Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

MPRIP

myosin phosphatase Rho interacting protein

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
17p11.2
Koordináták
17. kromoszóma: 17 042 457–17 192 643 (GRCh38)
Exonok
24 exon, összesen 150,2 kb
Fehérje
2425 aminosav
Más néven ismert
RHOIP3, M-RIP, p116Rip
MANE Select transzkriptum
ENST00000651222.2NM_001364716.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) MPRIP gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A MPRIP felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
17. kromoszóma, a MPRIP helyét zárójel jelöli. A MPRIP és környékén 12 gén a 17. kromoszómán, 16 617 550–17 617 549 között.17. kromoszóma17p11.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.316,8 Mb17 Mb17,2 Mb17,4 Mb17,6 MbZNF624: 16 620 734–16 653 860, fordított szálZNF624CCDC144A: 16 689 537–16 777 974, előre szálCCDC144A: 16 690 261–16 804 453, előre szálTNFRSF13B: 16 929 816–16 972 118, fordított szálTNFRSF13BMPRIP: 17 042 457–17 192 643, előre szálMPRIPPLD6: 17 200 622–17 206 369, fordított szálPLD6: 17 202 649–17 237 185, fordított szálFLCN: 17 212 200–17 237 326, fordított szálFLCNCOPS3: 17 244 686–17 281 311, fordított szálCOPS3NT5M: 17 303 316–17 347 663, előre szálNT5MMED9: 17 476 981–17 494 484, előre szálMED9RASD1: 17 494 193–17 496 402, fordított szálRASD1PEMT: 17 505 559–17 592 105, fordított szálPEMTA MPRIP ábrája: 24 exon a(z) 17. kromoszóma előre szálán1. exon: 17 042 457–17 042 971, 515 bázis2. exon: 17 075 710–17 075 787, 78 bázis3. exon: 17 078 011–17 078 076, 66 bázis4. exon: 17 126 702–17 126 853, 152 bázis5. exon: 17 131 617–17 131 701, 85 bázis6. exon: 17 136 219–17 136 450, 232 bázis7. exon: 17 137 916–17 138 429, 514 bázis8. exon: 17 142 627–17 142 765, 139 bázis9. exon: 17 143 556–17 143 669, 114 bázis10. exon: 17 146 036–17 146 092, 57 bázis11. exon: 17 147 319–17 147 387, 69 bázis12. exon: 17 150 144–17 150 233, 90 bázis13. exon: 17 154 306–17 154 415, 110 bázis14. exon: 17 158 432–17 159 002, 571 bázis15. exon: 17 161 240–17 161 356, 117 bázis16. exon: 17 164 109–17 167 915, 3807 bázis17. exon: 17 171 718–17 171 865, 148 bázis18. exon: 17 172 698–17 172 815, 118 bázis19. exon: 17 173 916–17 174 075, 160 bázis20. exon: 17 175 293–17 175 412, 120 bázis21. exon: 17 176 426–17 176 512, 87 bázis22. exon: 17 177 250–17 177 412, 163 bázis23. exon: 17 180 003–17 180 088, 86 bázis24. exon: 17 184 823–17 192 643, 7821 bázis15101520245′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 150,2 kb-jából 15,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 7278 bázis kódolja a fehérjét.

MPRIP szekvenálása

5Könnyű

Mennyire nehéz a MPRIP szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

Almost all of MPRIP's exons sit where short reads map cleanly.

What adds to it: the share of MPRIP's exons in each kind of hard region

  • Leképezhetőség5,1%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések4,3%
  • GC-tartalom24%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scored

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). MPRIP gén: myosin phosphatase Rho interacting protein. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/mprip

Vancouver

Dante Labs. MPRIP gén: myosin phosphatase Rho interacting protein [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/mprip

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet