • GC-tartalom11%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). NHSL1 gén: NHS like 1. Lekérve: 2026. október 21., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/nhsl1

Vancouver

Dante Labs. NHSL1 gén: NHS like 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 21.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/nhsl1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet